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Mémoire

de recherche / mars 2021

Diplôme de conservateur de bibliothèque

Métadonnées pour la science ouverte :

rôle et action des bibliothèques et des professionnels de linformation scientifique et technique

Vincent Richard

Sous la direction de David Aymonin

Directeur de lAgence bibliographique de lenseignement supérieur (Abes) - 3 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

Remerciements

Je remercie dabord David Aymonin pour sa disponibilité et ses conseils avisés tout au long de la préparation de ce mémoire. Je remercie ensuite les professionnels avec qui je me suis entretenu et qui mont fait découvrir leurs méthodes de travail, les outils quils utilisent ou les projets quils pilotent : Nicolas Alarcon (SCD de luniversité de La Réunion), Luc Bellier et Cédric Mercier (SCD de luniversité Paris-Saclay), Éric Jeangirard et Emmanuel Weisenburger (ministère de lEnseignement supérieur, de la Recherche et de lInnovation), Frédérique Joannic-Seta (département des Métadonnées de la BnF), Yann Nicolas (Abes) et Thomas

Parisot (Cairn).

Je remercie également Lou Delaveau et Louis Tisserand, de la promotion DCB 29, pour les retours dexpérience quils ont pris le temps de me présenter. - 4 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 Résumé : À lheure de la science ouverte et du web sémantique, les professionnels de linformation scientifique et technique font face à de nombreux défis dans la gestion des métadonnées des productions académiques, qui constituent le socle de la recherche dinformation scientifique et de laccès aux publications au niveau mondial : traitement

des données des éditeurs, archives ouvertes, édition en libre accès, gestion et politique

des registres didentifiants, bases de données de publications, devenir des bases de citations, enjeu de la création dun index mondial ouvert des publications, avancée en

matière de graphes de données liées... Nous en présentons les enjeux stratégiques,

institutionnels et techniques. Nous tentons également didentifier les évolutions en cours et souhaitables en termes de compétences, doutils technologiques et de gouvernance, et

de définir le rôle que peuvent jouer les bibliothèques pour renforcer la qualité et

louverture des métadonnées. Descripteurs (concepts Rameau) : Métadonnées Bibliothèques, Web sémantique, Digital Object Identifiers, Normes, Bases de données, Édition en libre accès, Bibliothèques universitaires, Information scientifique, Sciences Documentation,

Langages documentaires

Abstract : In the era of open science and semantic web, information science professionals face many challenges in the management of research output metadata, which are the cornerstone of scientific information search and of access to scientific publications at a global level: publishers data wrangling, open archives, open access publishing, strategy and management of identifier registries, academic databases, future of citation databases, challenge of creating a global open index of publications, linked data graph We present the strategical, institutional and technical issues of these challenges, we try to identify current and desirable evolutions in terms of skills, technological tools and governance, and to define the role that libraries may play to reinforce the quality and openness of metadata. Keywords (LCSH) : Library metadata, Semantic web, Digital Object Identifiers, Standards, Databases, Open access publishing, Academic libraries, Communication in science, Scientific literature, Subject headings - 5 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 Cette création est mise à disposition selon le Contrat : " Paternité-Pas dUtilisation Commerciale-Pas de Modification 4.0 France » disponible en ligne http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.frou par courrier postal à Creative Commons, 171 Second Street, Suite 300, San Francisco,

California 94105, USA.

- 6 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

Sommaire

SIGLES ET ABRÉVIATIONS .......................................................................... 8

INTRODUCTION ............................................................................................ 13

PARTIE A : LES MÉTADONNÉES DES RESSOURCES SCIENTIFIQUES

ET LEUR ÉCOSYSTÈME .............................................................................. 16

Chapitre 1 : un écosystème complexe .................................................. 16 Des métadonnées diverses .................................................................. 16 Des acteurs et enjeux multiples dans un flux de métadonnées .............. 17 Focus : les métadonnées de ressources électroniques ......................... 20 Les principes Fair : quatre piliers pour une bonne gestion des

métadonnées .............................................................................................. 21

standard ..................................................................................................... 23

..................................................................................... 27 Chapitre 2 : gouvernance de la science ouverte et des métadonnées de

la recherche .................................................................................................. 28

