De nombreuses sous-disciplines de l'écologie ont été identifiées.
Nous pourrions évoquer l'écophysiologie, l'autoécologie, la démécologie ou encore la synécologie.
L'écologie est une science biologique dans le sens où elle concerne les êtres vivants, mais elle est également une science holistique.
L'écologie, au sens premier du terme, est une science dont l'objet est l'étude des interactions des êtres vivants (la biodiversité) avec leur environnement et entre eux au sein de cet environnement (l'ensemble étant désigné par le terme « écosystème »).
L'environnement est différent de l'écologie par le simple fait qu'un environnement peut être écologique ou non, l'environnement désignant un écosystème favorable au développement d'une vie, et l'écologie désignant la qualité de la vie de manière à assurer la protection de ces milieux.