Un examen ou analyse bactériologique permet de rechercher et d'identifier les bactéries en cause dans une infection.
Dépendamment du site de l'infection, plusieurs analyses sont possibles : examen bactériologique des urines ou ECBU. examen bactériologique des selles (voir coproculture)
L'examen cyto-bactériologique d'un produit pathologique débute par l'examen macroscopique, puis l'examen microscopique (cf diagnostic I).
Simultanément cet examen microscopique, est ensemencé le produit pathologique pour l'éventuel isolement d'un ou plusieurs germes.
Le diagnostic repose sur la symptomatologie, les tests sanguins et les cultures, ou l'examen des tissus infectés.
Des médicaments antiviraux peuvent interférer au niveau de la reproduction des virus ou renforcer la réponse immune du patient vis-à-vis de l'infection virale.