En France t un

.................................................................................. 28 .. 33 ...................................................................... 34 Un écosystème international dynamique, dans lequel la France est

encore peu impliquée.................................................................................. 40

Vers une base de données ouverte et mondiale des publications

scientifiques ? ............................................................................................ 43

..................................................................................... 49 PARTIE B : LA GESTION DES MÉTADONNÉES DANS LES ..................................................................... 51

Chapitre 3 ............................. 51

Identifiants pérennes et interopérabilité sur le web sémantique .......... 51 ? ............................................ 53

Identifiants et référentiels .................................................................. 54

Quelles actions sont envisagées en France pour d

identifiants et référentiels ? ........................................................................ 55

..................................................................................... 61 Chapitre 4 : métadonnées et " inside-out collection » ......................... 62 Quelle gestion des métadonnées en archives ouvertes ? ...................... 62 Quelles métadonnées pour les publications scientifiques en accès

ouvert ? ...................................................................................................... 68

- 7 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 ..................................................................................... 71 Chapitre 5 : les traitements automatisés de données au service de la

qualité .......................................................................................................... 72

La curation des métadonnées des éditeurs .......................................... 72

Le travail sur l

......................................................................................................... 76

Bilan ................................................................................................. 88

CONCLUSION ................................................................................................ 89

ANNEXE .......................................................................................................... 93

BIBLIOGRAPHIE .......................................................................................... 108

TABLE DES ILLUSTRATIONS .................................................................... 121

TABLE DES MATIÈRES ............................................................................... 122

- 8 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

Sigles et abréviations

Abes : Agence bibliographique de lenseignement supérieur ABF : Association des bibliothécaires de France ADBU : Association française des directeurs et personnels de direction des bibliothèques universitaires et de la documentation

AMI : appel à manifestation dintérêt

ANR : Agence nationale de la recherche

Ansi : American National Standards Institute

API : Application Programming Interface

APC : Article Processing Charges (frais de traitement des articles)

ARK : Archival Resource Key

Auréhal : Accès unifié aux référentiels HAL

Bacon : Base de connaissance nationale

BASE : Bielefeld Academic Search Engine

Bibframe : Bibliographic Framework Initiative

Bibo : Bibliographic Ontology

BIS : Bibliothèque interuniversitaire de la Sorbonne

BnF : Bibliothèque nationale de France

BSO : Baromètre de la science ouverte

Bulac : Bibliothèque universitaire des langues et civilisations

BU : bibliothèque universitaire

Calames : Catalogue en ligne des archives et des manuscrits de lenseignement supérieur CAPSH : Comité pour laccessibilité aux publications en sciences et humanités Casrai : Consortia Advancing Standards in Research Administration Information

CBU : contrôle bibliographique universel

CC : Creative Commons (licences)

CCFR : Catalogue collectif de France

CCSD : Centre pour la communication scientifique directe

CHU : centre hospitalier universitaire

Cieps : Centre international denregistrement des publications en série

Cito : Citation Typing Ontology

CMS : Content Management System (système de gestion de contenu) CNRS : Centre national de la recherche scientifique Coci : OpenCitations Index of Crossref open DOI-to-DOI citations Comue : communautés duniversités et établissements - 9 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

Core : Connecting Repositories

CoSO : Comité pour la science ouverte

CRediT : Contributor Roles Taxonomy

CRIS : Current Research Information Systems

Croci : Crowdsourced Open Citations Index

DCMI : Dublin Core Metadata Terms

DOAJ : Directory of Open Access Journals

Doranum : Données de la recherche apprentissage numérique

DOI : Digital Object Identifier

EAD : Encoded Archival Description

EHESS : École des hautes études en sciences sociales eISSN : Electronic International Standard Serial Number

EOSC : European Open Science Cloud

EPST : Établissement public à caractère scientifique et technologique

ESR : enseignement supérieur et recherche

Fair : Facile à trouver, Accessible, Interopérable et Réutilisable (Findable,

Accessible, Interoperable, Reusable)

fMeSH : version française de Medical Subject Headings

FNSO : Fonds national pour la science ouverte

Foaf : Friend of a friend (ontologie)

