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Création dune base de données dans logiciel épi info partie 1

30 jan 2018 · Cet vidéo décrit comment vous pouvez aisément concevoir des base de données a l"aide du Durée : 1:01:10Postée : 30 jan 2018



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Le logiciel peut être téléchargé sur Internet à l'adresse : http://www cdc gov/epiinfo Le fichier téléchargé contient 557 Méga Octets (pour Allsetup zip qui 



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Epi info Cours pdf

Le logiciel Epi Info? est produit par la ?Division of Surveillance and Epidemiology Epidemiology Program Office Centers for Disease Control

  • Comment utiliser le logiciel Epi Info ?

    Comment faire ? Epi Info est un logiciel qui permet de concevoir des questionnaires, de saisir les réponses données à ces questionnaires et d'appliquer des traitements statistiques sur les données recueillies.

  • Pourquoi utiliser Epi Info ?

    Epi Info™ 7 est utilisé par les professionnels de la santé publique pour l'étude des épidémies, la gestion de bases de données pour la surveillance de la santé publique ainsi que d'autres t?hes et, de façon générale, les applications statistiques et les bases de données.4 août 2016

  • Comment saisir les données sur Epi Info ?

    ? Cliquez deux fois sur le champ “Numéro d'Identification”; ? dans la boîte de dialogue “Définition de champ”, cochez l'option Requis ; ?Pour finir, cliquez sur le bouton OK. Avec l'option Répéter le Dernier, au cours de la saisie, le champ sera automatiquement rempli avec la dernière valeur saisie par l'utilisateur.
  • Pour installer le logiciel, cliquez sur « Epi Info » dans « Outils pour le cours », puis suivez les instructions d'installation. Une fois l'installation terminée, lancer le logiciel (EpiInfo.exe), une fenêtre s'ouvre.

Rpourlesdebutants

EmmanuelParadis

InstitutdesSciencesdel'Evolution

UniversiteMontpellierII

F-34095Montpelliercedex05

France

E-mail:paradis@isem.univ-montp2.fr

ductionenespagnol. c quelanoticec quellelangue,aconditionquelanoticec ci-dessussoitincluse.

Tabledesmatieres

1Preambule1

2Quelquesconceptsavantdedemarrer3

3LesdonneesavecR10

4LesgraphiquesavecR38

5LesanalysesstatistiquesavecR59

6ProgrammeravecRenpratique69

7LitteraturesurR76

1Preambule

sousformedetableaux. etRobertGentleman 2.Ily

Gentleman(1996)ouauR-FAQ

3dontunecopieestegalementdistribueeavec

R. cence

5ousetrouvent

duCRANsibesoin. 2voir 3

4pourplusd'infos:http://www.gnu.org/

5http://cran.r-project.org/

1

6,laplupartdeces

exi-

Onverrad'autresexemplesillustrantla

exibilited'unsystemecommeR vis-a-visdeslogicielsclassiques.

6parexemple:http://stat.cmu.edu/S/

2

2Quelquesconceptsavantde

demarrer quenousallonsvoirmaintenant.

2.1CommentRtravaille

m^emesdesobjets). plusloin(p. 3 arguments! options!fonction argumentspardefaut =)resultat tionetlaconstructiondesfonctions(p.

72).Lapresentedescriptionestpour

1). unserveurdistantviainternet. fonctionsetoperateurs objets ?6)XXXXXXXz objets.../library/base/ /stast/ /graphics/ ...bibliotheque defonctions chiersde donnees internet

PSJPEG...clavier

souris -commandes ecran

MemoireviveDisquedur

surledisquedanslerepertoireR

HOME/library(RHOMEdesignantle

4 (parexemple,pourbase,ceseralechierR

HOME/library/base/R/base).Ce

chiercontientlesfonctionsdupackage. >n [1]10 fonctionoud'uneboucle). `espacessoulignes'(

2.2Creer,listereteacerlesobjetsenmemoire

orientedansunsensoudansl'autre: >n<-15 >n [1]15 >5->n >n [1]5 >x<-1 >X<-10 >x [1]1 >X [1]10 >n<-10+2 >n 5 [1]12 >n<-3+rnorm(1) >n [1]2.208807 zeroetvarianceunite(p. passtockeenmemoire: >(10+2)*5 [1]60 lacomprehension. >name<-"Carmen";n1<-10;n2<-100;m<-0.5 >ls() [1]"m""n1""n2""name" s'abregeravecpat): >ls(pat="m") [1]"m""name" question: >ls(pat="^m") [1]"m" >ls.str() m:num0.5 n1:num10 n2:num100 name:chr"Carmen" touslesdetailsavecl'optionmax.level=-1: 6 >M<-data.frame(n1,n2,m) >ls.str(pat="M")

M:`data.frame':1obs.of3variables:

$n1:num10 $n2:num100 $m:num0.5 >ls.str(pat="M",max.level=-1)

M:`data.frame':1obs.of3variables:

="^m")).

