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AVERTISSEMENT

Ce document est le fruit d'un long travail approuvŽ par le jury de soutenance et mis ˆ disposition de l'ensemble de la communautŽ universitaire Žlargie. Il est soumis ˆ la propriŽtŽ intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de rŽfŽrencement lors de lÕutilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pŽnale. Contact : ddoc-thesesexercice-contact@univ-lorraine.fr LIENS

Code de la Prop

riŽtŽ Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la PropriŽtŽ Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 2015

Soutenu devant le Jury Interrégional

Le

21 octobre 2015

Par REGNAULT Loïc

né le 09/07/1988 à Laxou (54) Conformément aux dispositions de l'arrêté du 4 octobre 1988 tient lieu de Titre

Membres du Jury

Président : Monsieur le Professeur Christophe GANTZER

UNIVERSITÉ DE LORRAINE

FACULTÉ DE PHARMACIE

Année universitaire 2015-2016

DOYEN

Francine PAULUS

Vice-Doyen

Béatrice FAIVRE

Directeur des Etudes

Virginie PICHON

Conseil de la Pédagogie

Président, Brigitte LEININGER-MULLER

Collège d'Enseignement Pharmaceutique Hospitalier

Président, Béatrice DEMORE

Commission Prospective Facultaire

Président, Christophe GANTZER

Vice-Président, Jean-Louis MERLIN

Commission de la Recherche

Président, Raphaël DUVAL

Responsable de la filière Officine Béatrice FAIVRE Responsables de la filière Industrie Isabelle LARTAUD,

Jean-Bernard REGNOUF de VAINS

Responsable de la filière Hôpital Béatrice DEMORE Responsable Pharma Plus ENSIC Jean-Bernard REGNOUF de VAINS

Responsable Pharma Plus ENSAIA Raphaël DUVAL

Responsable de la Communication Marie-Paule SAUDER Responsable de la Cellule de Formation Continue Béatrice FAIVRE et individuelle Responsable de la Commission d'agrément Béatrice FAIVRE des maîtres de stage Responsables des échanges internationaux Bertrand RIHN

Responsable ERASMUS Mihayl VARBANOV

DOYENS HONORAIRES

Chantal FINANCE

Claude VIGNERON

PROFESSEURS EMERITES

Jeffrey ATKINSON

Jean-Claude BLOCK

Max HENRY

Gérard SIEST

Claude VIGNERON

PROFESSEURS HONORAIRES MAITRES DE CONFERENCES HONORAIRES

Roger BONALY Monique ALBERT

Pierre DIXNEUF Mariette BEAUD

Marie-Madeleine GALTEAU Gérald CATAU

Thérèse GIRARD Jean-Claude CHEVIN

Michel JACQUE Jocelyne COLLOMB

Pierre LABRUDE Bernard DANGIEN

Lucien LALLOZ Marie-Claude FUZELLIER

Vincent LOPPINET Françoise HINZELIN

Marcel MIRJOLET Francine KEDZIEREWICZ

Janine SCHWARTZBROD Marie-Hélène LIVERTOUX

Louis SCHWARTZBROD Bernard MIGNOT

Jean-Louis MONAL

Blandine MOREAU

Dominique NOTTER

ASSISTANTS HONORAIRES Christine PERDICAKIS

Marie-France POCHON

Marie-Catherine BERTHE Anne ROVEL

Annie PAVIS Maria WELLMAN-ROUSSEAU

ENSEIGNANTS Section CNU* Discipline d'enseignement PROFESSEURS DES UNIVERSITES - PRATICIENS HOSPITALIERS Danièle BENSOUSSAN-LEJZEROWICZ 82 Thérapie cellulaire

Jean-Louis MERLIN 82 Biologie cellulaire

Alain NICOLAS 80 Chimie analytique et Bromatologie Jean-Michel SIMON 81 Economie de la santé, Législation pharmaceutique Nathalie THILLY 81 Santé publique et Epidémiologie PROFESSEURS DES UNIVERSITES Christine CAPDEVILLE-ATKINSON 86 Pharmacologie

Raphaël DUVAL 87 Microbiologie clinique

Béatrice FAIVRE 87 Biologie cellulaire, Hématologie

Luc FERRARI 86 Toxicologie

Pascale FRIANT-MICHEL 85 Mathématiques, Physique

Christophe GANTZER 87 Microbiologie

Frédéric JORAND 87 Eau, Santé, Environnement

Isabelle LARTAUD 86 Pharmacologie

Dominique LAURAIN-MATTAR 86 Pharmacognosie

Brigitte LEININGER-MULLER 87 Biochimie

Pierre LEROY 85 Chimie physique

Philippe MAINCENT 85 Pharmacie galénique

Alain MARSURA 32 Chimie organique

Patrick MENU 86 Physiologie

Jean-Bernard REGNOUF de VAINS 86 Chimie thérapeutique Bertrand RIHN 87 Biochimie, Biologie moléculaire MAITRES DE CONFÉRENCES DES UNIVERSITÉS - PRATICIENS HOSPITALIERS

Béatrice DEMORE 81 Pharmacie clinique

Julien PERRIN 82 Hématologie biologique

Marie SOCHA 81 Pharmacie clinique, thérapeutique et biotechnique MAITRES DE CONFÉRENCES Sandrine BANAS 87 Parasitologie Xavier BELLANGER 87 Parasitologie, Mycologie médicale

