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QU'EST-CE QU'UN MICROBE ? QU'EST-CE QUI EST DANGEREUX ? Les microbes sont des êtres vivants microscopiques. On les trouve à peu.
Le Monde
Merveil?eux des
Microbes
Écrit par Charlot?e Francoeur
Il?ustré par Lindsey Leigh
Traduit par Catherine Francoeur, Ther?se
Dubicq et Eric Binet
ni Table des matières imIntroduction aux Microbes
Recon?ais?ance des terres, éthique des terres et co?munautés microbien?es.......1Types de Microbes
.......................................2 Activité à Domicile: Créez Votre Propre Co?munauté Microbien?e.......................3 Contributions Microbien?es Liées à la SantéMicrobes & Santé Humaine
..........................4 Découverte D'Antibiotiques................................................. Découverte des Microbes du Sol & des Antibiotiques......................................... .........6 Découverte de Microbes et d'antibiotiques As?ociés aux Insectes...........................7 Proces?us Microbiens Environ?em?ntaux GénérauxSymbioses Insectes-Microbes
.....................8 Microbes & Organismes Envahis?ants............................................................ ....................9 Microbes & traitem?nt des eaux usées............................................. ..............................10 Proces?us Microbiens dans les écosystèmes de l'Arb?retum Microbes dans les zones humides............................................. 11-12 Zones humides et pol?ution............................................................. .................12 Microbes dans les prairies...................................................................... 12-13 Brûlures prescrites et co?munautés microbien?es......................................13 Microbes dans les f?rêts.................................................................. 14-15Autre investigation liée aux microbes
Activité de plein air: liste de contrôle des marqueurs microbiens............................16
Glos?aire et res?ources sup?lémentaires......................................................................
.....17 ⎷Le but de ce zine est de révéler la terre comme un monde microbien!⎷ Les mots en gras en bleu foncé sont inclus dans le glos?aire L'arb?retum UW-Madison occupe Te?jop, la terre ancestrale de la nation Ho-Chunk. En 1832, les peuples Ho-Chunk ont
été contraints de céder ce territoire
et ont enduré des décen?ies de génocide par l'État et le gouvernem?nt fédéral. Cet?e histoire de col?nisation doit être recon?ue. L?rsque vous vous déplacez dans l'Arb?retum, veuil?ez respecter les espaces autochtones, co?me les monticules d'ef?igies sacrées. Xd Mis?ion, éthique foncière et co?munautés microbien?es dW Mis?ion:Mis?ion: La mis?ion de l'arb?retum UW-Madison est de conserver et de restaurer les terres de l'arb?retum, de faire progres?er l'écol?gie de la restauration et de fav?riser "éthique des terres".Éthique des terres:Éthique des terres: simplem?nt, l'éthique des terres consiste à prendre soin des
person?es, de la terre et de renf?rcer les relations entre eux. L'éthique de la terre élargit la définition de "co?munauté» pour inclure notre co?munauté humaine avec les autres parties de la terre, y compris les sols, les eaux, les plantes et les animaux (la terre).Microbes et co?munautés microbien?es:Microbes et co?munautés microbien?es: Aucun ?rganisme ne vit isolé, et cela
est particulièrem?nt vrai pour les microbes. Les microbesmicrobes sont de minuscules êtres vivants trop petits pour être vus à l'oeil nu. Ils sont présents dans tous les environ?em?nts et af?ectent pratiquem?nt toutes les facet?es de la terre. Uneco?munauté microbien?eco?munauté microbien?e est simplem?nt un groupe de microbes qui partagent
un espace de vie co?mun. Pensez à n'imp?rte quel écosystème, animal ou même à un meuble; ils ont tous des co?munautés microbien?es existant à l'intérieur et / ou sur eux. Ainsi, l'éthique de la terre inclut non seulem?nt les systèmes naturels que nous pouvons voir, mais aus?i toute une série d'?rganismes microscopiques qui peuvent profondément influencer cet environ?em?nt! Al?rs que les humains continuent de modifier la terre, nous devons considérer notre impact sur ces ?rganismes invisibles.Xd Recon?ais?ance des terres dW
Nous abusons de la terre parce que nous la considérons comme une marchandise qui nous appartient. Lorsque nous considérons la terre comme une communauté à laquelle nous appartenons, nous pouvons commencer à l'utiliser avec amour et respect. - Aldo Leopold, Un almanach du comté de sablE1Le monde merveil?eux des microbes
Nous pouvons nous aimer en aimant la terre.
