La bio-informatique utilise à la fois des outils de calcul et d'évaluation pour collecter et traduire des données biologiques.
Elle comprend la génomique, la transcriptomique et la protéomique, ainsi que les développements génétiques.
La bio-informatique est surtout connue pour le projet du génome humain.
Le marché de la bio-informatique est en plein essor, et la rapidité du développement de la génomique et de la biogénétique est comparable à celui d'Internet.
Pour répondre à ces enjeux, des nombreux bio-informaticiens seront nécessaires dans les années à venir.
Elle s'intéresse au développement de méthodes de parcimonie pour la comparaison de l'ordre des gènes et la reconstruction phylogénétique basée sur les réarrangements génomiques, mais crée aussi des procédures pour l'identification de motifs structurés des molécules biologiques.