Biochimie Structurale 1 RAPPELS GLUCIDES LIPIDES PROTIDES ACIDES NUCLEIQUES Petites molécules Oses et dérivés d’oses Acides gras et alcools des lipides Acides aminés Bases puriques et pyrimidiques Molécules de taille moyenne Oligosaccharides Hétérosides Glycérides Cérides Stérols Phospholipides Sphingolipides Peptides ( 100 aa)
- Analyse structurale de substrats polysaccharides et oligosaccharides modèles (monocristaux, microfibrilles, granules, fibres, ) - Dégradation et biosynthèse de substrats solides Collaborations déjà actives au sein du GDR :
1 à de concentrations nM En raison de la complexité structurale des HS, le criblage d’oligosaccharides différenciellement sulfatés pour améliorer l'activité de la molécule serait trop difficile En vue d'obtenir une molécule plus spécifique, de plus haute affinité et plus
Fiche 9 Les oligosaccharides 10 type de gel et analyse 179 Fiche 181 La biologie structurale 190
teau Technique d’Analyse et de Microse´quenc¸age des Prote´ines, Institut Pas-teur) on an Applied Biosystems 470 apparatus as described earlier (4) To de-N-glycosylate the protein, 100 g of the protein in 100 lof20mMof NH 4 HCO 3 with 2 5 l of a mixture of 10 SDS and 10 mercaptoethanol was boiled for 10 min After cooling, 100 lof20mMNH
stratégie d’analyse structurale a reposé sur l’obtention par voie chimique d’unités oligosaccharidiques plus faciles à analyser L’hydrolyse acide ménagée conduit à la fragmentation en plusieurs entités oligosaccharidiques Elle permet la libération de 2 acides aldobiuroniques, d’un tri et d’un pentasaccharide acide [4-6
L’analyse élémentaire donne pour formule des oses Cn(H2O)n, avec n compris entre 3 et 7, d’où leur nom d’hydrates de carbone Selon le nombre d’atomes de carbone, on distingue les trioses, où n = 3, les tétroses, où n = 4, les pentoses, où n = 5 et les hexoses, où n = 6 L’analyse fonctionnelle met en évidence la présence
La spectométrie de masse est une méthode d’analyse structurale permettant d’identifier des molécules en fonction de la mesure précise de leur masse Le principe est le déplacement de particules chargées sous l’influence de champs électriques et/ou magnétiques
LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE - univ-lillefr
nous tenterons d’expliquer le cheminement d’une analyse structurale par RMN d’un oligosaccharide-alditol Enfin nous terminerons cette étude par l’explication d’un nouveau type de requête informatique inventée pour une recherche de séquence glycannique plus aisée dans les banques de données Maes E Mise à jour 01/09
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Extraction, détermination structurale et valorisation
Analyse structurale des oligosaccharides 88 i Étude de la masse moléculaire 88 ii Analyse RMN des oligosaccharides 90
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Laboratoire : Le CERMAV
3 - Glycochimie et biotechnologie des oligosaccharides ƒ Synthèse d’oligosaccharides pour des études structure/fonction en glycobiologie : substrats, inhibiteurs, ligands (synthèse organique multi-étapes, caractérisation structurale par RMN à haut champ,
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Programme de la Réunion du Réseau RMN structurale dans le
Interactions entre oligosaccharides en présence de calcium en milieux orientés 14 00 - 14 15 Olivier Lafon (Laboratoire de Chimie Structurale Organique / Orsay) RMN 2D Homo- et Hétéronucléaire Impliquant des Transferts de cohérence carbone-deutérium dédiée à l'analyse en milieu cristal liquide
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Caractérisation des oligo / polysaccharides des fibres
Analyse par Résonance Magnétique Nucléaire Oligo/polysaccharides Analyse par (LC) -MS(-MS) Oligosaccharides 9 Exemples de réalisation 2018/03/29 – Journées Fibres - Paris Caractérisation d’oligosaccharides ( Fructanes) Inuline β(2,1) Levan mixte β(2,1) & β(2,6) Inuline néosérie β(2,1) Vijn & Smeekens, Plant Physiol , 1999 10 Exemple de caractérisations 2018/03