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Pascal Barbry
- CNRSL'avènement simultané de nouvelles technologies de séquençage des acides nucléiques et de
ellule, et de combiner cette description à des informations supplémentaires portant sur la conformation de t de renouveler notredes matrices de données de grande taille décrivant l'expression des gènes et des transcrits,
leur localisation spatiale, voire leurs trajectoires de développement, offre un nouveau cadreconceptuel pour classifier les cellules, définir leurs types et/ou états cellulaires, préciser leurs
différentes interactions et leurs destins.10^13 cellules qui composent un corps humain.
est évidemment applicable à toutes les espèces multicellulaires. Les approches utilisées requièrent le développement de nouveaux protocoles expérimentauxpréparation des différentes banques. Ces approches sont obligatoirement couplées à
les visualiser, en prenant correctement en compte la nature particulière des données générées
(taille des jeux de données, variances élevées, distributions non normales, inflation des
valeurs nulles). ire, génomique etsur la récupération de prélèvements par bronchoscopie. Il devient ainsi possible de définir
avec une bonne précision la position des cellules analysées. De nouvelles approches, en cours de développement, permettront bientôt de combiner les informations collectées en des voir réaliser de véritables " Google maps » anatomiques.contenant des cellules basales, des cellules sécrétrices, et des cellules multiciliées.
nouvelles populations de cellules rares, qui pourraient jouer un rôle dans certaines pathologies. Elles nous permettent enfin de mieux définir les interactions qui se développententre cellules épithéliales, cellules immunitaires et cellules mésenchymateuses, là encore en
lien avec des pathologies humaines. des données produites dans un outil librement futur assez proche une ressource inestimable pour mieux comprendre le fonctionnement de notre organisme, et mieux appréhender certaines situations pathologiques. Cette référencefacilitera l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques, et fournira un intéressant cadre
conceptuel de description du vivant.Références :
https://www.humancellatlas.org/ Ruiz Garcia et coll. Novel dynamics of human mucociliary differentiation revealed by single-cell RNA sequencing of nasal epithelial cultures. Development. In press. https://doi.org/10.1101/451807 Lebrigand et coll. High throughput, error corrected Nanopore single cell transcriptome sequencing. Soumis.quotesdbs_dbs46.pdfusesText_46[PDF] Les cellules malades : Myopathie de Duchenne
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