Les complications peuvent être générales (phlébite, embolie pulmonaire, infection générale, compression ou lésion vasculaire ou nerveuse en dehors du site opératoire) ou locales (hématome, désunion cutanée, trouble de cicatrisation, nécrose cutanée, cicatrice disgracieuse ou douloureuse, infection du site opératoire ou
À un stade plus avancé, des complications peuvent survenir comme l'occlusion intestinale ou la perforation tumorale (déchirure de l'intestin par la tumeur) ; elles exigent une prise en charge en urgence.
L'infection de plaie est fréquente lors de la chirurgie du côlon car dans le côlon, des millions de bactéries coexistent et risquent de contaminer l'incision.
Le risque est plus important lors de la chirurgie ouverte que lors de la chirurgie par cœlioscopie.