Comment modéliser une molécule ?
Les molécules étant des regroupements d'atomes, elles peuvent être modélisées en associant des modèle atomiques.
Chaque sorte d'atome est représentée par un symbole atomique.
Un symbole atomique est constitué soit d'une lettre majuscule soit d'une lettre majuscule suivie d'une lettre minuscule.Quels sont les objectifs de la modélisation moléculaire ?
La modélisation moléculaire consiste à construire des modèles des molécules ou d'ensemble de molécules, dans le but de mieux en comprendre la structure et les autres propriétés physico-chimiques.
Du point de vue du chimiste, une molécule est un assemblage d'atomes liés entre eux par les liaisons chimiques.Quels sont les différents logiciels utilisés en modélisation moléculaire ?
Les logiciels concernés sont notamment MarvinSketch (éditeur de molécules 2D/3D très complet) et Jchem, un plugin adossé aux outils Microsoft (Word, Excel, PowerPoint, Outlook).
MarvinSketch propose beaucoup de formats en import/export et permet également de calculer des propriétés de molécules.- La modélisation moléculaire utilise des outils de visualisation en 3D et utilise pour cela différents types de représentation, suivant les applications : fil de fer (wire): on ne représente que les liaisons entre les atomes par un trait. bâtons (stick) : on ne représente que les liaisons par une tige.
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