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Chapitre II : Le métabolisme des cellules - LeWebPédagogique
Le métabolisme s’effectue par étapes: une voie métabolique est une succession de réactions biochimiques qui s’enchaînent le produit d'une réaction étant lui-même transformé à son tour et ainsi de suite Chaque réaction nécessite l’intervention d'une macromolécule appelée enzyme qui catalyse la réaction
Métabolisme énergétique - databnffr
Le métabolisme énergétique chez l'homme (1992) Jean-Claude Melchior Daniel Rigaud Cachan : Ed médicales internationales 1992 Données actuelles sur l'exploration du métabolisme énergétique cérébral par la tomographie à positons (1991) Jean-Claude Baron [Courbevoie] : ARTEM [ca 1991] Physiological strategies for gas exchange
Qu'est-ce que le métabolisme ?
Métabolisme et Bioénergétique Le métabolisme est l'ensemble des transformations moléculaires et des transferts d'énergie qui se déroulent de manière ininterrompue dans la cellule ou l'organisme vivant. C'est un processus ordonné, qui fait intervenir des processus de dégradation (catabolisme) et de synthèse (anabolisme) organique.
Quelle est la différence entre métabolite et métabolisme ?
Les métabolites sont les molécules transformées par les réactions enzymatiques afin de produire de l’énergie ou d’autres composés chimiques. Le métabolisme est l’ensemble des réactions chimiques de transformation de matière et d’énergie qui s’accomplissent dans toutes les cellules vivantes.
Quel est le cours complet du métabolisme énergétique ?
Cours complet métabolisme énergétique (L2 SV) Jacob et Marczak 4.03a. métabolisme énergétique principes fondamentaux du métabolisme cellulaire métabolisme et Passer au document Demande à un expert Se connecterS'inscrire Se connecterS'inscrire Accueil Demande à un expertNouveau Ma Librairie Découverte Institutions Université Paris Nanterre
Quelle est la valeur énergétique des métabolites ?
NB : les métabolites n’ont pas la même valeur énergétique : l’oxydation d’un gramme de glucose libère 17 KJ ; celle d’un gramme d’acides gras libère 38 KJ et celle d’un gramme d’acides aminés 17 KJ. Justifier la dénomination ATP à partir de la formule chimique précédente.
Les principales voies du métabolisme
Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/2018TABLE DES MATIERES
1.Devenir et utilisation des nutriments dans l'organisme...........................................................................4
a.Devenir des nutriments après le repas.................................................................................................4
b.Devenir des nutriments lors d'une période de jeûne (de courte durée)...............................................5
2.Notions d'énergétique..............................................................................................................................6
a.Qu'est-ce que l'énergie ?......................................................................................................................6
b.Application avec le Glucose :.............................................................................................................7
c.La molécule énergétique :...................................................................................................................7
3.Les coenzymes........................................................................................................................................9
a.Rappel :...............................................................................................................................................9
b.Rôle des coenzymes comme réactifs de transfert de groupe.............................................................10
II.Le métabolisme des glucides....................................................................................................................13
1.La glycogenèse......................................................................................................................................14
3.La glycolyse..........................................................................................................................................14
a.Devenir des 2 molécules de pyruvate................................................................................................15
b.La chaîne respiratoire........................................................................................................................16
