name, which is used when the enzyme must be identified without ambiguity A Recommended name Most commonly used enzyme names have the suffix "-ase" attached to the substrate of the reaction, for example, glucosidase, urease, sucrase; or to a description of the action performed, for example, lactate dehydrogenase and adenylate cyclase
Enzyme’Catalysis’ Introduction’Enzymes(are(proteins(produced(by(living(cells(that(act(as(catalysts,(which(affect(the( rate(of(a(biochemical(reaction (They(allow
example, it would take us about 50 years to digest a single meal One very important property of enzymes is their specificity Any one enzyme will only catalyze a single class of chemical reactions Some enzymes act on one substrate only; other enzymes act on a family of related molecules Enzymes participate in the reaction that they
The Enzyme List Class 1 — Oxidoreductases Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) LATEX version prepared by Andrew McDonald,
Comments: Specific for malonyl-CoA The enzyme from Pseudomonas ovalis also catalyses the reaction of EC 2 8 3 3 malonate CoA-transferase References: [148,1253] [EC 4 1 1 9 created 1961, deleted 1972, reinstated 1978] [4 1 1 10 Deleted entry aminomalonate decarboxylase Now included with EC 4 1 1 12, aspartate 4-decarboxylase]
For example, enzyme concentration directly relates to reaction rates whereby an increase in enzyme concentration will also increase the rate of the reaction in a linear relationship (as seen in the above graph on the left) However, substrate concentration does not increase the reaction rate continuously if enzyme
ENZYME KINETICS: • The rate of the reaction catalyzed by enzyme E A + B ↔ P is defined as -Δ[A] or -Δ[B] or Δ[P] Δt Δt Δt • A and B changes are negative because the substrates are disappearing • P change is positive because product is being formed • Enzyme activity can be assayed in many ways
1 Pour 5ml of substrate, 0ml of enzyme (no enzyme for negative control), and 5ml of water into test tube A1 2 Seal test tube A1 with a stopper immediately after the enzyme is added 3 Record the reaction rate using the Logger Pro software 4 Repeat steps 1-3 using the new measurements as described in table 1 Table 1 Substrate Enzyme
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NOMENCLATURE ET CLASSIFICATION DES ENZYMES
nom de l’enzyme indique à la fois : •le nom du substrat •la réaction catalysée •Suivis du suffixe « ase » Exemples •Glucose-6 phosphatase : l’enzyme hydrolyse la liaison ester-phosphate en C-6 du glucose ; •Glucokinase: l’enzyme transfère un groupe phosphate de l’ATP au glucose •Pyruvate carboxylase
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Introduction aux outils du génie génétique : les enzymes
exemple la Bal31 (obtenue de cultures d'Aliéromonas espejana) éliminant des nucléotides à partir des 2 extrémités des 2 brins, l'exonucléase 3 (obtenue à partir de cultures d'E coli) catalysant l'hydrolyse séquentielle des nucléotides d'un ADN à partir d'une extrémité 3'
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les enzymes des biocatalyseurs - sorbonne-universitefr
TP n°1 (suite) Activité d’une enzyme sur différents substrats Exemple 1 On appelle substrat la molécule sur laquelle s’exerce l’action catalytique d’une enzyme Proposez et mettez en œuvre un protocole expérimental permettant de voir si l’amylase agit sur d’autres substrats (ex : saccharose)
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NOMENCLATURE DES ENZYMES ET TYPES DE REACTIONS
Par exemple : - glucose-6-phosphate isomérase - Isocitrate lyase - pyruvate carboxylase Lorsque l'enzyme utilise 2 substrats on les désigne tous les deux en indiquant Ø le substrat donneur de radicaux Ø puis le substrat accepteur du radical libéré Ø le radical échangé Ø le type de réaction Ø on ajoute enfin ase Par exempleTaille du fichier : 62KB
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3 Cinétique enzymatique - ESI
enzyme provient de l’association des régions non-polaires du substrat avec ceux du site actif 123 La chymotrypsine: un exemple d’enzyme La chymotrypsine catalyse l’hydrolyse de liens peptidiques; elle coupe les liens peptidiques du côté du carbonyle des résidus aromatiques (Trp, Tyr,Taille du fichier : 445KB
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Université Pierre et Marie Curie - sorbonne-universitefr
12 1 1 Enzyme 13 1 2 Exemple d’enzyme : l’anhydrase carbonique 15 1 3 Substrat 16 1 4 Produit 17 Chapitre 2 : La réaction enzymatique 18 2 1 Réaction enzymatique 19 2 2 Facteurs : enzyme 20 2 3 Facteurs : autres facteurs indispensables 21 2 4 Ligand 22 2 5 Cofacteur 23 2 6 Coenzyme 25 Partie II : Cinétique 27 Chapitre 3 : Effet de la concentration d’enzyme
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Activité 1 : Mise en évidence de la spécificité de