2.3L'aideenligne

>?lm

Error:syntaxerror

>help("*")

Arithmeticpackage:baseRDocumentation

ArithmeticOperators

informationbienprecise.

Description:brevedescription.

operateurdonnel'usagetypique.

Details:descriptiondetaillee.

7 l'aideaveclafonctionexample. >help("bs") youcouldtry'help.search("bs")' >help("bs",try.all.packages=TRUE) canbefoundinthefollowingpackages:

PackageLibrary

splines/usr/lib/R/library enutilisantl'optionpackage: >help("bs",package="splines") bspackage:splinesRDocumentation

B-SplineBasisforPolynomialSplines

Description:

exemple)entapant: >help.start() 8 =TRUE)). sontcherches: >apropos(help) [1]"help"".helpForCall""help.search" [4]"help.start" 9

3LesdonneesavecR

3.1Lesobjects

numerique,caractere,complexe

7,etlogique(FALSEouTRUE).D'autresmodes

etlength: >x<-1 >mode(x) [1]"numeric" >length(x) [1]1 >A<-"Gomphotherium";compar<-TRUE;z<-1i >mode(A);mode(compar);mode(z) [1]"character" [1]"logical" [1]"complex" notationexponentielle: >N<-2.1e23 >N [1]2.1e+23 10 avecNaN(notanumber). >x<-5/0 >x [1]Inf >exp(x) [1]Inf >exp(-x) [1]0 >x-x [1]NaN pourecriresurledisque(p.

16,l'optionqmethoddecettefonction).

>x [1]"Doublequotes\"delimitateR'sstrings." >cat(x)

Doublequotes"delimitateR'sstrings.

l'^etre!): >x 11 objetmodesplusieursmodes possiblesdans lem^emeobjet? facteurnumeriqueoucaractereNon donnees fonction,expression,... parcontresalongueurserade4.

3.2Liredesdonneesdansunchier

8 12 aunchiernommedata.dat,lacommande: >mydata<-read.table("data.dat") mydata[,1],mydata[,2],...

9Ilyaplusieursoptionsdontvoicilesvaleurs

teur)etlesdetailsdansletableauquisuit: colClasses=NA,nrows=-1, strip.white=FALSE,blank.lines.skip=TRUE, comment.char="#") aunchierdetypeURL(http://...) nomsdesvariablessurla1ereligne unetabulation declecaractereutilisepourlesdecimales (pardefaut:1,2,3,...)

V3,...)

encaractere ignorees)

20)desdetailssurlamani-

pulationdesobjets. 13 donnees des\blancs"sontajoutes apreslesvariablesdemodecaractere cetoption,utilisercomment.char="") dierentes: fill=TRUE,...) fill=TRUE,...) fill=TRUE,...) fill=TRUE,...)

Lafonctionscanestplus

exiblequeread.table.Unedierenceestqu'il

Lesoptionssontlessuivantes.

quote=if(sep=="\n")""else"'\"",dec=".", skip=0,nlines=0,na.strings="NA", allowEscapes=TRUE) 14 mineeparuneligneblanche) sepleseparateurdechampdanslechier declecaractereutilisepourlesdecimales donnees nlineslenombredelignesalire dedonnees) des\blancs"sontajoutes apreslesvariablesdemodecharacter suruneseulelignedanslechier(FALSE) commentairesnesontpaspermis) (ledefaut)oulaissestels-quels unformatalargeurxee(xedwidthformat): as.is=FALSE,skip=0,row.names,col.names, n=-1,buffersize=2000,...) aveclacommandesuivante:

A1.501.2

A1.551.3

B1.601.4

B1.651.5

C1.701.6

C1.751.7

>mydata

V1V2V3

1A1.501.2

15

2A1.551.3

3B1.601.4

4B1.651.5

5C1.701.6

6C1.751.7

3.3Enregistrerlesdonnees

matrice,...).Lesargumentsetoptionssont: eol="\n",na="NA",dec=".",row.names=TRUE, xlenomdel'objetaecrire lechier sepleseparateurdechampdanslechier charriot) declecaractereutilisepourlesdecimales danslechier col.namesidempourlesnomsdescolonnes 16 file=".RData").

