La diversité des micro-organismes
Sciences de la Vie et de la Terre, classe de 3e – Collège Saint Simon – Jouars Pontchartrain (78) 49 Thème 3 : Corps humain et santé Compétences : Relier le monde microbien hébergé par notre organisme et son fonctionnement La diversité des micro-organismes Doc 1 : Quelques chiffres Groupe de micro-organismes Bactérie Virus
I- La diversité des microorganismes
Certains microorganismes sont pathogènes et causent des maladies plus ou moins graves, d’autres sont utiles à l’Homme * Quels sont les microorganismes qui nous entourent ? * Quelles sont les caractéristiques des microorganismes pathogènes ? I- La diversité des microorganismes : Activité 1 : Où vivent les microorganismes ?
Thème 3 Santé - Chapitre 1 : le microbiote Séance 1
Problème 1: La diversité des micro-organismes est aussi importante qua pour les autres êtres vivants? Problème 2 : Les microorganismes sont-ils toujours dangereux pour l’humain? Consignes : 1 Quelle est la diversité des micro-organismes ? Comparer leurs organisations, leurs tailles, leurs utilités, leurs dangerosités
TP n°2 Durée : 1h La diversité des microorganismes SVT
La diversité des microorganismes Durée : 1h SVT Biologie LES SUPPORTS DE TRAVAIL 1- L’observation de yaourt frais ou ouvert depuis plusieurs jours au microscope 2- Photo présentant l’observation de la moisissure de pain 3- Photo présentant l’animal présent dans l’eau croupie et observation de l’eau croupie
Chapitre 1 - Les micro-organismes - Free
1- La diversité du microbiote Les micro-organismes sont définis comme des êtres vivants microscopiques (invisibles à l’œil nu) et correspondent à de très nombreux groupes : virus, bactéries,
Microorganismes et invertébrés L
fonctions des microorganismes et des invertébrés, cette diversité est déjà en phase d’érosion ou de disparition Les changements dans l’utilisation des terres et la perte d’habitat qui en résulte, l’emploi de pesticides et d’engrais, le changement climatique et les bouleversements qu’il
Chapitre 1: Le monde microbien et sa diversité
- La paralysie des muscles respiratoires provoque la mort Remarques: les effets sur les organes: - La grippe: Le virus se fixe sur les muqueuses du nez, de la gorge et des bronches Il provoque des lésions cellulaires locales, ce qui favorise l’infection bactérienne à l’origine des angines et des bronchites Le tétanos:
ÉPREUVE ÉCRITE DE BIOLOGIE ENS : PARIS LYON CACHAN
photoorganotrophie) devait illustrer encore la diversité métabolique des microorganismes De nombreuses copies ont présenté cette classification mais sans l’illustrer d’exemples précis Comme de nombreux candidats le font remarquer, les microorganismes présentent donc la totalité des types de métabolismes existant dans le vivant
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Master_Mention Biologie Moléculaire et Cellulaire (BMC) 1/2 MU4BM167 DIVERSITE ET FONCTIONS DES MICROORGANISMES Responsable(s)
& courriel(s)Fabien JOUX
Jean-Pierre GRILL
fabien.joux@obs-banyuls.fr jean-pierre.grill@sorbonne-universite.frGestionnaire(s) Maryna KHODJAMIRIAN
Tél. : 01 44 27 88 85
sciences-master-bmc-pedago2@sorbonne- universite.fr Modalités Semestre ECTS Présentiel / Distanciel Effectif maximalS2 6 Présentiel 22
Volume horaire
(H)Cours TD TP / Travail personnel Site
25 10 25 / 6 Campus P&M Curie
Langue
d'enseignement Cours TD TP Supports de cours Français/Anglais Français Français Français FrançaisEvaluations
(/100)CC Ecrit Oral TP
60 40
vers les Orientation parcours (pastille)Prérequis Connaissances générales en microbiologie. Intérêt pour les questions relatives à la
santé humaine/animale et/ou à la microbiologie environnementale/appliquée.Présentation pédagogique de l'UE
Objectifs
Les hommes et les animaux hébergent une grande diversité de microorganismes, le microbiote, qui joue des rôles essentiels dans la digestion, la défense mais aussi dans l'induction de certaines pathologies. Dans l'enǀironnement, la diǀersitĠ des communautés microbiennes participent de manière importante au bon fonctionnement des écosystèmes (eau, sols). La " santé » des écosystèmes et des et des facteurs qui peuvent les affecter, notamment dans le contexte des changements globaux. Des écosystèmes microbiens particuliers peuvent Ġgalement ġtre entretenus par l'homme pour des applications de bioĠpuration, ou se développer à la surface de supports (biofilms) avec des implications sanitaires ou économiques. Les approches d'inǀestigation de ces diffĠrents Ġcosystğmes microbiens font appel à des techniques communes notamment par le séquençage de nouvelle génération. Cette UE propose de présenter ces approches et également de faire le point sur l'Ġtat de nos connaissances des diffĠrents Ġcosystğmes microbiens (microbiotes humain/animal, eau, sols, biofilms), ainsi que les grandes questions de recherche qui leur sont liées. Enfin, différents exemples de valorisation de la diversité microbienne seront illustrés. Une part importante de l'UE est consacrĠe ă des TP et des TD afin de présenter aux Ġtudiants les principaudž outils d'obserǀation, de description de la diǀersitĠ et de Master_Mention Biologie Moléculaire et Cellulaire (BMC) 2/2 mesures de fonctions de microorganismes du microbiote et de l'enǀironnement. Cette UE propose un socle de connaissances très utiles pour tous les étudiants intéressés par les questions relatives à la microbiologie humaine/animale et environnementale avec une orientation recherche ou professionnelle (ex. diagnostic du microbiote et d'Ġchantillons enǀironnementaudž).Thèmes
abordés - Microbiote et santé humaine / animale - Utilisation de probiotiques - Ecosystème microbien des milieux aquatiques et des sols - Ecosystème microbien des biofilms - Ecosystème microbien des systèmes de bioépuration - Résistance et résilience des communautés microbiennes - Etude de la diversité moléculaire des microorganismes - Analyse métagénomique du microbiote et des écosystèmes microbiens - Valorisation des microorganismes de l'enǀironnementCompétences
acquises à l'issue de l'UE (concepts, méthodologie et outils) - Techniques de caractérisation de la diversité microbienne ă l'Ġchelle de communautés - Echantillonnage de terrain (plateforme expérimentale CEREEP-Ecotron Ile de France), extraction ADN de différentes matrices - Métabarcoding (ARISA), PCR quantitative, Cytométrie en flux - Mesures de fonctions microbiennes (respiration, activités exoenzymatiques, activités hydrolytiques) phylogénique et fonctionnelle, annotation de génomes, traitements statistiques - Contacts avec le monde de la recherche appliquée en microbiologieEquipe pédagogique
Sorbonne Université).
Cours, TP, TD : Fabien Joux, Jean-Pierre Grill, Julia Baudart-Lenfant, Raphaël Lami, Julie Leloup,
Marecelino Suzuki.
Intervenants extérieurs : C. Rogel-Gaillard (INRA), K. Romari (Metabolium), S. Ferreira (GenoScreen).