D'élimination : pour les boues dont les particules sont trop difficiles à gérer, la seule solution est l'incinération.
Certains autres types de boues sont mis en décharge avec des déchets ménagers.
Tout dépend du traitement qu'elles auront subi et du domaine dont elles proviennent.
Des technologies éprouvées comme la digestion anaérobie, l'hydrolyse thermique, la codigestion et le séchage thermique permettent de convertir les boues en une source d'énergie valorisable, dont l'utilisation varie en fonction du prix de l'énergie dans chaque pays.
physiques (dégrillage, tamisage, décantation, filtration, flottation) physico-chimiques (coagulation/floculation) chimiques (oxydation, échange d'ion sur résine, procédés de neutralisation ou d'acidification)