[PDF] Forçages anthropiques et environnementaux sur la dynamique

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2MiB}+ `2b2`+? /Q+mK2Mib- r?2i?2` i?2v `2 Tm#@

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Tm#HB+b Qm T`BpûbX

/vMKB[m2 BMi2`MMm2HH2 /2b +QKKmMmiûb T?viQ@ 2i xQQTHM+iQMB[m2b +¬iB`2b 2M Jû/Bi2``Mû2

LQ`/@P++B/2MiH2 UhQmHQM- 6`M+2V

hQ +Bi2 i?Bb p2`bBQM,

+QKKmMmiûb T?viQ@ 2i xQQTHM+iQMB[m2b +¬iB`2b 2M Jû/Bi2``Mû2 LQ`/@P++B/2MiH2 UhQmHQM- 6`M+2VX

Université de Toulon

Laboratoire PROcessus de TEchanges dans

Environnement- PROTEE EA.3819

EEcologie et Biologie MArines (EBMA)

E.D. 548-Mer & Sciences

Forçages anthropiques et

environnementaux sur la dynamique interannuelle des communautés phyto- et zooplanctoniques côtières en Méditerranée nord-occidentale (Toulon, France)

Réalisée par Bruno SERRANITO

Directeurs de thèse : Jean-Louis Jamet et Lars Stemmann

Co-encadrante : Dominique Jamet

Devant un Jury composé de :

Dr Fabrice NOT, Chargé de Recherches, Université Pierre et Marie Curie, Roscoff Pr Benoît SAUTOUR, Professeur des Universités, Université de Bordeaux, Arcachon Dr Maria-Grazia MAZZOCCHI, Senior scientist, Station, Station zoologique Anton Dohrn, Naples Dr François CARLOTTI, Directeur de Recherches, Université Aix-Marseille, Marseille

Dr Stéphane GASPARINI, Maître de Conférences, Université Pierre et Marie Curie, Villefranche-sur-mer

Dr Dominique JAMET, Maître de Conférences, Université de Toulon, La Garde

Pr Lars STEMMANN, Professeur des Universités, Université Pierre et Marie Curie, Villefranche-sur-mer

Pr Jean-Louis JAMET, Professeur des Universités, Université de Toulon, La Garde

Rapporteur

Rapporteur

Examinateur

Examinateur

Examinateur

Encadrant

Co-directeur

Directeur

H. Poincarré

H. Wright

H. de Rinel, Kaamelott Livre VI

1 2

Remerciement

Mes remercieme

e

Je tiens également à remercier les membre

qualité s ne pensée à destination de Mme Anaïs Aub aide précieu uei cheminement hasardeux ponctué d compris magnifique petite Lou, mais également mon papy et bien sûr Jacquot qui par son infatigable personnes qui e sur un plan artistique, essentiel à mon épano 3 c moutes dernières modifications

éminences

commencer par les amies du " e, mais sache que a de 4 ans toutes ces e ndiscutablement il y a un petit peu de toi 4

Sommaire

Table des Figures

Liste des tableaux

Chapitre I

Préambule

Le plancton

Généralités

Le Phytoplancton

Le zooplancton

Approche basée sur les traits

Le réseau trophique

Les forçages

Forçages climatiques

La surpêche

Apports en nutriments et eutrophisation

Les conséquences

Les conséquences du réchauffement climatique

Les changements de régimes

La Méditerranée

Généralités et intérêts

Variabilité climatique et impacts anthropiques en Méditerr

Anthropisation en Méditerranée

Les séries temporelles

Le bassin nord

Variabilité à long terme du plancton en Méditerranée nord

Organisation et o

Références

Présentation des sites et données utilisées Chapitre II

Overview des sites "

