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édition française dun grand classique

La traduction en français de la huitième édition duPrescott"s Microbiology, est un ouvrage de référence qui décrit la microbiologie dans ses aspects fondamentaux, médicaux, écologiques, alimentaires et industriels. Dans cette nouvelle édition, une attention particulière est apportée à l"évolution des microbes, à leur diversité et leur écologie, à leur pouvoir pathogène, aux épidémies contemporaines et aux moyens de les combattre.

Des outils informatiques et des animations

en 3DLa grande nouveauté réside en des outils informatiques et des animations en 3D accessibles sur le Web. Sur ce site, on peut trouver également de la documentation complémentaire, soit pointue, soit de vulgarisation.

Les nouveautés de cette éditionParmi les thèmes nouveaux de cette édition, on retiendral"attention portée sur les biocarburants d"origine micro-bienne, l"influence des microbes sur le changement climatique, l"explosion au XXI

e siècle des techniques de génomique, la microbiologie de l"eau, la description du virus H1N1. Nous pointerons également l"ajout des questions qui viennent illustrer la matière à partir d"articles pointus. Elles incitent les étudiants à consulter la littérature scien- tifique et à tester leurs connaissances. Enfin, la valeur pédagogique des diagrammes de concepts est fortement appréciée par les étudiants.Traduction de la 8 e

édition américaine

Jacques Coyette est microbiologiste et docteur en

sciences biomédicales expérimentales de l"Université de Liège. Il est chargé de cours honoraire de cette même université. Il a enseigné la biologie générale au premier cycle universitaire ainsi que la bacté- riologie fondamentale et la biochimie microbienne au second.

Max Mergeay est microbiologiste et docteur en

sciences chimiques de l"Université Libre de Bruxelles.

Il est actuellement professeur honoraire de cette

même université et collaborateur scientifique à l"Université de Mons. Pendant 30 ans, il a animé au Centre d"Études de l"Énergie Nucléaire de Mol (Belgique) un groupe de recherches sur la microbiologie de l"environnement (principalement les environnements industriels) et sur la microbiologie spatiale.Microbiologie

Prescott

I

Willey

Sherwood

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WoolvertonMicrobiologie

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PRESCOTT

Prescott

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MicrobiologieISBN : 978-2-8041-8039-3

Traduction de J. Coyette et M. Mergeay

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© De Boeck Supérieur s.a., 2013 4

e

édition

Rue des Minimes, 39 B-1000 Bruxelles

Tous droits réservés pour tous pays.

Il est interdit, sauf accord préalable et écrit de l"éditeur, de r eproduire (notamment par photocopie) partiellement ou tota lement le présent ouvrage, de le stocker dans une banque de donnée s ou de le communiquer au public, sous quelque forme et de quelque manière que ce soit.

Imprimé en Italie

Dépôt légal:

Bibliothèque nationale, Paris: octobre 2013

Bibliothèque royale de Belgique, Bruxelle

s: 2013/0074/165 ISBN 978-2-8041-8039-3 Pour toute information sur notre fonds et les nouveautés dans votre domaine de spécialisation, consultez notre site web: www.deboeck.comOuvrage original

Prescott"s Microbiology

, 8 e

Edition, Willey, Sherwood, Woolverton, 2011.

Original edition copyright (2011) by McGraw-Hill, a business unit of T he McGraw-Hill Companies, Inc.,

1221 Avenue of the Americas, New York, NY 10020. Copyright © 2011 by The McGraw-Hill Companies,

Inc. All rights reserved.

The French edition copyright (2013) by De Boeck Supérieur. All rights reserved.

PRESCOTT-pgeTitre.indd 45/09/13 10:48

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A PROPOS DES AUTEURS

JOANNE M. WILLEY est professeur de Microbiologie à l"Université Hofstra de Long Island, New York,

depuis 1993. Elle fait aussi partie de l"école de Médecine de l"Université Hofstra. Le Dr Willey a obtenu son B.A. en

biologie à l"Université de Pennsylvanie où elle s"est intéressée à la microbiologie lors d"une recherche sur la crois

sance des cyanobactéries dans les cours d"eau eutrophisés. Elle a obtenu son Ph.D. en océanographie biologique

(plus particulièrement en microbiologie marine) en 1987 grâce à un programme conjoint de l"Institut de Techno

logie du Massachusetts (MIT) et de l"Institut Océanographique Woods Hole. Elle est ensuite allée à l"Université de

Harvard comme post-doctorante et a étudié

Streptomyces coelicolor, une bactérie filamenteuse du sol. Le Dr Willey

poursuit activement ses travaux sur ce micro-organisme et est co-auteur de nombreuses publications consacrées à

son cycle de développement complexe. Elle est un membre actif de la Société Américaine de Microbiologie (l"ASM).

