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La modélisation moléculaire s'invite dans l'industrie

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  • A quoi peut servir la modélisation moléculaire ?

    La modélisation moléculaire est utilisée pour simuler le comportement moléculaire dans des systèmes chimiques ou biologiques (Leach, 1996).
    En conséquence, il s’agit de l’une des principales techniques travaillant avec un large éventail d’applications, telles que la conception de médicaments, les biomatériaux, les matériaux émergents et la spectroscopie.

  • Qu’entend-on par modélisation moléculaire ?

    La modélisation moléculaire décrit la génération, la représentation et/ou la manipulation de la structure 3D de molécules chimiques et biologiques, ainsi que la détermination des propriétés physicochimiques qui peuvent aider à interpréter la relation structure-activité (SAR) des molécules biologiques.

  • Quels sont les différents logiciels utilisés en modélisation moléculaire ?

    Les logiciels concernés sont notamment MarvinSketch (éditeur de molécules 2D/3D très complet) et Jchem, un plugin adossé aux outils Microsoft (Word, Excel, PowerPoint, Outlook).
    MarvinSketch propose beaucoup de formats en import/export et permet également de calculer des propriétés de molécules.

  • Il existe deux types de modèles moléculaires : les modèles éclatés et les modèles compacts.
    Dans le modèle compact, les liaisons entre les atomes ne sont pas représentées.
    Les atomes liés sont accolés les uns aux autres et sont représentés par des sphères tronquées.
L'apport de la modélisation moléculaire dans un domaine comme celui-ci est de pouvoir introduire de façon rigoureuse l'influence de divers facteurs : géométrie des molécules, forces de dispersion et de répulsion, forces électrostatiques intermoléculaires et intramoléculaires, flexibilité de la molécule.

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