Les principales applications concernent le traitement automatique de données biologiques produites à haut-débit (Big Data) et plus généralement les questions de modélisation, d'analyse et d'intégration des données dans la plupart des domaines des sciences du vivant.
Elle s'intéresse au développement de méthodes de parcimonie pour la comparaison de l'ordre des gènes et la reconstruction phylogénétique basée sur les réarrangements génomiques, mais crée aussi des procédures pour l'identification de motifs structurés des molécules biologiques.