Par les expériences les plus variées, Louis Pasteur démontrera que les microbes sont partout, dans l'eau, dans l'air, sur les objets, sur la peau… et que certains d'entre eux sont responsables de maladies.
La découverte par Louis Pasteur des microbes dans les années 1870 fait partie des pages célèbres de l'histoire des sciences, et même de l'histoire de France.
Il réunit des groupes extrêmement variés : bactéries ; champignons, plutôt filamenteux, bien que certains soient unicellulaires (les levures) ; algues microscopiques Il appartient pleinement au monde du vivant puisque ce dernier est surtout constitué de microbes.