La classification phylogénétique est destinée à apporter des informations sur le degré de parenté entre les êtres vivants et donc sur l'évolution des espèces.
C'est pourquoi, elle classe les êtres vivants en se fondant sur les caractéristiques qu'ils partagent (vertèbres, plumes, bec, etc.)
Dans un arbre phylogénétique, deux espèces ont un lien de parenté plus fort si elles ont un ancêtre commun plus récent, et moins fort si elles ont un ancêtre commun plus lointain.
Les arbres phylogénétiques peuvent être dessinés selon différents styles similaires.
Sur un arbre phylogénétique, les ancêtres sont représentés par la jonction des branches (2 branches ou plus).
Donc, en gros, plus une branche sera longue plus les séquences correspondantes seront éloignées en terme d'évolution par rapport à son ancêtre et entre elles.