c.Cycle de Krebs..................................................................................................................................18
III.Métabolisme des acides aminés..............................................................................................................20
1.Devenir des protéines alimentaires.......................................................................................................20
2.Catabolisme des acides aminés.............................................................................................................21
a.Désamination oxydative....................................................................................................................21
b.Réaction de transamination...............................................................................................................21
c.Réaction de décarboxylation.............................................................................................................22
d.Couplage désamination-transamination............................................................................................23
1LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME
e.Devenir de l'ammoniac......................................................................................................................23
IV.Le métabolisme des lipides.....................................................................................................................25
2 Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/2018I.Généralités
1.Devenir et utilisation des nutriments dans l'organisme
a.Devenir des nutriments après le repasMUSCLESAutres TissusTISSUS ADIPEUXFOIEtube digestif
Acides aminés
Acides gras
Fru-Gal-Glc
A.A.Acides aminés
(Energie)LipogénèseGlcGlc
Glycogénogénèse
Glycogène
GlcGlc
Triglycérides
Triglycérides
GlcGlycogène
A.A.Protéines
Lipogénèse
E EEFigure 1 : état post-prandial
Les triglycérides :
iLieu de stockage : tissu adipeux selon 3 origines iUne fraction est oxydée dans tous les organesLes acides aminés (A.A.) :
iSource d'énergie pour le foie iPeuvent être transformés en acides gras iParticipation aux synthèses protéiques dans toutes les cellulesLe glucose :
3LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME
iSource d'énergie principale iStockage dans le foie et les muscles iTransformation en triglycérides et stockage dans le tissu adipeuxb.Devenir des nutriments lors d'une période de jeûne (de courte durée).MUSCLESAutres TissusTISSUS ADIPEUX
FOIEsystème nerveux
E EProtéines
A.A.Glycogène
GlcLactate
+PyruvateAc. gras
ETriglycérides
Ac. grasGlycérol
GlcGlycogène
Glc néoglucogénèse néoglucogénèse néoglucogénèse glycogénolyseFigure 2 : état de jeûneProblème essentiel : maintenir la glycémie constante car le système nerveux ne peut utiliser que le
glucose comme source d'énergie. Or le glucose n'est plus absorbé au niveau du tube digestif (période de
jeûne). Les sources de glucose sanguin sont au nombre de 4 : Glucose hépatique et les 3 voies de la
néoglucogenèse. Les Triglycérides sont la première source d"énergie utilisée en cas de jeûne. Si la période
de jeûne est de courte durée, les réserves de glycogène suffisent.Si la période de jeûne est de longue durée, il se produira une protéolyse afin de transformer les acides
aminés en glucose et tous les organes (sauf le cerveau) utiliseront les acides gras comme source d'énergie
afin d'épargner au maximum la glycémie. 4 Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/20182.Notions d'énergétiqueO2
AlimentsENZ. DIGESTIFS
Nutriments
Nutriments
Nutriments
[tube digestif]CELLULE SANGEnzyme
ENERGIE CHIMIQUE
but de la cellule : effectuer un travail cellulaire contiennent de l'énergie chimique potentiellecatalyseur = déclencheur de la réactiona.Qu'est-ce que l'énergie ?C'est la capacité à effectuer un travail. Toutefois, cette énergie existe sous deux formes : énergie cinétique
(énergie de mouvement, eg : la pierre qui tombe) ou énergie potentielle (énergie de position, eg : énergie
contenue dans la pierre).énergie potentielle
énergie spontanée
énergie cinétique
énergie non spontanéeLes deux énergies sont inter-convertibles soit de façon spontanée (c'est la pierre qui tombe et qui passe de
son niveau énergétique haut à son niveau énergétique bas = réaction exergonique), soit de façon non
spontanée (c'est la pierre qui remonte vers son niveau énergétique haut : il faut pour se faire apporter de
