Bactéries saprophytesde l’environnement Assurent la transformation de l’azote en ammoniaque, la minéralisation des matières organiques Parfois pathogènespour l’homme (Listeria, Legionella, Clostridium)
Les sols présentent généralement une grande diversité de micro-organismes dont certains naturellement présents peuvent être pathogènes pour l’Homme comme les espèces appartenant aux genres Clostridium ( C. perfringens, C. tetani, C. botulinium ), Bacillus ( B. anthracis ), Nocardia ou encore Mycobacterium ( M. tuberculosis ).
Les chercheurs de l’Institut Pasteur ont essayé de comprendre comment une bactérie environnementale inoffensive peut devenir un pathogène humain redouté. Cette maladie humaine représente jusqu’à 5 % des pneumonies communautaires associées à un taux de mortalité élevé (11 % à 33 %), en particulier chez les personnes âgées et immunodéprimées.
Relations hôte bactéries bactéries pathogènes pouvoir pathogène = capacité à provoquer des troubles chez un hôte –pouvoir invasif (capacité à se répandre dans les tissus et à y établir un/des foyers infectieux) : adhérence, enzymes