3.4Genererdesdonnees

3.4.1Sequencesregulieres

^etregenereepar: >x<-1:30 >1:10-1 [1]0123456789 >1:(10-1) [1]123456789 suivante: >seq(1,5,0.5) [1]1.01.52.02.53.03.54.04.55.0 utiliser: >seq(length=9,from=1,to=5) [1]1.01.52.02.53.03.54.04.55.0 c: >c(1,1.5,2,2.5,3,3.5,4,4.5,5) [1]1.01.52.02.53.03.54.04.55.0 >z<-scan()

1:1.01.52.02.53.03.54.04.55.0

10:

Read9items

>z [1]1.01.52.02.53.03.54.04.55.0 17 >rep(1,30) [1]111111111111111111111111111111 fonction: >sequence(4:5) [1]123412345 >sequence(c(10,5)) [1]1234567891012345 dufacteur.Exemples: >gl(3,5) [1]111112222233333

Levels:123

>gl(3,5,length=30) [1]111112222233333111112222233333

Levels:123

>gl(2,6,label=c("Male","Female")) [1]MaleMaleMaleMaleMaleMale [7]FemaleFemaleFemaleFemaleFemaleFemale

Levels:MaleFemale

>gl(2,10) [1]11111111112222222222

Levels:12

>gl(2,1,length=20) [1]12121212121212121212

Levels:12

>gl(2,2,length=20) [1]11221122112211221122

Levels:12

hwsex

160100Male

18

280100Male

360300Male

480300Male

560100Female

680100Female

760300Female

880300Female

3.4.2Sequencesaleatoires

c'estqueleparametredoit^etrespecie). loifonction

Gauss(normale)rnorm(n,mean=0,sd=1)

exponentiellerexp(n,rate=1) gammargamma(n,shape,scale=1)

Poissonrpois(n,lambda)

Weibullrweibull(n,shape,scale=1)

Cauchyrcauchy(n,location=0,scale=1)

betarbeta(n,shape1,shape2) `Student'(t)rt(n,df)

Fisher{Snedecor(F)rf(n,df1,df2)

Pearson(2)rchisq(n,df)

binomialerbinom(n,size,prob) multinomialermultinom(n,size,prob) geometriquergeom(n,prob) hypergeometriquerhyper(nn,m,n,k) logistiquerlogis(n,location=0,scale=1) lognormalerlnorm(n,meanlog=0,sdlog=1) binomialenegativernbinom(n,size,prob) uniformerunif(n,min=0,max=1) 19 sont: >qnorm(0.025) [1]-1.959964 >qnorm(0.975) [1]1.959964 >1-pchisq(3.84,1) [1]0.05004352

3.5Manipulerlesobjets

3.5.1Creationd'objets

onleverraplusloin(p. 28).
20 d'exemples: >factor(1:3) [1]123

Levels:123

>factor(1:3,levels=1:5) [1]123

Levels:12345

>factor(1:3,labels=c("A","B","C")) [1]ABC

Levels:ABC

>factor(1:5,exclude=4) [1]123NA5

Levels:1235

>ff<-factor(c(2,4),levels=2:5) >ff [1]24

Levels:2345

>levels(ff) [1]"2""3""4""5" peut^etrecreeeaveclafonctionmatrix: dimnames=NULL) >matrix(data=5,nr=2,nc=2) [,1][,2] [1,]55 [2,]55 >matrix(1:6,2,3) [,1][,2][,3] 21
[1,]135 [2,]246 >matrix(1:6,2,3,byrow=TRUE) [,1][,2][,3] [1,]123 [2,]456 >x<-1:15 >x [1]123456789101112131415 >dim(x) NULL >dim(x)<-c(5,3) >x [,1][,2][,3] [1,]1611 [2,]2712 [3,]3813 [4,]4914 [5,]51015 >x<-1:4;n<-10;M<-c(10,35);y<-2:4 >data.frame(x,n) xn 1110
2210
3310
4410
>data.frame(x,M) xM 1110
2235
3310
4435
>data.frame(x,y)

Errorindata.frame(x,y):

argumentsimplydifferingnumberofrows:4,3 22
>L1<-list(x,y);L2<-list(A=x,B=y) >L1 [[1]] [1]1234 [[2]] [1]234 >L2 $A [1]1234 $B [1]234 >names(L1) NULL >names(L2) [1]"A""B" valeurspardefaut,sont: dataunvecteurouunematrice faconquestart 23
ts.eps etc. >ts(1:10,start=1959)

TimeSeries:

Start=1959

End=1968

Frequency=1

[1]12345678910quotesdbs_dbs41.pdfusesText_41
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