l'énergie à la pierre = réaction endergonique).Toutefois, pour libérer l'énergie potentielle et transformer celle-ci en énergie cinétique il faut une énergie
d'activation (eg : la clé que l'on tourne dans la voiture démarre le moteur)énergie d'activation
énergie cinétique
énergie
potentielleFigure 3 : différentes énergies 5LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME
Unités énergétique : kJ (le kilojoule)
Couplage énergétique : Les réactions endergoniques sont couplées à des réactions exergoniques.A + BC + D
E + FG + H
Ep= 1000 kJEp= 800 kJ
Ep= 70 kJEp= 240 kJ
EE200 kJ
30 kJChaleur
Réaction exergonique
Réaction endergoniqueb.Application avec le Glucose :C6H12O6O2OH2CO2
OH2 +66+6++3838ATPADPPi E E E EE E chimique fortechimique faible
30,5 kJ
2815 kJ
Pertes : 2815 - (30,5 x 38) = 1656 kJ
chaleurthermiqueT=37°C chimique forte sucre réducteur oxydationRéaction exergonique
Réaction endergonique
chimique faibleQuantitéd'énergieutilisable
Quantitéd'énergieglobale=1159x100
2815=41,2%
rendementdespertes=1656x1002815=58,8%c.La molécule énergétique :
A = Adénosine (Adénine + Ribose)A = AdénosineT = TriD = Di
P = PhosphateP = Phosphates
6 Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/2018CH NC N NH2 NC CN CH O CH CHCH CH OHOH C H2 OPOH OH OO OH O OH OPOPAdénine
RibosePPP
liaisons à haut potentiel énergétique on peut y stocker 30,5 kJ liaison à faible potentiel énergétiqueon peut y stocker 10,5 kJAdénosine+ Acide phosphorique (Pi)+ 10,5 kJ8 adénosine mono-phosphate+ H2O
AMP+ Pi+ 30,5 kJ8 ADP+ H2O
ADP + Pi+ 30,5 kJ8 ATP+ H2O
CH NC N NH2 NC CN CH O CH CHCH CH OHOH C H2 OPOH OH OO OH O OH OPOP adénine ribose AMP ADP ATP adénosineFigure 4 : adénosine, AMP, ADP, ATPL'ATP (au niveau cellulaire) ne sert pas vraiment à stocker de l'énergie (dans la cellule on stocke l'énergie
sous forme de glycogène) ; par contre c'est une molécule de transfert énergétique : elle peut transporter
l'énergie là où l'on en a besoin.On a besoin de sous pour vivre. Le lieu de stockage est la banque (foie) qui stocke sous forme de lingots
d'or (glycogène). Nous, non ne paye pas en lingots mais en petites pièces (ATP). Nous dépensons en
fonction de nos besoins. Nous avons besoin de ressources pour fournir l'argent à la banque (petit-déjeuner,
déjeuner...). 7LES PRINCIPALES VOIES DU MÉTABOLISME
3.Les coenzymes
Le métabolisme énergétique (eg : réaction d'oxydation cellulaire du glucose :C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O) ne s'effectue pas en une seule étape mais nécessite l'intervention de
nombreuses réactions enzymatiques. Les principales étant des réactions de déshydrogénation et de
décarboxylation. Les deux réactions se font par le biais d'enzymes décarboxylases et déshydrogénases.
Ces enzymes ne peuvent travailler seules. Il leur faut l'aide de coenzymes. Qu'est-ce qu'un coenzyme ? C'est quelque chose qui aide l'enzyme à fonctionner.NAD = Nicotinamide Adénine Dinucléotide
iNicotinamide : synthétisé par vitamine PP ou tryptophane = acide aminé essentiel iAdénine : base azotée iDinucléotide : 2 ribosesH+ H+ H+ H+ CH NC N NH2 NC CN CH O CH CHCH CH OH C H2 OP O OH O OH C H2 NO OH NH2 OHH OPO P OH OOH O CH NC N NH2 NC CN CH OCH CHCH CH OHOH C H2 OP O OH O OH C H2 NO OH NH2 OHH OPO CH NC N NH2 NC CN CH OCH CHCH CH OHOH C H2 OP O OH O OH OPOC H2 NO OH NH2 OH 1 5+2e-, 2NAD = transporteur de protons
NAD = NAD sous
forme oxydéeNADH + H = NAD sous
forme réduiteNADP oxydé
2e-, 2
NADPH, H réduite+a.Rappel :
Equation enzymatique : E+SESE+P
Classes enzymatiques : oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases, ligases
8 Cours de Biologie, Enseignant : P. HARDOUIN , 29/07/2018 Certains enzymes ne travaillent qu'en présence d'une coenzyme.Une coenzyme est une molécule organique spécifique thermostable et de faible poids moléculaire.
L'ensemble enzyme & coenzyme constitue l'holoenzyme (apoenzyme + coenzyme). La coenzyme peutêtre liée de façon covalente ou non à l'apoenzyme. Si la coenzyme est liée de façon covalente on parlera
de groupe prosthétique (eg : hémoglobine le fer est le cofacteur, le coenzyme).Les enzymes nécessitant des coenzymes sont :
iOxydoréductases iTransférases iIsomérases iLigases Les enzymes ne nécessitant pas de coenzymes sont : iHydrolases iLyasesLa coenzyme est souvent envisagée comme cosubstrat de la réaction ou second substrat réactionnel :CH3
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