Les nombreux conflits d'intérêts, les accidents en mer, le vol et la destruction de matériels de pêche qui en ont suivi sont venus s'ajouter aux sérieux problèmes sanitaires et de salubrité sur les quais de débarquement de pêche artisanale qui menacent la qualité des produits et l'agrément à l'exportation.
La pêche illicite, non déclarée et non réglementée et ses répercussions négatives sur les efforts déployés aux niveaux national et régional pour assurer une gestion durable à long terme des pêches, est l'un des principaux problèmes inhérents aux pêches de capture.