[PDF] Plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers

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Plateformes hospitalières

de génétique moléculaire des cancers : faits marquants et synthèse d"activité 2013

NOVEMBRE 2014RECHERCHE

COLLECTION

Bilans d"activité &d"évaluation

IMPLÉMENTATION DES TESTS

RAS DANS LE CANCER

COLORECTAL

ÉVALUATION DE LA QUALITÉ

DES ANALYSES

LE PROGRAMME AcSé

TABLEAU DE BORD

DE L"ACTIVITÉ 2013

e-cancer.fr PLATEFORMES HOSPITALIÈRES DE GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE DES CANCERS : FAITS MARQUANTS ET SYNTHÈSE D"ACTIVITÉ 20132

Ce document doit être cité comme suit : ©Plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers : faits marquants et synthèse d"activité

2013. Collection Bilans d"activité et d"évaluation, ouvrage collectif édité par l"INCa, Boulogne-Billancourt, novembre 2014.

Il peut être reproduit ou diffusé librement pour un usage personnel et non destiné à des fins commerciales ou pour des courtes

citations. Pour tout autre usage, il convient de demander l"autorisation auprès de l"INCa.

Agence sanitaire et scientifique de référence dédiée au cancer, l"Institut national du cancerstimule, soutient et

met en oeuvre une politique coordonnée de lutte contre la maladie. Créé par la loi de santé publique du 9 août

2004, l"INCa regroupe environ 150 collaborateurs en quatre entités opérationnelles : Recherche et innovation,

Santé publique et soins, Recommandations et qualité de l"expertise, Communication et information.

ONT PARTICIPÉ À L"ÉLABORATION DE CE RAPPORT : ?Étienne LONCHAMP, département biologie, transfert et innovations, direction de la recherche et de l"innovation, INCa

?Frédérique NOWAK, responsable du département biologie, transfert et innovations, direction de la

recherche et de l"innovation, INCa

Depuis 2003, la lutte contre le cancer en France est structurée autour de plans nationaux visant à

mobiliser tous les acteurs autour de la prévention, du dépistage, des soins, de la recherche et de

l"accompagnement du patient et de ses proches. Le Plan cancer 2003-2007 a dressé une première stratégie globale de lutte contre le cancer; le second (2009-2013) a introduit la notion de prise en charge personnalisée. Le 3 e Plan cancer 2014-2019 a pour ambitions de donner à chacun, partout en France, les mêmes chances de guérir et de mettre plus rapidement encore les innovations au service des malades. Il comprend 17 objectifs regroupés autour de quatre grandes priorités de santé: ?Guérir plus de personnes malades ?Préserver la continuité et la qualité de vie ?Investir dans la prévention et la recherche ?Optimiser le pilotage et les organisations Le Plan cancer s"inscrit dans la mise en oeuvre d"une stratégie nationale de santé et de l"Agenda stratégique pour la recherche, le transfert et l"innovation "France-Europe 2020».

Ce guide répond à l"

objectif 6:Conforter l"avance de la France dans la médecine personnalisée Action 6.2 :Conforter l"accès aux tests moléculaires objectif 5:Accélérer l"émergence de l"innovation au bénéfice des patients Action 5.6 :Adapter les essais cliniques aux évolutions conceptuelles induites par l"arrivée des thérapies ciblées Pour en savoir plus et télécharger le Plan cancer: e-cancer.fr

Cancer Plan

2014-201

9

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

3

TABLEDESMATIÈRES

15.3.SUIVIDELA

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

4

LEXIQUE

CHCentrehospitalier

CHUCentrehospitalieruniversitaire

CLCCCentredeluttecontrelecancer

CNAMTSCaisse

EEQÉvaluationexternedelaqualité

HISHybridationinsitu

IHCImmunohistochimie

ITKInhibiteurdetyrosinekinase

LALLeucémieaiguëlymphoblastique

LAMLeucémieaiguëmyéloblastique

LLCLeucémielymphoïdechronique

LMCLeucémiemyéloïdechronique

LNHLymphomenonhodgkinien

OMSOrganisationmondialedelasanté

SMDSyndromemyélodysplasique

SMPSyndromemyéloprolifératif

TMITumeurmyofibroblastiqueinflammatoire

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

5

FAITSMARQUANTS

patients. pour:

Crizotinib.