Document 1 : Mode d’action des enzymes Pour catalyser la réaction, l’enzyme doit acides aminés assurant une liai rentrer en contact avec la molécule de substrat pour former un complexe enzyme-substrat Cette liaison avec la molécule de substrat conduit à la libération des produits de la réaction Taille du fichier : 377KB
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ENZYMOLOGIE (2)
d’inactivation est à chaque instant proportionnelle à la quantité d’enzyme encore actif à cet instant La concentration d’enzyme actif [E] après un temps de chauffage t est égale à : − d[E ] dt = k[E ] Il vient après intégration : [E ]=[E 0] e−(kt)
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EXERCICES D’ENZYMOLOGIE
Un enzyme purifié de masse molaire 800 000 g/mol, catalyse la transformation de S (substrat) en P (produit) avec un Km = 10-5 M La solution d' enzyme pur, à la concentration de 150 mg/ml, est capable, si la concentration en S est de 1 x 10-2 M, de catalyser la réaction à une vitesse de 3 x 10-5 M/min
19 jui 2002 · 1 1 Enzyme 13 1 2 Exemple d'enzyme : l'anhydrase carbonique 15 1 3 Substrat 16 1 4 Produit 17 Chapitre 2 : La réaction enzymatique
eebioch
TP n°1 (suite) Activité d'une enzyme sur différents substrats Exemple 1 On appelle substrat la molécule sur laquelle s'exerce l'action catalytique d'une enzyme
enzymes
Un enzyme est une protéine qui agit comme catalyseur biochimique, un L' enzyme accélère la réaction sans modifier l'état Le modèle Michaelis et Menten
toussaint bertrand p
II-Comment expliquer les propriétés catalytiques des enzymes ? Les enzymes interviennent dans la transformation d'un substrat en produit Exemple, l' hydrolyse
Les enzymes
Une enzyme accroit la vitesse d'une réaction chimique, et ne catalyse Ce modèle explique la spécificité de l'enzyme pour son substrat, mais il n'explique
bioch an enzymologie
Enzyme : protéine présentant des propriétés de catalyse spécifique d'une réaction chimique Exemple : glucose-6-Phosphate isomérase : D-glucose-6-P
Structure et m C A canisme daction des enzymes BENSAAD
L'activité enzymatique se mesure par la vitesse de la réaction de le tampon complexe un cation activateur de l'enzyme ; par exemple, Ca2+ des DNAses ou
e
Exemple l'hydrolyse du saccharose : Saccharose + H2O – ? fructosidase ? Glucose + fructose. SUBSTRATS. PRODUITS. Sans enzyme
Par exemple la figure 1 montre une enzyme
La vitesse initiale d'une réaction enzymatique fournit une mesure de exemple : l'enzyme glucose oxydase et ses substrats : le glucose et le dioxygène.
la valeur maximale de l'activité de certaines enzymes peut être très loin du pH physiologique. - par exemple la phosphatase alcaline possède une activité
— Chaque molécule de substrat qui se lie augmente la probabilité de transition de la forme inactive à la forme active. 2. Modèle séquentiel: Koshland (1966):.
Exemple: la ?-galactosidase d'E. Coli qui hydrolyse le lactose est une enzyme de diagnostic médicalutilisée dans la détection des bactéries coliformes
Grâce à l'action de 2 enzymes produites par les cellules de l'abeille l'invertase et la glucose oxydase
Pour comprendre comment les enzymes peuvent être spécifiques nous examinons la et le de la fonction enzymatique. substrat structure de l'enzyme modèle clé-
par exemple le fameux « 7e continent » de plastique. (Figure 3). L'innovation de Carbios. (Figure 1) est basée sur une technologie enzymatique.
Les enzymes sont des protéines douées d'une activité biologique Exemple : la dégradation du glucose substrat fondamental des cellules vivantes
Exemples : la trypsine possède une activité protéolytique et une activité estérasique mais ces réactions font appel à un mécanisme identique (hydrolyse d'une
?Les enzymes sont en général des protéines globulaires ?Le site actif (modèle clé-serrure) est formé d'un site de fixation et d'un site catalytique :
Les enzymes sont des protéines qui catalysent des réactions chimiques La cinétique enzyma- tique a le même objectif que la cinétique chimique : obtenir des
Ces enzymes qui hydrolysent (par addition d'une molécule d'eau) différentes liaisons chimiques Exemples : les phosphatases les peptidases (ex:
électrophorétiques de certaines enzymes à potentiel antimicrobien Ces gnons (les Zygomycètes par exemple) cée comme substrat modèle des IS-13-
Ø d'abord le nom du substrat Ø puis le type de réaction catalysée Ø on ajoute enfin le suffixe ase Par exemple : - glucose-6-phosphate isomérase -
Exemple : La phosphoglucomutase est une enzyme de la glycogénogenèse qui catalyse la réaction: glucose-6-phosphate en glucose-1-phosphate comme toutes les
Par exemple la figure 1 montre une enzyme la pectinase en tout début de catalyse au moment où le substrat le pectate (en jaune) sLest diffusé dans le
— Chaque molécule de substrat qui se lie augmente la probabilité de transition de la forme inactive à la forme active 2 Modèle séquentiel: Koshland (1966):
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Les enzymes sont des protéines douées dune activité biologique