Une méthode plus coûteuse et plus sophistiquée consiste à utiliser un pH-mètre à électrode.
Le pH indique la quantité d'ions d'hydrogène, c'est-à-dire l'acidité ou la basicité de l'eau.
Le pH n'est pas un polluant, mais une variable chimique de base.
Les analyses physico-chimiques font appel à des techniques d'analyses très variées visant à connaitre les propriétés intrinsèques des molécules ou des atomes, ou encore leur aptitude à réagir avec des réactifs particuliers ou lorsqu'ils sont soumis à des stress définis.
L'estimation de la qualité physico-chimique d'une eau s'effectue par la mesure d'un ensemble de paramètres constituant l'eau.
Des résultats anormaux permettent de mettre en évidence et d'évaluer les niveaux de pollutions.