Caractéristiques morphologiques et contexte anthropique

La circulation

Les paramètres abiotiques

Les nutriments

Les polluants

________________________________

Les variables abiotiques

Le phytoplancton

La sélection des espèces dominant

Le zooplancton

Détail des communautés zooplanctoniques

Stations de comparaison

Caractéristiques des autres st

Les données

Références

5

Variabilité intChapitre III

variabilité des mélanges hivernaux en rade de Toulon sur la période 2005

Matériel et Méthodes

Les données utilisées

Les données biologiques

Les données abiotiques

Analyses des données

Calcul des anomalies mensuelles

Détection des "

Résultats

Résultats des paramètres au sein de la LaB

Les t

La Salinité

Les Précipitations cumulées

Les nutriments

Le micro

Le méso

Anomalies des a

Les paramètres abiotiques

La "

Discussion

Discrimination des périodes 2005

Comparaison avec les épisodes de mélanges verticaux identifiés en mer Ligure Divergences chez les différentes variables analysées

Période 2012

Dynamique du méso

Conclusion

Références

Successions interannue

Partie 1

Matériel et Méthodes

Elaboration des classes de taille

Mise

Résultats

Partitionnement de la série temporelle de la composition phytopl Evolution de la structure en taille des groupes taxonomiques phytoplanctoniques dominants

Les Bacillariophycées

Les Dinophycées

Les autres flagellés

Identification de

Caractéristiques de

Discussion

Partitionnement de la série

Caractérisation des changements

Chez les Bacillariophycées

Chez les Dinophycées

Interprétation des moteurs du changement de la composition phytoplanctonique 6

Partie 2

Matériel et Méthodes

Constitution des groupes fonctionnels

Constitution des groupes fonctionnels zooplanctoniques

Mise en évidence des relations trophiques

Résultats

Les groupes fonctionnels phytoplanctoniques

Les gro

Interaction des groupes phyto

Discussion

Interactions trophiques entre les différents groupes fonctionnels Axe 1 Axe 2 Synthèse des interactions et fonctionnement supposés des printemps

Références

Variabilité des communautés micro

Partie I

communautés planctoniques

Matériel

Comparaison de la diversité

Impact du site sur les communautés micro

Les résultats

Le phytoplancton

Le zooplancton

Discussion

References

anthropique en rade de Toulon, basée sur les

Conclusions et perspectives Chapitre VI

Evolution des communautés micro

de Méditerranée nord

Comment se c

Les principaux vecteurs de changements sur le lo

Quel poids peut

observées

Références

Annexes

7

Table des Figures

Figure I.1

3) (Ignatiades

Figure I.2

La séquence

ion minimale du patch que

Figure I.

Figure I.4

grosses (~105µm3) et petites (<102 3 niveaux tr

Figure -

Figure I.6

phytoplancton stratification thermique, aboutirait à une limitation en nu

de la température conduirait en une concentration du phytoplancton dans les couches de surfaces où la lumière

Doney (20

Figure I.7

int critique (b), ou pouvant présenter

Figure I.8 3) basée sur 10

Figure I.9

Figure I.10

indépendantes, et en vert les stations méditerranéennes issues du réseau SOMLIT. 8

Figure II.1

Figure II.2

Figure II.32 1

Figure II.42

1 (Panneau inférieur) et détails des communautés zooplanctoniques. (Pour les copépodes

ance totale).

Figure II.5

Figure III.1

Figure III.2

STARS de détection de changement dans la moyenne (lign

changement de régime (RSI) à p=0.01, permettant de préciser la date du changement significatif (panneau

Figure III.3

Figure III.4

Figure III.5

significatif (panneau inférieur).

Figure III.6

Figure III.7

Changement de Régime (RSI) à

Figure III.8A

Changement de Régime (RSI) à p=0.01, permettant de préciser la date des changements significatifs.

9

Figure III.103) et ortho

4) dans la "

Figure III.11--) log

Figure III.12: Boîte à mous

Figure III.13--) des printemps (janvier

Figure III.14

Figure III.15: Evolution des anomalies normalisées de la salinité (A), des précipitations cumulées (B) et de la

ntillonnage

Figure III.16

Figure III.17: Récapitulatif des anomalies moyennes des conditions abiotiques et sur la production primaire,

Figure IV.1 . Distribution en taille des diatomées (vert), Dinophycées

3, "2et

3 3, "3-4, "4 5 5 3.

