Rapport annuel dactivité
Le typage de souches en routine est aujourd'hui basé sur le MALDI-TOF Au CNR-LA de Cayenne deux kits de biologie moléculaire qrtPCR sont en cours de.
Spectrométrie de maSSe maLdi-toF en bactérioLogie cLinique ou
de la biologie moléculaire une technique actuel- lement inappropriée à l'identification de masse maLdi-toF en microbiologie clinique est l'identifica-.
Rapport dactivités type
spectrométrie de masse et biologie moléculaire. Dans 100% des cas MALDI-TOF comme appartenant au genre Brucella étaient bien classées.
Organigramme simplifié du Pôle Biologie
Biologie cellulaire. Pr M.A. BELAUD- Biologie moléculaire. UF 3029. Consultations externes parasitologie ... Plateforme spectrométrie de masse MALDI-TOF.
Rapport Annuel dActivité Centre National de Référence Listeria
24 août 2017 En lien avec l'Unité de Biologie des Infections auquel il est affilié
Rapport annuel dactivité
Prévention et Thérapies Moléculaires des Maladies Humaines (PTMMH) de l'Institut Pasteur. par technique de spectrométrie de masse de type Maldi-tof.
CNRL_Rapport2016-Projet 2017_def-avec-annexes
IDENTIFICATION DES LEISHMANIA PAR LA TECHNIQUE DU MALDI-TOF . par rapport à 2015 (340 versus 228); la moyenne annuelle était de 208 cas par an pour les ...
Présentation PowerPoint
29 mars 2018 MALDI-TOF et filamenteux : une révolution au quotidien. Algorithme ... au MALDI-TOF ! ? Evolution de la biologie moléculaire.
LABORATOIRE DHYDROLOGIE DE NANCY
sation de la spectrométrie de masse MALDI-TOF dans les laboratoires en tant par biologie moléculaire et d'analyses de ses formes infectieuses ...
Identification bactérienne par MALDI-TOF : Apport pour le patient
6 déc. 2013 Biologie moléculaire. Sérologie ... en analysant le rapport masse/charge (M/z) ... MALDI + analyseur de temps de vol = MALDI-TOF. MALDI-TOF.
Agents transmissibles d'hier et d'aujourd'hui
Evolution des méthodes diagnostiques
en mycologie29/03/2018
Frédéric GABRIEL
J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 NM I NnVemencemenW
Identification CulWure
CulWure
J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 NM I NnVemencemenW
Identification CulWure
ITenWificaWion CulWure
J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 NM I NnVemencemenW
Identification CulWure
(test rapide) IdCulWure
Identification de
référence = PCRBiomarqueur :
ÂAntigène galacWomannane
J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 NM I NnVemencemenW
Identification CulWure
(test rapide) IdCulWure
Biomarqueur :
ÂAntigène galacWomannane
(test rapide) IdIdentification de
référence = PCRAmélioration
conViTérable TeVTélaiV d'identification
La révoluWion ÓALMI-TOŃ
Id Id IT MALDI-TOŃ eW filamenWeux J une révoluWion au quoWiTienAlgorithme
Base de VpecWreV
MALDI-TOŃ eW filamenWeux J une révoluWion au quoWiTienLe récenW
bouleverVemenWWaxonomique en
rouWine !!! MALDI-TOŃ eW filamenWeux J une révoluWion au quoWiTien3La clé = une bonne base de spectres de référence
MALDI-TOŃ eW filamenWeux J une révoluWion au quoWiTien3La clé = une bonne base de spectres de référence
Normand et al, J Clin Óicrobiol 2017
MALDI-TOŃ eW filamenWeux J une révoluWion au quoWiTien3Conséquence épidémiologique
Section Fumigati62575H7%
Aspergillus fumigatus61474,3%
Aspergillus udagawae6
Aspergillus aureoluteus2
Aspergillus lentulus2
Aspergillus hiratsukae1
Section Flavi576H9%
Aspergillus flavus48
Aspergillus parasiticus9
Section Nigri506H1%
Aspergillus niger37
Aspergillus tubingensis13
Section Versicolores364H4%
Aspergillus versicolor17
Aspergillus protuberus8
Aspergillus sydowii7
Aspergillus aureolatus1
Aspergillus griseoaurantiacus1
Aspergillus puulaauensis1
Aspergillus sp [section Versicolores]1
Section Terrei212H5%
Aspergillus terreus15
Aspergillus alabamensis4
Aspergillus iizukae2
Section Nidulantes121H5%
Aspergillus nidulans5
Aspergillus echinulatus7
Section Aspergillus101H2%
Aspergillus hollandicus7
Aspergillus chevalieri1
Aspergillus intermedius1
Aspergillus montevidensis1
Section Usti60H7%
Aspergillus calidoustus4
Aspergillus insuetus2
Section Circumdati50H6%
Aspergillus persii2
Aspergillus westerdijkiae2
Aspergillus ochraceus1
Autres40H5%
Aspergillus wentii [section Cremei]3
Aspergillus sclerotiorum [section Ochraceus]1
82632 espèces identifiées
90 isolats sont des espèces cryptiques (9,1%)1,8% des isolats de la section Fumigati
MALDI-TOŃ eW filamenWeux J une révoluWion au quoWiTien3DiǀersitĠ d'espğces сх diǀersitĠ de Sté, anticipation de Rces naWurelleV
Biologie moléculaire
3Enfin des kits PCR standardisés pour PCR Aspergillus
-ProbablemenW enfin TanV leV fuWurV criWèreV TiagnoVWiqueV (2018 ?) -CerWainV permeWWenW la TéWecWion conjoinWe Te muWaWionV Te réViVWance3PCR mucorales
Autres biomarqueurs
3(1,3)-ɴ-M-glucane
3Antigène mannane
Mais la culture demeure incontournable
3Identifier l'espğce responsable
3Etudier la sensibilité aux antifongiques
¾Définition de breakpoinWV aTapWéV aux principaleV eVpèceV pour les Candida (mais en techniques liquides) Â ComparaiVon aux CÓIV de l'ensemble des souchesDifficulté à obWenir TeV TonnéeV pour
leV eVpèceV rareV I filamenWeuxEvolution de la proWéomique J
3LeV anWifongigrammeV au ÓALMI-TOŃ !
Evolution de la biologie moléculaire
3PCR multiplex standardisées / panels syndromiques
-EdžhaustiǀitĠ de l'amplification ͍ -ConWaminaWion environnemenWale ? Ou organiVme en ViWuaWion invaVive ? Gain Te WempV !
Merci pour votre attention !
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