La bio-informatique a pour but de produire de nouvelles connaissances sur le fonctionnement des cellules des organismes vivants, leur évolution, leur état sain ou pathologique…
Le bio-informaticien peut être salarié d'un groupe pharmaceutique ou d'agrochimie.
Il peut aussi travailler dans un laboratoire d'analyses, dans la fonction publique hospitalière, dans une unité de recherche ou une université… Il n'est pas rare que, sur certains projets, secteur privé et public travaillent ensemble.
La bioinformatique va permettre deux types d'analyses comparatives à partir de données de séquençages : entre cellules cancéreuses et cellules normales d'un organisme, et entre cellules cancéreuses d'un organisme et les cellules cancéreuses d'autres organismes.