Les agents pathogènes les plus connus à ce jour sont les bactéries, les virus, les champignons et les parasites.
Les bactéries pathogènes peuvent vivre aux dépens d'un autre organisme, appelé hôte (devenu leur milieu biologique).
Elles libèrent généralement des toxines pathogènes responsables des symptômes ressentis par l'individu.
Leur transmission peut se faire par contact direct ou par un vecteur.