Emmanuelle BENOIT 86 Communication et Santé

Isabelle BERTRAND 87 Microbiologie

Michel BOISBRUN 86 Chimie thérapeutique

François BONNEAUX 86 Chimie thérapeutique

Ariane BOUDIER 85 Chimie Physique

Cédric BOURA 86 Physiologie

Igor CLAROT 85 Chimie analytique

Joël COULON 87 Biochimie

Sébastien DADE 85 Bio-informatique

Dominique DECOLIN 85 Chimie analytique

Roudayna DIAB 85 Pharmacie galénique

Natacha DREUMONT 87 Biochimie générale, Biochimie clinique

Joël DUCOURNEAU 85 Biophysique, Acoustique

Florence DUMARCAY 86 Chimie thérapeutique

François DUPUIS 86 Pharmacologie

Adil FAIZ 85 Biophysique, Acoustique

Anthony GANDIN 87 Mycologie, Botanique

Caroline GAUCHER 85/86 Chimie physique, Pharmacologie

Stéphane GIBAUD 86 Pharmacie clinique

Thierry HUMBERT 86 Chimie organique

Olivier JOUBERT 86 Toxicologie, Sécurité sanitaire ENSEIGNANTS (suite) Section CNU* Discipline d'enseignement Alexandrine LAMBERT 85 Informatique, Biostatistiques

Julie LEONHARD 86 Droit en Santé

Christophe MERLIN 87 Microbiologie environnementale

Maxime MOURER 86 Chimie organique

Coumba NDIAYE 86 Epidémiologie et Santé publique

Francine PAULUS 85 Informatique

Caroline PERRIN-SARRADO 86 Pharmacologie

Virginie PICHON 85 Biophysique

Sophie PINEL 85 Informatique en Santé (e-santé)

Anne SAPIN-MINET 85 Pharmacie galénique

Marie-Paule SAUDER 87 Mycologie, Botanique

Guillaume SAUTREY 85 Chimie analytique

Rosella SPINA 86 Pharmacognosie

Gabriel TROCKLE 86 Pharmacologie

Mihayl VARBANOV 87 Immuno-Virologie

Marie-Noëlle VAULTIER 87 Mycologie, Botanique

Emilie VELOT 86 Physiologie-Physiopathologie humaines Mohamed ZAIOU 87 Biochimie et Biologie moléculaire

Colette ZINUTTI 85 Pharmacie galénique

PROFESSEUR ASSOCIE Anne MAHEUT-BOSSER 86 Sémiologie MAITRE DE CONFERENCES ASSOCIE Alexandre HARLE 82 Biologie cellulaire oncologique PROFESSEUR AGREGE Christophe COCHAUD 11 Anglais

En attente de nomination

*Disciplines du Conseil National des Universités :

80 : Personnels enseignants et hospitaliers de pharmacie en sciences physico-chimiques et ingénierie appliquée à la santé

81 : Personnels enseignants et hospitaliers de pharmacie en sciences du médicament et des autres produits de santé

82 : Personnels enseignants et hospitaliers de pharmacie en sciences biologiques, fondamentales et cliniques

85 ; Personnels enseignants-chercheurs de pharmacie en sciences physico-chimiques et ingénierie appliquée à la santé

86 : Personnels enseignants-chercheurs de pharmacie en sciences du médicament et des autres produits de santé

87 : Personnels enseignants-chercheurs de pharmacie en sciences biologiques, fondamentales et cliniques

32 : Personnel enseignant-chercheur de sciences en chimie organique, minérale, industrielle

11 : Professeur agrégé de lettres et sciences humaines en langues et littératures anglaises et anglo-saxonnes

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Table des matières

Table des tableaux

Table des figures

Introduction

I.Généralités sur les bactéries anaérobies

A.Définition

(1,2)

B.Habitat

1.Flore exogène

2.Flore endogène

(4)

C.Pouvoir pathogène

1.Physiopathologie

(5)

2.Infections liées aux anaérobies

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II.Les bactériémies à anaérobies

4.Diagnostic microbiologique

a) Méthodes b) Espèces bactériennes III.Sensibilité aux antibiotiques des bactéries anaérobies A.Quand évaluer la sensibilité aux antibiotiques des bactéries anaérobies ?

B. ǯ

bactéries anaérobies

1.Définitions

2.St andardisation

3.Méthodes ǯ

a) Méthode de dilution en milieu gélosé b) Méthode de dilution en milieu liquide c) Méthode utilisant un ensemenceur en spirale d) Lǯilomètre e) Galerie ATB ANA® (bioMérieux) f) Méthode de diffusion en milieu gélosé g) Recherche de la production de Ⱦ-lactamase h) Détection des résistances par méthodes moléculaires i) Nouvelles méthodes de détection de résistances C.Etat des lieux de la résistance antibiotique des bactéries anaérobies

1.Résistances naturelles

2.Résistances acquises

a) Bacteroides du groupe fragilis (1) Ⱦ-lactamines (2) Métronidazole (3) Macrolides et tétracyclines (4) Fluoroquinolones b) Autres bacilles à Gram négatif c) Cocci anaérobies à Gram positif (1 ) Bêta-lactamines (2) Macrolides (3) Métronidazole d) Clostridium (1) Clostridium difficile (2) Autres Clostridium e) Bacilles à Gram positif non sporulés (1) Propionibacterium (2) Actinomyc es

I.Objectifs

II.Matériels et méthodes

A.Données bio-cliniques

o o o

B.ǯ

o o o o o o o o o o

C.ǯaux antibiotiques des isolats

a) Méthode de diffusion avec disques Conditions et milieux de culture b) Molécules testées

2.Recherche de Ⱦ-lactamase

3.Détermination des CMI

4.Détection des gènes de résistance

D.Etude statistique

III.Résultats

A.Epidémiologie locale des hémocultures à bactéries anaérobies B.Sensibilité aux antibiotiques des bactéries anaérobies

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IV.Discussion

Conclusion

BIBLIOGRAPHIE

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