Application de la simulation moléculaire pour le calcul des
Quels sont les objectifs de la modélisation moléculaire ?
La modélisation moléculaire consiste à construire des modèles des molécules ou d'ensemble de molécules, dans le but de mieux en comprendre la structure et les autres propriétés physico-chimiques.
Du point de vue du chimiste, une molécule est un assemblage d'atomes liés entre eux par les liaisons chimiques.
Quel est l'avantage d'utiliser un modèle moléculaire ?
L'avantage d'utiliser un modèle moléculaire est : Reconstruire une structure tridimensionnelle de molécules ; Simuler le comportement dynamique des molécules.
Quels sont les différents logiciels utilisés en modélisation moléculaire ?
Les logiciels concernés sont notamment MarvinSketch (éditeur de molécules 2D/3D très complet) et Jchem, un plugin adossé aux outils Microsoft (Word, Excel, PowerPoint, Outlook).
MarvinSketch propose beaucoup de formats en import/export et permet également de calculer des propriétés de molécules.
- La quantité de matière, en mole (symbole : mol), d'une entité dans un échantillon contenant entités est .
On en déduit donc que le nombre d'entités d'un échantillon dont la quantité de matière en entité est (en mol) est . 3 moles d'eau contiennent : = 3 × 6,02 × 1023 = 1,806 × 1024 molécules d'eau H2O.
Enfin, la simulation moléculaire offre une unité dans la représentation des fluides, c'est-à-dire qu'un même groupe d'atomes va pouvoir être représenté de la même manière dans des molécules appartenant à des familles chimiques différentes, et ceci pour calculer des propriétés thermophysiques différentes.