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Modélisation moléculaire et docking moléculaire de l'inhibiteur

Qu'est-ce que la modélisation moléculaire par Docking ?
Ce travail qui est axé sur la modélisation moléculaire par docking avec AutoDock, à pour but essentiel d’étudier in silico des interactions de nouveaux inhibiteurs sur les COX-2/5-LOX, cibles enzymatiques impliquées dans les phénomènes de l’inflammation. On a testé la performance du programme AutoDock utilisé dans cette étude.
Quels sont les différents types de Docking moléculaire ?
C’est sans aucun doute la catégorie la plus simple et rapide du docking moléculaire. L’approche la plus utilisée dans le traitement de la flexibilité, considère la cible protéique comme corps rigide tandis que le ligand est flexible. Ce type de docking (semi-flexible) permet d’obtenir des résultats plus précis.
Comment choisir le ligand pour un Docking moléculaire ?
En docking moléculaire, le choix du ligand est une étape très importante. Ce choix doit être pertinent en raison de la spécificité du site actif de la cible évitant de tester inutilement des molécules. Pour un docking moléculaire, le ligand doit être également sous forme 3D.
Qu'est-ce que la modélisation moléculaire ?
Le récepteur La première grande voie d’étude et de conception de molécules bioactives par modélisation moléculaire est celle qui se fonde sur la structure des récepteurs. Cette approche est basée sur l’expl- oitation de la structure moléculaire tridimensionnelle de la protéine cible.

Qu'est-ce que la modélisation moléculaire par Docking ?