TD N°3: Les acides aminés et les protéines PDF

QCM 21 corrigé disponible. QCM 22 corrigé disponible. QCM 23 corrigé disponible. 6/6. Acides aminés et protéines – Exercices – Devoirs. Licence L1 – PASS

FACULTÉ DES ARTS ET SCIENCES – DÉPARTEMENT DE CHIMIE

Justifiez votre réponse en vous référant spécifiquement au mécanisme. 5. Page 6. CHM 2501 Chimie Biologique. Exercice C2) de 2 acides aminés hydrophiles et 2 ...

Corrigé Fiches dactivités Biologie et physiopathologie humaines 1

Nutriments nécessaires : dioxygène et glucose si exercice modéré et bref. Préciser le devenir des nutriments cités (glucose acides aminés

Biochimie

▫„Exercices et QCM corrigés. 297. Chapitre 26. Régulation des enzymes. 304. „▫1 Métabolisme des acides aminés. 381. „▫3. Les voies d'élimination de l'azote.

3I019 - Examen écrit – 1er section 28 mai 2018 (Corrigé)

28 mai 2018 Les résidus (nucléotides acides aminés) sont superposés de façon à ... Exercice 4 – Détection de motifs : Algorithmes table de hashage

BIOCHIMIE DES PROTEINES

Exercice : L'analyse des acides aminés du gluten donne les résultats suivants : TRP. 168 g/100 g. TYR. 4

chimie organique

C'est une représentation en deux dimensions utilisée notamment pour les oses et les acides aminés. La molécule est construite en forme de croix

Exercices de révision. 3ACC.GAC.TAT.ATA.TAT.CCG.CAC.TAC

Donc mutation non sens la proteine est plus courte ici pas de proteine car Met s'en va et il ne reste que codon stop qui ne donne pas D'acide aminé. c)

M1. Chimie des biomolécules (2021) Cinétique enzymatique

Les exercices marqués d'une étoile “*” seront corrigés en TD en priorité. Il acides aminés histidine et glycine. 9. L'imidazole est un activateur. 10. Il ...

Corrigé type du TD : Acides aminés peptides et protéines Exercice

4-citer deux acides amines possédant chacun 2 carbones asymétriques écrire ensuite les diastéréoismères de l'acide aminé polaire. R : Thréonine et Isoleucine.

PARTIE III (ACIDES AMINES) EXERCICE 9 : On se propose de

Quel acide aminé aura le Rf le plus grand ? Page 5. LES PROTEINES. I- La liaison peptidique –Structure primaire des protéines. II

SERIES DEXERCICES CORRIGES DE BIOCHIMIE STRUCTURALE

Exercice 3. Un polypeptide P composé de 12 acides aminés contient entre autre la lysine et l'aspartate comme seuls acides aminés polaires chargés.

td corriges biochmv 2014-2015.pdf

EXERCICE 2 : Avant de réaliser une manipulation de Biochimie Les structures et les propriétés chimiques des acides aminés sont cruciales pour.

TD N°3: Les acides aminés et les protéines

Exercice 1: Soient les acides aminés suivants: Ala Asp

polycopie biochimie structurale Dr ADIDA H.pdf

les lipides les acides aminés et les protéines. Après chaque chapitre

CHAPITRE 1 - STRUCTURE DES PROTEINES Corrigé succinct des

Corrigé succinct des exercices. 1 Acides aminés – structure chimique`. Dans l'expérience les molécules d'hémoglobines se déplacent suivant leur charge à pH

d) Quel est lacide aminé présentant le Rf le plus important ? Cela

EXERCICE 7: L'électrophorèse sur papier d'un peptide montre qu'il migre vers la cathode à pH 64. Les résultats de l'hydrolyse totale du peptide dans HC1

Corrigé Fiches dactivités Biologie et physiopathologie humaines 1

de l'acide aminé radioactif dans la cellule. Le réticulum endoplasmique est le premier organite radioactif : c'est le lieu de synthèse des pro-.

CORRECTION DES EXERCICES DE GENETIQUE SYNTHESE

Transcription : copie d'un brin d'ADN en une séquence d'ARNm complémentaire. Traduction : assemblage des acides aminés à partir de l'ARNM. Ribosome : organite

1 Année universitaire 2020/2021

Université des Frères Mentouri Constantine1

Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie

2 ème LMD Tronc commun

Module de Biochimie (TD)

TD N°3: Les acides aminés et les protéines

Exercice 1:

Soient les acides aminés suivants: Ala, Asp, Lys.

1- Indiquer la charge nette globale de ces acides aminés à pH 1, à pH 7 et à pH 10.

2- Calculer leur pHi.

Exercice 2:

Soient le mélange d'acides aminés suivant: Ala, Tyr, Glu, Asp, Arg, Lys. - Le mélange est déposé sur une colonne échangeuse d'anion à un certain pH. Indiquer ce pH. - Quel est l'ordre d'élution de ces acides aminés ? Expliquer.

