Les biotechnologies microbiennes s'intéressent aux microorganismes d'intérêt (« outils ») exploités dans des procédés de fabrication, de transformation ou dégradation dans un but industriel.
Ils sont avant tout indispensables à l'équilibre de la biosphère en participant aux cycles élémentaires de la nature, mais peuvent s'avérer néfastes.
Ils sont également largement utilisés pour la production de biens ou de services dans le contexte des biotechnologies.
La biotechnologie offre une alternative très prometteuse aux aliments synthétiques et permet d'améliorer la gestion des ressources phytogénétiques.
Conjuguée à d'autres technologies agricoles avancées, elle offre un moyen de contribuer au développement d'une production durable et d'une consommation responsable.