- Wangari maathaiXl Types de microbes lW
Les scientiques clasient les rganismes à l'aide de groupem?nts taxon?miquesgroupem?nts taxon?miques.
Le domaine est le groupe le plus large. Deux des domaines (Bactéries et Archées) compren?ent des ?rganismes microbiens sans noyau. Pour distinguer le troisième domaine, le domaine Eukarya, des domaines entièrem?nt microbiens, Bactéries etArchaées, il suf?it de se demander:
Les cel?ules de cet ?rganisme contien?ent-el?es un noyau?Le domaine Eukarya contient un
mélange d'?rganismes microbiens et non microbiens, y compris des animaux, des plantes, des champignons et autres.Microbes typiques dans ce
domaine:Les fongus se dévelop?ent dans de
nombreuses f?rmes et tail?es dans des environ?em?nts divers. Les fongus sont souvent des ?rganismes multicel?ulaires, co?me les champignons et les moisis?ures, mais ils peuvent aus?iêtre des levures unicel?ulaires, qui nous
aident à faire du pain et de la bière!Le domaine Bactéries contient de
petits ?rganismes unicel?ulaires que l'on trouve dans pratiquem?nt tous les environ?em?nts expl?rés (peut-être même
l'espace !!).Le domaine Archées contient
égalem?nt de petits ?rganismes
unicel?ulaires, mais ils ont des structures cel?ulaires et des métabolismes dif?érents de ceux des bactéries. À l'?rigine, on pensait que les archées ne vivaient que dans des environ?em?nts extrêmes (co?me les sources chaudes), mais maintenant, nous savons qu'el?es se trouvent dans toute une ga?me d'environ?em?nts. Les virus n'entrent dans aucun domaine défini et certains scientifiques ne définis?ent pas les virus co?me des ?rgani smes vivants. Les virus sont de minuscules capsules contenant du matériel génétique (ADN ou ARN), et ils ont besoin d'un hôte vivant pour survivre. Presque tous les ?rganismes sur terre sont l'hôte d'au moins un virus. Il y a environ 10 31(10,000,000,00
0,000,000,000,000,000,000,000) particules virales sur
la planète à tout moment! Oui! Non!ADN contenu
dans un noyau =Eucaryotes
L'ADN se
propage dans toute la cel?uleLes autres microbes eucaryotes
compren?ent les amibes, les protistes, les prot?zoaires, le plancton, les tardigrades, les moisis?ures visqueuses (mal no?mées - ce ne sont pas des fongus!), et bien d'autres.2Le monde merveil?eux des microbes
plancton tardigra d e ADNLes cyanobactéries et les
algues utilisent la lumière du soleil, le carbone et l'hydrogène pour produire de l'énergie tout en dégageant de l'oxygène. Wo Activité à domicile: créez votre propre co?munauté microbien?e! oX Pour étudier les microbes, les scientifiques don?ent aux microbes un endroit ap?roprié pour vivre et se reproduire. C'est ce qu'on ap?el?e la cultureculture. Il existe deux méthodes typiques de culture de bactéries ou de fongus:1) Dans les cultures pures, l'objectif est de ne cultiver qu'une seule espèce de
bactéries ou de fongus.2) Dans les cultures mixtes, l'objectif est de cultiver une co?munauté
microbien?e entière en imitant au plus près l'environ?em?nt naturel. Al?rs que les cultures pures néces?itent souvent des ingrédients uniques et un environ?em?nt stérile contrôlé, vous pouvez facilem?nt cultiver des co?munautés microbien?es à partir de la boue en créant une col?n?e Winogradsky, dévelop?ée à l'?rigine par le microbiol?giste rus?e Sergei Winogradsky. Vous pouvez égalem?nt créer des cultures mixtes à partir d'autres sources en cuisant du levain, en marinant et en faisant du vin, de la bière et du fromage. Pour fabriquer une col?n?e Winogradsky, vous aurez besoin de boue, d'eau, d'un pot ou d'une bouteil?e transparente et de quelques ingrédients sup?lémentaires qui fournis?ent des nutriments aux microbes (co?me des oeufs et du papier journal). Je reco?mande les instructions sur le blog Joyful Microbe (joyfulmicrobe.com/ winogradsky-column). Le blog Joyful Microbe fournit égalem?nt un journal si vous souhaitez noter vos observations ou réaliser d'autres expériences. Les résultats peuvent être magnifiques et durer des an?ées, car cet?e co?munauté microbien?e est un écosystème autosuf?isant! diminution des niveaux d'oxygène3Le monde merveil?eux des microbes