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

6

INTRODUCTION

bénéficiéestresté testALKen2013; desanalysesdeKRASencours d'année.

PathologieBiomarqueurNombredetests

CancerduseinAmplificationd'HER28924

Cancerdel'estomacAmplificationd'HER2709

Cancercolorectal

MutationsdeKRAS19347

MutationsdeNRAS3330

GIST

MutationsdeKIT1105

MutationsdePDGFRA1005

Cancerdupoumon

Mutationsd'EGFR23336

Translocationd'ALK18861

MélanomeMutationdeBRAFV6005026

Leucémies

DétectiondeBCRͲABL6750

Mutationsd'ABL861

TOTAL89254

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

7

Colmar

Reims Nancy

StrasbourgLille

Dijon

Montpellier

GrenobleBesanÁon

StmPEtienne

LyonRouen

NantesCaen

Limoges

Poitiers

Marseille

Bordeaux

Clermontl

Ferrandêngers

NiceRennes

Brest

Toulouse

VersaillesêPlHP

IGR Tours

êmiens

OrlÈansMulhouse

NÓmesCurie

LaPRÈunion

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

8

IMPLÉMENTATIONDESTESTSRASDANSLECANCER

COLORECTAL

1. INTRODUCTION

1 tyrosinekinaseantiͲEGFR 2

KRASaété

àune

3 desgènesRAS.Enpratique,larecherche etNRASestdésormaisobligatoire. juilletetdécembre2013.

2. DYNAMIQUEDEMISEENPLACEDESNOUVEAUXTESTS

delamodificationd'AMMdupanitumumaben mars2014.Lestestsimplémentésle deréalisercestestsenmars2014. P p q r P

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

9

3. TAUXDEMUTATIONS

000patients

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

10

ÉVALUATIONDELAQUALITÉDESANALYSES

pertedechance lecadrede majeurpourlespatients. deparlaloiportantréformedelabiologie apermis,en coordonnerles cestestsd'yparticiper.

1. CAMPAGNESDECONTRÔLEQUALITÉDANSLECANCERDU

POUMONETLECANCERCOLORECTAL

placéessouslasupervisiond'un

Lescampagnesd'EEQ

1.1. Protocole

1.1.1. Préparation et validation des échantillons

ciblé.

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

EGFRdanslecancerdupoumontandisquedans

année.

1.1.2. Anonymat des laboratoires participants

1.1.3. Transmission des résultats

maximalde4 suivantes:

Unecopiescannée

pourl'estimationdelacellularité; o Lepourcentagedecellulestumoralesdanschaqueéchantillon; o Lesrésultatsdugénotypage; o Laquantitéd'ADNextraite (donnéefacultative); o Desdonnéescomplémentairessurl'organisationdeslaboratoiresparticipants(taille

1.1.4. Critères de notation des résultats de génotypage

qualitéenbiologiemoléculaire 4 comme

1.2. Résultats

1.2.1. Résultat du génotypage dans le cancer du poumon

19/20et7une

P s P

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

12 En2012,leserreursdenomenclaturesurlerendudesdélétions/insertionsdansl'exon19d'EGFR

chargedes patients.

3,3%.Lamajoritéde

5

Nombre

échantillon

Erreurs

génotype

Erreurs

nomencl.

Nombre

échantillon

Erreurs

génotype

Erreurs

nomencl.

Nonmuté510410

Mutex180002120

Mutex1941/208

Mutex21121230

1.2.2. Résultat du génotypage dans le cancer colorectal

etsontrépartiescommesuit:2 cesdeux testés,

NOMBRE

échantillon

Erreurs

génotype

Erreurs

nomencl.

NOMBRE

échantillon

Erreurs

génotype

Erreurs

nomencl.

Nonmuté300600

muté730434

1.2.3. Comptes rendus d'analyses

P t P

BILANSD'ACTIVITÉETD'ÉVALUATION

13laqualité

6 points. est71/100en2012etde74/100en moyende71/100en2012etde73/100en2013. premièrecampagne en2012).Ce surquotesdbs_dbs32.pdfusesText_38

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