Elle joue également un rôle primordial dans leur conception, et notamment dans la galénique qui s'intéresse à la formulation du médicament, à sa forme (gélule, crème…) et à la l'assimilation du principe actif par l'organisme.
La chimie thérapeutique a pour objet de concevoir des composés biologiquement actifs, d'étudier leur métabolisme et d'interpréter leur mode d'action à l'échelle moléculaire, en se fondant notamment sur des relations entre la structure des corps chimiques et leurs propriétés thérapeutiques.
La chimie y joue, à l'évidence, un rôle important au niveau de la responsabilité pharmaceutique industrielle qui nécessite des connaissances approfondies en chimie organique, en chimie analytique, en chimie des matériaux, en chimie minérale ainsi qu'en pharmacie galénique et en génie des procédés.