Elle se distingue de la taxinomie, qui vise quant à elle à définir les taxons, et consiste plutôt en son prolongement. Les deux termes sont souvent confondus, car les taxinomistes s'impliquaient autrefois également dans la systématique.
Selon les principes de la taxinomie, chaque espèce doit appartenir à un genre, qui est une catégorie comprenant au moins une espèce ou, selon les prin-cipes de la classification phylogénétique, un groupe monophylétique d’es-pèces.
En biologie, taxonomie et systématique sont deux disciplines étroitement liées et souvent confondues 36. La systématique étant définie comme l'étude de la diversité et des relations évolutives entre les organismes vivants ou fossiles 10.
Dans la pratique, la distinction entre ces deux finalités tend cependant à s’estomper, au fur et à mesure les pratiques taxonomiques contemporaines incorporent de plus en plus le cadre interprétatif et méthodologique de la systématique évolutive et de la génétique des populations 3, 4.