Exercice 3:

On donne les peptides suivants: Lys-Ala-His-Glu-Met, Tyr-Leu-Asp-Cys.

1- Ecrire la formule développée de ces peptides. Donner le nom de chacun d'eux.

2- Etudier la variation de leur charge nette en fonction du pH et déterminer leur pHi.

On utilise les valeurs suivantes pour le pK des différentes fonctions ionisables.

Fonctions Į ȕį Į Ȗ Imidazole Thiol

pK 3 4.5 8.5 10.5 6.5 10

Exercice 4:

On donne un mélange de quatre protéines A, B, C, D.

L'électrophorèse réalisée sur ce mélange à pH =7 a donné le résultat suivant:

C B A D

2 Année universitaire 2020/2021

Le calcul du pHi de ces quatre protéines a donné les valeurs suivantes: pHi = 5.1, pHi = 6.2, pHi = 8, pHi =8.5.

1- Indiquer le pHi correspondant à chaque protéine.

2- Ce mélange est déposé au sommet d'une colonne de résine échangeuse d'anions

éluée par un tampon de pH 7. Parmi les quatre protéines données, quelles sont celles qui s'accrochent la plus fortement à la résine.

3- Comment doit-on faire varier le pH afin de faciliter la libération de ces protéines ?

Justifier votre réponse.

4- Indiquer l'ordre d'élution des protéines. Justifier votre réponse.

Exercice 5:

L'étude de la structure d'un peptide a donné les résultats suivants :

1- Composition en acides aminés : Ala, Arg, Cys, Lys, Ser.

2- L'hydrolyse par la trypsine donne un dipeptide et un tripeptide.

3- L'hydrolyse acide ménagée donne un tripeptide composé de : Ala, Arg, et Cys.

4- L'action du dinitrofluorobenzène (DNFB) sur le tripepetide précédent donne un

dinitrophényl-Alanine (DNP-Ala). Parmi les réponses suivantes, choisir la ou les séquence(s) compatible(s) avec les données ci-dessus: a- Lys-Ala-Arg-Cys-Ser b- Ala-Arg-Cys-Ser-Lys c- Ala-Arg-Cys-Lys-Ser d- Ser-Ala-Arg-Cys-Lys e- Ser-Lys-Ala-Arg-Cys f- Ala-Arg-Ser-Cys-Lys

Exercice 6:

On veut déterminer les poids moléculaires d'une protéine.

1- Sachant que la protéine contient 0.2 % de His et que le PM de His est de 155,

calculer le PM minimum de la protéine.

2- L'ultracentrifugation de la protéine a donné un PM de 390.000. Indiquer le nombre

de molécules d'His rentrant dans la composition de ce peptide.

3 Année universitaire 2020/2021

Résolution des exercices

Exercice 1:

1- Ecrire la formule chimique des acides aminés donnés:

- Ala (Alanine): CH3-CH-COOH - Asp (acide aspartique, aspartate): COOH-CH2-CH-COOH - Lys (Lysine): NH2-(CH2)4-CH-COOH - La charge nette globale des acides aminés est obtenue en appliquant une titration, réalisée par un gradient de pH croissant de pH=1 à pH>10. Sachant que l'ionisation des fonctions acide et amine sont comme suit:

COOH COO-

NH2 NH3+

- Le pH de la demi dissociation (ionisation) de la fonction acide est appelé: pa. C'est le pH au niveau du quel la moitié de la fonction acide est ionisée (50% COO-). - Le pH de la demi dissociation (ionisation) de la fonction amine est appelé: pkb. C'est le pH au niveau du quel la moitié de la fonction amine est ionisée (50% NH3+). pH 1 pH 7 pH 10 Ala Asp Lys +1 +1 +2 0 -1 +1 -1 -2 0

2- Calcul des pHi (pH isoéléctrique)

- PHi Ala = pka +pkb/2 = 6,02. - PHi Asp = pka +pkr/2 = 2,97. - PHi Lys = pkb +pkr/2 = 9,74. NH2 NH2 NH2

4 Année universitaire 2020/2021

Exercice 2:

- Une colonne de résine échangeuse d'anion est une colonne qui fixe les anions (les acides aminés chargés négativement (aa-)).

1- Pour qu'un acide aminé soit un anion, il faut que le pH du milieu soit supérieur à

son pHi (pH>pHi). Par conséquent, le pH de la colonne doit être supérieur à tous les pHi des acides aminés donnés. Le pH de la colonne soit supérieur à 10,76 (pH>

10,76).

2- Pour l'élution, il faut annuler la charge des acides aminés (aa0). C'est-à-dire

atteindre leurs pHi. A chaque fois qu'on atteint le pHi d'un acide aminé, il devient sans charge et sort de la colonne. Dans notre cas, pour l'élution de ces acides aminés, il faut faire un gradient de pH décroissant à partir de pH 11. L'ordre d'élution sera: Arg, Lys,

Ala, Tyr, Glu , Asp.

Exercice 3:

Travail de maison.

