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Biostatistiques L2Biostatistiques { Licence 2BIO2006LMarc Bailly-BechetUniversite Claude Bernard Lyon I { Francemarc.bailly-bechet@univ-lyon1.fr1marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueTable des matieres1Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatique2Variables aleatoires et lois de probabilite3Statistiques descriptives, estimation et intervalles de conance4Tests de comparaison de moyennes et de proportions5Tests du26ANOVA 17ANOVA 28Analyse bivariee et correlation9Modele et regression lineaire10Decomposition de variance et test de linearite2marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueOrganisation globale du module23de biostatistiques, avec 9 CM et 14 TD de 1h30, en debutde semestre13de bioinformatique, avec 3 CM de 1h30 et 5 TP de 3h00, enn de semestreL'UE etant en CCI, il n'y a aucune seconde session, ni pour lesbiostatistiques, ni pour la bioinformatique.3marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueNotation et examensBiostatistiques (67%) :2 ou 3 contr^oles (CC) au cours du semestre, soit 33% de lanote nale au total.1 examen en n de semestre : 34% de la note nale.Bioinformatique (33%) :1 rapport de TP : 8% de la note nale1 examen de TP sur machine en n de semestre : 25% de lanote nale.Des rattrapages seront organises si besoin en n de semestre pourles eventuelles absencesj ustifees.4marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueComment reussir en stats?En travaillant au moins une heure par semaine sur lemodule, en dehors des cours et TD5marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueComment reussir en stats?En travaillant au moins une heure par semaine sur lemodule, en dehors des cours et TD5marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueComment bien travailler en stats?En assistant aux cours et aux TDEn preparant les exercices de TD chez vousEn interagissant avec les enseignants et les autres etudiantsEn employant des livres de statistiques pour s'entra^ner, a laBU :Probabilites et statistiques (Couty/Debord/Fredon) 570.15COU (Rappels de cours succints et beaucoup d'exercicescorriges)Biostatistique Licence PCEM PCEP (Beauscart), coll.Omniscience 570.15 VALBiostatistique pour les sciences de la vie et de la sante parTriola, Marc M. { Triola, Mario F 570.15 TRI6marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueContactsPour les interactions, plusieurs possibilites :Le forum du cours sur Spiral-ConnectPar emailmarc.bailly-bechet@univ-lyon1.frPar email, avec vos enseignants de TD (voir TOMUSS)De vive voix : Bat.

Mendel, 2emeetage, porte rouge, bureau 17.7marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiquePourquoi faire des statistiques en biologie?Variabilite: U neexp eriencee nb iologied onnera rementun resultat tranche ou parfaitement reproductible.Quantite: L esn ouvelleste chnologiesb iologiquesp ermettentde recueillir des quantites pharamineuses de donnees.8marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatiqueLes statistiques vues de loinPopulation)Echantillonp,,2nindividus tires aleatoirement* +Tests, estimationkn, x,s2Statistique inferentielle(Statistiques descriptives9marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Variables aleatoires et lois de probabiliteTable des matieres1Presentation du cours de biostatistiques et bioinformatique2Variables aleatoires et lois de probabilite3Statistiques descriptives, estimation et intervalles de conance4Tests de comparaison de moyennes et de proportions5Tests du26ANOVA 17ANOVA 28Analyse bivariee et correlation9Modele et regression lineaire10Decomposition de variance et test de linearite10marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Variables aleatoires et lois de probabiliteLoi binomialeLa loi binomiale est la loi de probabilite decrivant lenombredereussites parmi un ensemble de tirages aleatoires et independants.Elle se noteB(n;p) avecnle nombre de tirages etpla probabilitede reussite a chaque tirage.lllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll0102030400.00.10.20.3n=100Nombre de succèsProbabilitélllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllp=0.01p=0.05p=0.1p=0.255102511marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Variables aleatoires et lois de probabiliteLoi de PoissonLa loi de Poisson (de Simeon Denis Poisson, 1781-1840) est la loide probabilite decrivant lenombre d'evenementsaleatoires etindependants arrivant dans le m^eme intervalle de temps oud'espace.

Elle se noteP() avecl'esperance et la variance de laloi.lllllllllllllllllllll051015200.00.10.20.

3) Nombre d'évenementsProbabilitéllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll=1l=2l=5l=101251012marc.bailly-bechet@univ-lyon1.frBiostatistiques L2Biostatistiques L2Variables aleatoires et lois de probabiliteRepresentation graphique d'une variable discrete :diagramme en b^atonsLa distribution de donnees discretes se represente al'aide d'un diagramme en b^atons.

Ici, on s'interesse a unparasite de la ch^ataigne, le balanin (Curculio elephas).Nb. de parasitesxi0 1 2 3 4 5 6 et plusNombre de fruitsni1043 172 78 15 10 7 4ayantxi