L'évolution moléculaire s'appuie en effet une analyse structurelle et fonctionnelle des génomes c´est-à-dire par exemple: l´étude de la taille du génome, l´évolution du nombre de gènes, leur synténie, la multiplication des séquences répétées ou l'évolution du pourcentage en bases GC.
La biologie moléculaire. L'ADN et le code génétique renvoient aux ancêtres partagés par le vivant. Les comparaisons d'ADN montrent à quel point les espèces sont liées. La biogéographie. La distribution mondiale des organismes et les caractéristiques uniques des espèces insulaires reflètent l'évolution et les changements géologiques. Les fossiles.
La médecine, par exemple, relève de la biologie. Mais elle a mis beaucoup de temps à comprendre le corps humain à la lumière du principe de variation-sélection appliqué aux cellules d’un même corps, et même au génome. La biologie moléculaire a eu, quant à elle, beaucoup de mal à se sortir de notions incompatibles avec l’évolution.
L'idée de base de l'évolution biologique est que les populations et les espèces d'organismes varient au fil du temps. Aujourd'hui, quand on pense à l'évolution, on associe souvent ce concept à une personne en particulier : le naturaliste britannique Charles Darwin.