Exercice 4:

1- Selon le résultats de l'électrophorèse, la protéine A et D migrent vers la cathode (-).

Se sont des cations dont le pH de l'électrophorèse (pH 7) est inferieur à leurs pHi. pHi A = 8, pHi D = 8,5 (selon la distance de la migration).

- Selon le résultats de l'électrophorèse, la protéine B et C migrent vers l'anode (+). Se

sont des anions dont le pH de l'électrophorèse (pH 7) est supérieur à leurs pHi. pHi B= 6,2, pHi C = 5,1 (selon la distance de la migration).

2- Si le mélange est déposé sur une colonne de résine échangeuse d'anions, seules les

protéines B et C se fixent à la colonne. Tandis que les protéines A et D ne sont pas fixées, elles sortent de la colonne avant l'élution. La protéine C se fixe plus fortement que la protéine B car elle est plus chargée négativement que B.

3- La libération de ces protéines (l'élution) est réalisée par un gradient de pH

décroissant à partir de pH 7.

4- L'ordre d'élution est : B ensuite C.

C B A D

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Exercice 5:

1- Le peptide est constitué de cinq (5) acides aminés qui sont: Ala, Arg, Cys, Lys et

Ser.

2- La trypsine coupe après les acides aminés basiques. Dans notre cas elle coupe après

l'arginine et la lysine.

3- L'hydrolyse acide ménagée donne le tripeptide Ala-Arg-Cys. L'ordre de ces trois

acide aminé est toujours présent.

4- Le DNFB se fixe à la fonction NH2 terminal libre, donc il se fixe sur le premier

acide aminé d'un peptide. L'alanine est le premier acide aminé qui compose notre peptide. La séquence compatible avec les donnés de l'exercice est la séquence b: Ala-Arg-Cys-

Ser-Lys.

Exercice 6:

1- PM protéine = 77500.

2- Nombre de molécules d'His est: 5 molécules.

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[PDF] TD N°3: Les acides aminés et les protéines

1 Année universitaire 2020/2021

Université des Frères Mentouri Constantine1

Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie

2 ème LMD Tronc commun

Module de Biochimie (TD)

Exercice 1:

1- Indiquer la charge nette globale de ces acides aminés à pH 1, à pH 7 et à pH 10.

2- Calculer leur pHi.

Exercice 2:

Exercice 3:

1- Ecrire la formule développée de ces peptides. Donner le nom de chacun d'eux.

2- Etudier la variation de leur charge nette en fonction du pH et déterminer leur pHi.

Fonctions Į ȕį Į Ȗ Imidazole Thiol

Exercice 4:

C B A D

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1- Indiquer le pHi correspondant à chaque protéine.

2- Ce mélange est déposé au sommet d'une colonne de résine échangeuse d'anions

3- Comment doit-on faire varier le pH afin de faciliter la libération de ces protéines ?

Justifier votre réponse.

4- Indiquer l'ordre d'élution des protéines. Justifier votre réponse.

Exercice 5:

1- Composition en acides aminés : Ala, Arg, Cys, Lys, Ser.

2- L'hydrolyse par la trypsine donne un dipeptide et un tripeptide.

3- L'hydrolyse acide ménagée donne un tripeptide composé de : Ala, Arg, et Cys.

4- L'action du dinitrofluorobenzène (DNFB) sur le tripepetide précédent donne un

Exercice 6:

1- Sachant que la protéine contient 0.2 % de His et que le PM de His est de 155,

2- L'ultracentrifugation de la protéine a donné un PM de 390.000. Indiquer le nombre

3 Année universitaire 2020/2021

Résolution des exercices

Exercice 1:

1- Ecrire la formule chimique des acides aminés donnés:

COOH COO-

NH2 NH3+

2- Calcul des pHi (pH isoéléctrique)

4 Année universitaire 2020/2021

Exercice 2:

1- Pour qu'un acide aminé soit un anion, il faut que le pH du milieu soit supérieur à

10,76).

2- Pour l'élution, il faut annuler la charge des acides aminés (aa0). C'est-à-dire

Ala, Tyr, Glu , Asp.

Exercice 3:

Travail de maison.

Exercice 4:

1- Selon le résultats de l'électrophorèse, la protéine A et D migrent vers la cathode (-).

2- Si le mélange est déposé sur une colonne de résine échangeuse d'anions, seules les

3- La libération de ces protéines (l'élution) est réalisée par un gradient de pH

4- L'ordre d'élution est : B ensuite C.

C B A D

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Exercice 5:

1- Le peptide est constitué de cinq (5) acides aminés qui sont: Ala, Arg, Cys, Lys et

2- La trypsine coupe après les acides aminés basiques. Dans notre cas elle coupe après

3- L'hydrolyse acide ménagée donne le tripeptide Ala-Arg-Cys. L'ordre de ces trois

4- Le DNFB se fixe à la fonction NH2 terminal libre, donc il se fixe sur le premier

Ser-Lys.

Exercice 6:

1- PM protéine = 77500.

2- Nombre de molécules d'His est: 5 molécules.