hélice alpha

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Pourquoi hélice alpha ?
Une hélice alpha résulte de la succession d'angles φ de -57^o et d'angles ψ de -47^o.
Cette hélice est droitière; c'est à dire que si vous la saisissiez dans votre main droite, elle tournerait dans le sens de vos doigts en montant dans la direction du pouce (comme la double hélice de l'ADN, soit dit en passant).
Quelle est la différence entre une protéine et un peptide ?
Lorsque ce peptide contient moins de dix acides aminés, il est alors appelé oligopeptide et, quand ce chiffre est supérieur à dix, on parle de polypeptides.
Une ou plusieurs chaînes polypeptidiques constituent la protéine.
Une molécule de protéine contient généralement plus de cinquante acides aminés.
Comment savoir si un acide aminé est polaire ou apolaire ?
les acides aminés apolaires (hydrophobes) tendent à occuper le cœur des protéines, ou offrent des points d'adhérence à leur surface. les acides aminés polaires (hydrophiles) tendent à occuper la surface des protéines.
Ils peuvent être acides, basiques, ou neutres.
L'identification des protéines implique généralement une digestion chimique ou enzymatique des protéines en peptides, lesquels sont ensuite analysés par spectrométrie de masse et identifiés par des méthodes de calcul ou par séquençage.

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Pourquoi hélice alpha ?

Une hélice alpha résulte de la succession d'angles ? de -57^o et d'angles ? de -47^o.
. Cette hélice est droitière; c'est à dire que si vous la saisissiez dans votre main droite, elle tournerait dans le sens de vos doigts en montant dans la direction du pouce (comme la double hélice de l'ADN, soit dit en passant).

Quelle est la structure des protéines ?

Une séquence linéaire d'acides aminés, formant une chaîne polypeptidique, constitue la structure primaire de la protéine.
. Cette structure qui ressemble à un chapelet de « perles » d'acides aminés, est le squelette de la molécule de protéine.

Comment lire le diagramme de Ramachandran ?

Diagramme de Ramachandran d'une protéine.
. Les zones énergétiquement favorables sont représentées par des contours colorés.
. Chaque acide aminé est représenté par un point rouge.
. Les croix correspondent aux acides aminés glycine, qui ne comportent pas de chaînes latérales.

Qu'est-ce qui maintient la structure secondaire des protéines ?

Dans les protéines, la structure secondaire est définie par des arrangements de liaisons hydrogène entre les groupements amide et carbonyle du squelette peptidique (les liaisons hydrogène impliquant les chaînes latérales des acides aminés ne sont pas prises en considération dans la structure secondaire).

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