L'examen bactériologique comprend un examen cytologique, un examen microscopique après coloration et un examen mycobactériologique sur culture.
L'examen cytologique consiste à effectuer à l'aide du microscope l'étude des cellules, des globules blancs et des globules rouges présents au sein de l'urètre.
les Monères (ensemble des procaryotes, cellules sans noyau),les Protistes (ensemble des procaryotes unicellulaires avec noyau),les Mycètes (ou champignons, qui regroupent les organismes eucaryotes hétérotrophes et possédant une paroi),les Végétaux (organismes autotrophes avec paroi),
Méningites, prélèvements profonds (bloc), recherche de germes fragiles (anaérobies, mycoplasmes, gonocoque, chlamydia,…)