Les bactéries pourpres non
soufrées sont disponibles dans une ga?me de couleurs (malgré leur nom).Ils préfèrent peu ou pas
d'oxygène et tirent leurénergie de la lumière du soleil
et du carbone.Les bactéries soufrées
violet?es et vertes se dévelop?ent dans des conditions sans oxygène et utilisent la lumière, le carbone et l'hydrogène pour leur crois?ance.Les bactéries réductrices
de sulfates conso?ment le jaune d'oeuf et libèrent du sulfure d'hydrogène. Les microbes jouent un rôle imp?rtant dans la santé humaine. Nous so?mes plus familiers avec les agents pathogènespathogènes, ou microbes qui causent des mal?dies (égalem?nt con?us sous le nom de germes). Voici quelques agents pathogènes courants (clas?és par nom scientifique) et les mal?dies qu'ils provoquent.XL Microbes et santé humaine
Eukaryotic microbial pathogens
Les scientifiques estiment que les agents pathogènes humains représentent une infime fraction - bien moins de 1% - du total des espèces microbien?es sur terre. Ce zine se concentre sur une variété de microbes, y compris les microbes qui fournis?ent des médicaments pour repous?er les mal?dies, les microbes qui net?oient l'eau et enrichis?ent le sol, et les microbes qui soutien?ent la vie d'in?ombrables gros ?rganismes que nous voy?ns et ap?récions chaque jour, co?me les arbres et les insectes.Bactéries pathogènes
Agents pathogènes viraux
Les virus et la mal?die qu'ils causent p?rtent souvent (mais pas toujours) le même nom.Yersinia pestis - peste bubonique
Mycobacterium tuberculosis
- tuberculose (alias conso?mation)B?rrelia burgd?rferi
- mal?die de lymeVirus de la grip?e
Ebolavirus
SARS-Cov-2 (C?ronavirus)
Candida albicans -
candidose. Cet?e levure se trouve coura?ment sur les dispositifs médicaux implantés.Pathogènes fongiques
Aspergil?us fumigatus
provoque une ga?me de mal?dies qui relèvent du terme général "aspergil?ose».Plasmodium (plusieurs espèces)
- paludismeToxoplasma gondii
- toxoplasmoseLeishmania (plusieurs
espèces) - leishmaniose m ouche de sable m o u s t iq ueTique du cerf
4Le monde merveil?eux des microbes
puce rat chatXL Découverte d'antibiotiques KW
Même avnt que les humains ne sachent ce qu'étaient les microbes, les gens traitaient les mal?dies en conso?mant des choses qui peuvent nuire aux microbes, co?me l'ail, les herbes et les fongus. Maintenant, nous dévelop?ons des antibiotiquesantibiotiques: des médicaments qui tuent les microbes. Cet?e section se concentre sur les antibiotiques qui ciblent les bactéries.1) RÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES: Les médicaments actuels
sont de moins en moins ef?icaces pour tuer les bactéries. Les bactéries sont incroyables pour trouver des moyens d'éviter ou de contrer les choses qui peuvent les tuer.2) NOUS NE TROUVERONS PAS DE NOUVEAUX MÉDICAMENTS: Il n'y a
pas eu de nouveaux antibiotiques depuis le début des an?ées 2000.Co?ment obtenir de nouveaux