Figure IV.2

1 2 3

Figure IV.3

Les points noirs représente

10

Figure IV.4

représentées

Les points noir

Figure IV.5

Figure IV.6 3.l-) des classes de tailles

Figure IV.7

Figure IV.8

partitionnem-

Figure IV.9

classe taxonomique:

Figure IV.10

otale des différentes classes phytoplanctoniques combinant les différentes classes de taille avec la

Figure IV.11

moyenne (ligne rouge) (panneau changement significatif (panneau inférieur).

Figure IV.12

préciser la date du changement significatif (panneau inférieur).

Figure IV.13

Figure IV.14: Abondances moyennes (cell.l-) des groupes fonctionnels phytoplanctoniques

Figure IV.15

Figure IV.16-) des groupes trophiques zooplanctoniques au cours des printemps

Figure IV.17

cop copépodes, "naup nauplii,cil ciliés , "filt filtreurs) pour les variables réponses et "dino

DINO diat "»

DIATs flag

Figure IV.18

retrouvés au cours des printemps 2005 11 situation pluvieuse, les symboles (+) et ( abondances du groupe désigné.

Figure V.1 -+1)), de "1»

2

Figure V.2 2 1.

F mensuelles des communautés phytoplanctoniques de S2 1, sur la période 2005

Figure V.4

1 2 nées

Figure V.5-2 1

Figure V.6

1 2. Avec les points centraux blancs

représentent les valeurs extrêmes.

Figure V.7-), de la station S1

2

Figure V.82

1 (LiB).

FigureV.9

Figure V.101

2 -

Figure VI.1

(2012). 12

Liste des tableaux

Tableau I.1

Tableau I.2

Tableau I.3

cellulaire calculé des espèces phytoplanctoniques selectionées.

Sun et al. (2003).

Tableau IV.1

Tableau IV.2

Tableau IV.3

deudž niǀeaudž de partitionnement A et B, et de l'indice IndValg

lф0.001. Les couleurs correspondent ă l'appartenance des espğces ă la classe des BacillariophycĠes (ǀert), des

Dinophycées (rouge) et des autres flagellés (bleu).

Tableau IV.4

Tableau IV.5

contribution moyenne de ces derniers.

Tableau V.1

Tableau V.2

d'annĠes liĠes audž changements de communautĠs issue du chapitre IV 2:

ǀalue obtenue pour 10'000 permutations.

Tableau V.3

roupes d'annĠes liĠes audž changements interannuels de communautés(chapitre IV)

2: Pourcentages de la

ǀalue obtenue pour 10'000 permutations.

Chapitre I

13

Introduction Chapitre I

Chapitre I

14

Préambule

Les onnement en ou encore et al., 2012). La valeur économi globale (Costanza et al., 1997). Pourtant impactées par les activités anthropiques, et al., 2008) et al., et al.

écotones impliquentx

activi intérêt espèces benthiques et de larves de po et al., 2005). En plus de son caractère ubiquiste, abondant et al., un bon indicateur de la perturbation du milieu, en relation avec le climat (Hays et al., 2005), le (Garmendia et al., 20et al., 2013). s et al., 2013et al., 2015). Les approches basées elles

Chapitre I

15 (Litchmet al., et al.de ces relations

processus affectant les écosystèmes marins (Béthoux et al., 1999). En particulier la région

Karydis &

bassins, la Méditerranée souffre (Mazzocchi et al., de , sur la période 1980, induits dominant et al., 2011 et al., 2011). anthropique localet al., 201 nécessaire pour conjecturer sur le rôle des diff inscrit relation avec une forte empreinte anthropiqueun sitequotesdbs_dbs24.pdfusesText_30

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