Il s'agit d'assurer une disponibilité élevée des médicaments requis dans le respect des budgets, de disposer d'une documentation conforme à la réglementation locale, et de coordonner les besoins entre plusieurs services hospitaliers impliqués dans la gestion des médicaments.
La gestion d'une pharmacie hospitalière est assurée par un pharmacien qui est assisté, par un ou plusieurs préparateurs en pharmacie ; Chaque agent doit bénéficier d'une fiche de fonction.
Cette fiche constitue un faible apport si elle n'est pas un outil de dialogue entre l'agent, le pharmacien et le directeur.