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TP 2 Bioinformatique : Recherche des séquences dans les bases de

Qu'est-ce que la bioinformatique des populations ?
Bioinformatique des populations Ex: Modélisation de l’évolution de populations dans des environnements donnés... - Fragments de génomes à un ou plusieurs gènes, un bout de gène, séquence intergénique, ... UniProt + d’autres banques (PDB, RefSeq, FlyBase, brevets, ...)
Qu'est-ce que la bioinformatique des réseaux ?
Bioinformatique des réseaux Intéractions entre gènes gènes, protéines, métabolites... Bioinformatique des populations Ex: Modélisation de l’évolution de populations dans des environnements donnés... - Fragments de génomes à un ou plusieurs gènes, un bout de gène, séquence intergénique, ...
Qu'est-ce que le TP ?
Le but de ce TP a été de comprendre toute les informations que l’on peut récolté à partir d’une séquence de nucléotide ainsi que comprendre l’utilité de tous les logiciel et base de données qui nous ont servis pour cette analyse de séquence.
Comment sont classées les protéines séquencées ?
Toutes les protéines séquencées sont classées dans ces 5 niveaux : 1. Evidence au niveau de la protéine. 2. Evidence au niveau du transcrit. 3. Protéines déduites de l’homologie. 4. Protéines prédites. 5. Protéines incertaines. La majorité des protéines de Swissprot ont un haut niveau de preuves d’existences, compris entre le niveau 1 à 3.

Qu'est-ce que la bioinformatique des populations ?