Disciplines classiques des sciences naturelles, la physique, la chimie ou encore la biologie ont développé une approche interdisciplinaire.
Au sein de ces disciplines, les étudiants ont aussi la possibilité de se spécialiser dans un domaine particulier: épidémiologie, biologie du développement, sciences du climat, etc.
En 1852, le ministre Hippolyte Fortoul introduit la création, à partir de la classe de troisième, d'une série scientifique, en concurrence avec la série littéraire traditionnelle.
Cela est un retour au lycée de 1802, avec ses classes de latin et de mathématiques proposées en concurrence.
Il permet d'accéder, entre autres, à des études universitaires en chimie, en biologie, en médecine, en médecine dentaire, en nutrition, en optométrie, en pharmacie et en physiothérapie.