L’examen microscopique de ces champignons repose principalement sur l’observation de certaines caractéristiques morphologiques telles que le branchement du sporocystophore, le type de sporocyste, la forme, la couleur, la présence ou l’absence d’apophyse et columelle et également la présence ou l’absence des rhizoïdes et des chlamydospores.
Pour l’amateur, devant la multitude d'espèces existantes, il est presque impossible d'identifier avec sûreté un champignon par la seule image couleur rencontrée dans un atlas ou sur un site internet. La première démarche, incontournable, consiste à se familiariser avec les principaux genres et groupes de champignons.
La détermination des champignons implique en premier lieu une reconnaissance des caractères apparents, dits macroscopiques.
La première démarche, incontournable, consiste à se familiariser avec les principaux genres et groupes de champignons. S’agit-il d’un Tricholome, d’un Clitocybe, d’un Hygrophore…etc ? Pour ce faire, des clés simplifiées basées sur des caractéristiques morphologiques appréciables par tous, existent dans la plupart des ouvrages de vulgarisation.