Leurs avantages (accroissement de la production, extension des aires de répartition des espèces, réduction de l'emploi de pesticides, synthèse de micronutriments et de produits pharmaceutiques, matériau pour des xénogreffes) et leurs inconvénients (aggravation de la fracture N-S, stimulation de la dépression agricole,
Les risques pour les travailleurs sont de nature biologique et allergique et sont induits par les modifications génétiques qui peuvent créer de nouvelles substances à la toxicité inconnue ou augmentée.