Frantiq : Fédération et ressources sur lAntiquité FRBR : Functional Requirements for Bibliographic Records (Fonctionnalités requises des notices bibliographiques)

GOKb : Global Open Knowledgebase

Grid : Global Research Identifier Database (base de données mondiale des identifiants de la recherche)

Grobid : Generation of Bibliographic Data

H2020 : Horizon 2020 (programme européen pour la recherche et le développement pour la période 2014-2020) HAL : Hyper articles en ligne (archive ouverte pluridisciplinaire nationale française)

I4OA : Initiative for Open Abstracts

I4OC : Initiative for Open Citations

IdHAL : identifiant auteur de larchive ouverte HAL IdRef : Identifiants et référentiels pour lenseignement supérieur et la recherche Ifla : International Federation of Library Associations and Institutions (Fédération internationale des associations et institutions de bibliothèques) Ifla-LRM : IFLA Library Reference Model (modèle de référence IFLA pour les bibliothèques)

INA : Institut national de laudiovisuel

- 10 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 Inist : Institut de linformation scientifique et technique Inrae : Institut national de recherche pour lagriculture, lalimentation et lenvironnement Insee : Institut national de la statistique et des études économiques ISBD : International Standard Bibliographic Description

ISBN : International Standard Book Number

Isni : International Standard Name Identifier

ISO : International Organization for Standardization

ISSN : International Standard Serial Number

IST : information scientifique et technique

Jisc : originellement Joint Information Systems Committee

Json : JavaScript Object Notation

Json-LD : JavaScript Object Notation for Linked Data Jats : Journal Article Tag Suite (standard de description bibliographique)

KBart : Knowledge bases and related tools

LCSH : Library of Congress Subject Headings

Liber : Ligue des bibliothèques européennes de recherche

LillOA : Lille Open Access

Lirmm : Laboratoire d'informatique, de robotique et de microélectronique de

Montpellier

LOD : Linked Open Data (données ouvertes liées)

MAA : manuscrit auteur accepté

Mads : Metadata Authority Description Schema

Marc : Machine-Readable Cataloging

MeSH : Medical Subject Headings

Mesri : ministère de lEnseignement supérieur, de la Recherche et de lInnovation Mets : Metadata Encoding and Transmission Standard

MNHN : Muséum national dhistoire naturelle

Mods : Metadata Object Description Schema

NIH : National Institutes of Health (États-Unis) Niso : National Information Standards Organization (États-Unis) NLM : National Library of Medicine (États-Unis) NLP : Natural Language Processing (traitement automatique des langues)

OA : Open Access

OS : Open Science

OAI-PMH : Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting

Oatao : Open Archive Toulouse Archive Ouverte

OCI : OpenCitations Identifier

- 11 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 OCLC : Online Computer Library Center (originellement Ohio College Library

Center)

ODC-BY : Open Data Commons Attribution License

Onix : Online Information eXchange

Onix-PL : ONIX for Publications Licenses

OpenDOAR : Directory of Open Access Repositories

Operas : Open Scholarly Communication in the European Research Area for Social

Sciences and Humanities

Orcid : Open Researcher and Contributor ID (identifiant ouvert pour chercheur et contributeur) Ortolang : Outils et ressources pour un traitement optimisé de la langue

OWL : Web Ontology Language

Pactols

lieux et sujets (thésaurus) Panist : Plateforme d'archivage national de l'information scientifique et technique

PNSO : Plan national pour la science ouverte

Premis : Preservation Metadata Implementation Strategies Rameau : Répertoire dautorité matière encyclopédique et alphabétique unifié RDA : Ressources : description et accès (Resource Description and Access)

RDF : Resource Description Framework

RDFa : Resource Description Framework in Attributes

RDFS : Resource Description Framework Schema

Référens III : Référentiel des emplois-types de la recherche et de lenseignement

Supérieur III

Reiso : Réseau dexperts internationaux de la science ouverte

Repec : Research Papers in Economics

RNSR : Répertoire national des structures de recherche ROR : Research Organization Registry (registre des organisations de recherche) Sampra : Software for Analysis and Management of Publications & Research