médicaments cap?bles de tuer les agents pathogènes? Les scientifiques ont plusieurs idées. L'une d'el?es est la bioprospectionbioprospection, ou l'expl?ration de sources environ?em?ntales pour de nouveaux médicaments. Il s'avère que les microbes dans un environ?em?nt don?é es?aient consta?ment de s'entre-tuer pour se nourrir et gagner de l'espace. Au fur et à mesure qu'ils se bat?ent, ils dévelop?ent de nouvel?es façons de surpas?er leurs concurrents. Une stratégie consiste à produire des produits chimiques pour tuer d'autres microbes. Nous pouvons trouver ces produits chimiques en al?ant dans dif?érents environ?em?nts et en isolant des types uniques de microbes (tels que les fongus qui tuent les bactéries et les bactéries qui tuent d'autres bactéries).Dans les an?ées 1920, Alexander Fleming
a accidentel?em?nt découvert le premier antibiotique moderne, la pénicil?ine. Après son retour de vac?nces, il a découvert qu'une de ses plaques de culture bactérien?e était contaminée par une moisis?ure et que la zone autour de la moisis?ure contenait une clairière avec moins de crois?ance bactérien?e. Il a finalem?nt isolé la pénicil?ine de cet?e moisis?ure, con?ue maintenant sous le nom de Penicil?ium rubens.Depuis cet?e découverte, de nombreux autres
antibiotiques ont été isolés à partir de sources microbien?es. Au cours des dernières décen?ies, nous avons co?mencé à faire face à deux problèmes majeurs:5Le monde merveil?eux des microbes
Petites col?nies
bactérien?es inhibées par la production de pénicil?inePenicil?ium rubens
Col?nies
bactérien?es se dévelop?ant n?rmalem?ntPénicilline
1928197020002003
C h r o n o l o g i e d e la découve
r t e d e s a n t i b i o t i q u e s Le sol a été la source naturel?e convention?el?e de nouveaux antibiotiques, et c'est un endroit magique pour les microbiol?gistes. Al?rs que beaucoup de gens voient de la saleté, les scientifiques voient une co?munauté de microbes magnifiquem?nt diversifiée (champignons, bactéries, virus, etc.)! Dans une cuil?ère à café de sol sain, vous pouvez trouver plus de microbes qu'il y a d'humains sur terre - environ10 mil?iards de microbes par gra?me de sol.
Le sol est une arène où les microbes doivent combat?re, s'ad?pter et produire de nouveaux produits chimiques. Potentiel?em?nt, nous pouvons identifier ces produits chimiques et les utiliser pour dévelop?er de nouveaux antibiotiques pour lut?er contre les agents pathogènes (germes). Un groupe de bactéries du sol en particulier, les actinomycètes, a été une riche res?ource pour la découverte d'antibiotiques. Ces microbes sont responsables de la production de 75% des antibiotiques largem?nt utilisés en médecine. Les scientifiques poursuivent leurs ef??rts mondiaux pour trouver des microbes dans le sol qui produisent des médicaments utiles. Par ex?mple, l'initiative Tiny Earth, dont le siège est à UW-Madison, est un réseau mondial dédié à l'implication des étudiants dans la recherche de nouveaux antibiotiques provenant du sol (en savoir plus sur le siteWeb Tiny Earth - tinyearth.wisc.edu).
Co?ment les scientifiques cultivent des microbes à partir du solXL Microbes du sol et antibiotiques KW
1. Ram?s?ez la
terre dans un tube stérile, ajoutez du liquide salé, mélangez2. Cultivez des microbes
à partir du mélange
de sol3. Cultivez un
microbe séparément sur une autre plaque (voir culture pure, page 3)4. Cultivez le
microbe avec un ensemble d'agents pathogènes humainsPathogen 1
dévelop?ePathogen 2 ne
dévelop?e pas7. Répétez les étapes 3 à 6
pour tous les microbes qui semblent dif?érents (jaune et bleu)5. Si le microbe
arrête la crois?ance du pathogène, isolez les produits chimiques responsables (plusieurs étapes)6. Découverte de
médicaments et ap?lications cliniques6Le monde merveil?eux des microbes
g u p e s bquotesdbs_dbs46.pdfusesText_46[PDF] les types de monopole
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