Assessment

Scoss : Global Sustainability Coalition for Open Science Services

SHS : sciences humaines et sociales

SIGB : système intégré de gestion de bibliothèque Sirene : Système informatique pour le répertoire des entreprises et des

établissements

Siret : Système informatique pour le répertoire des entreprises sur le territoire

Skos : Simple Knowledge Organization System

Sparc Europe : Scholarly Publishing and Academic Resources Coalition (Coalition de lédition savante et des ressources académiques)

Sparql : SPARQL Protocol and RDF Query Language

- 12 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

SRU : Search/Retrieve via URL

STM : Science, technologies et médecine (ou Scientifique, technique et médical)

Sudoc : Système universitaire de documentation

Sudoc-PS : Système universitaire de documentation-Publications en série Sword : Simple Web-service Offering Repository Deposit

TEI : Text Encoding Initiative

TGIR : très grande infrastructure de recherche

Unesco : United Nations Educational, Scientific and Cultural Organization

URI : Uniform Resource Identifier

UTF-8 : Universal Character Set Transformation Format - 8 bits UVSQ : université de Versailles-Saint-Quentin-en-Yvelines

Viaf : Virtual International Authority File

W3C : World Wide Web Consortium

WoS : Web of Science

XML : Extensible Markup Language

XSLT : eXtensible Stylesheet Language Transformations

Introduction

- 13 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 1 2 3 4 5

1 " L'information secondaire du document primaire : Format Marc ou SGML », Catherine Lupovici, : Bulletin d'informations de

l'ABF, n° 174, 1997, https://www.enssib.fr/bibliotheque-numerique/documents/45355-l-information-secondaire-du-document-

primaire.pdf. Consulté le 16 février 2021

2 " Catalogue de la bibliothèque d'Alexandrie », Wikipédia,

https://fr.wikipedia.org/wiki/Catalogue_de_la_biblioth%C3%A8que_d%27Alexandrie. Consulté le 15 février 2021

3 " À la Une de la Transition bibliographique », Transition bibliographique, https://www.transition-bibliographique.fr/. Consulté le

15 février 2021

4 " Modèle de référence Ifla pour les bibliothèques », Wikipédia,

https://fr.wikipedia.org/wiki/Mod%C3%A8le_de_r%C3%A9f%C3%A9rence_IFLA_pour_les_biblioth%C3%A8ques. Consulté le

15 février 2021

5 Vincent Boulet, chef du service des Référentiels du département des Métadonnées de la BnF, dans

sa conférence au colloque " Bibliographic Control in the Digital Age », le 9 février 2021, https://www.youtube.com/watch?v=Z_MDPpzVRl4r 2021

Introduction

- 14 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 6 7 8 9 10 11 6 7 8

9 Selon la formule " Garbage in, garbage out », bien connue en informatique et au-delà. Voir " GIGO », Wikipédia,

https://fr.wikipedia.org/wiki/GIGO. Consulté le 2 mars 2021 10

11 Un récent colloque " Biblographic Control in the Digital Ecosystem », tenu à Florence du 8 au 12 février 2021, témoigne de la

centralité de ces évolutions : https://www.bc2021.unifi.it/home. Consulté le 15 février 2021

Introduction

- 15 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

Chapitre 1 : un écosystème complexe

- 16 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

CHAPITRE 1 : UN ÉCOSYSTÈME COMPLEXE

Des métadonnées diverses

12 13 12 13

Chapitre 1 : un écosystème complexe

- 17 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 14

Tableau récapitulatif produit par Niso des divers types de métadonnées, de leurs propriétés et usages15

Des acteurs et enjeux multiples dans un flux de métadonnées 14

15 Ibid., p. 11

Chapitre 1 : un écosystème complexe

- 18 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021

Schéma général des flux des métadonnées des productions scientifiques en format numérique

De nombreux acteurs interviennent dans la chaîne de production des métadonnées de publications scientifiques,

qui sont un matériau essentiel pour à la fois les identifier, les retrouver et y accéder, et qui servent aussi à des mesures

de bibliométrie et de scientométrie.

Chapitre 1 : un écosystème complexe

- 19 - RICHARD Vincent | DCB 29 | Mémoire de recherche | Mars 2021 16 17 18 16 17 18

Chapitre 1 : un écosystème complexe

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