Elle a été un membre du bureau éditorial de la revue "Applied and Environmental Microbiology» durant neuf ans

et présidente de la division de Microbiologie générale. Le Dr Willey enseigne régulièrement la microbiologie aux

étudiants en biologie et en sciences médicales. Elle donne également des cours de biologie cellulaire, de microbio

logie marine et de techniques de laboratoire en génétique moléculaire. Le Dr Willey vit avec son époux et ses deux

fils sur la côte nord de Long Island. Elle adore particulièrement la course à pied et apprécie le ski, les randonnées,

la voile et la lecture. Son adresse e-mail est: joanne.m.willey@hofstra.edu.

LINDA M.

SHER

WOOD est m

embre du Département de Microbiologie de l"Université de l"Etat du Mon

tana. C"est lors du dernier cours suivi pour obtenir le diplôme de B.S. en Psychologie à la Western Illinois University

qu"elle a commencé à s"intéresser à la microbiologie. Elle a obtenu son M. S. en Microbiologie à l"Université d"Alabama

où elle s"est intéressée à l"utilisation de l"histidine par Pseudomonas acidovorans. Par la suite, son étude de la sporula- tion de

Saccharomyces cerevisiae lui a permis de recevoir un Ph.D. en Génétique de l"Université de l"Etat du Michigan.

Elle a brièvement quitté le monde de la microbiologie pour étudier la biologie moléculaire des mutants

dunce de la

drosophile dans cette même université avant de gagner l"Université de l"Etat du Montana. Le Dr Sherwood a toujours

manifesté un vif intérêt pour l"enseignement et son expérience en psychologie l"a aidée à comprendre les modèles

actuels de la connaissance et de l"apprentissage ainsi que leurs implications dans l"enseignement. Pendant ces années,

elle a enseigné la microbiologie générale, la génétique, la biologie, la génétique et la physiologie microbienne. Elle

a été éditrice de la revue "Focus on Microbiology Education» de l"ASM et a participé et collaboré à de nombreuses

Conférences destinées aux Enseignants du premier cycle organisées par l"ASM (ASMCUE). Avec des enseignants du

niveau K-12, elle a également développé une unité à base de kits visant à introduire la microbiologie dans le curri

culum des écoles élémentaires. Elle est co-auteur avec Barbara Hudson d"un manuel de laboratoire en microbiologie

générale intitulé "Explorations in Microbiology, A Discovery Approach» et publié par Prentice-Hall. Son association

avec McGraw-Hill a débuté lors de la préparation des guides d"étude des cinquième et sixième éditions de

Microbio-

logy. Ses intérêts non académiques sont principalement centrés sur sa famille. Elle apprécie également la lecture, les

randonnées, le jardinage et les voyages. Son adresse e-mail est: lsherwood@montana.edu. CHRI

STOPHER

J. WOOLVERTON est Professeur en Sciences de la Santé Environnementale et un

membre fondateur du Collège de Santé Publique de l"Université d"Etat de Kent (Kent, OH). Le Dr Woolverton a fait

partie du Département des Sciences Biologiques pendant 14 ans. Il est Directeur du Centre pour la Préparation de la

Santé Publique de l"Université d"Etat de Kent et supervise son Centre d"Apprentissage au niveau BSL-3. Il fait partie

aussi de l"Hôpital pour Enfants d"Akron (Akron, OH). Il a obtenu son B. S. au Collège Wilkes, Wilkes-Barre en Penn

sylvanie et un M. S. ainsi qu"un Ph.D. en Microbiologie Médicale du Collège de Médecine de l"Université de West

Virginia. Il a passé deux ans comme post-doctorant à l"Université de Caroline du Nord à Chapel Hill pour étudier le

rôle des bactéries dans la régulation de l"immunité chez des rongeurs axéniques. La recherche du Dr Woolverton est

centrée sur la détection en temps réel et l"identification des agents pathogènes en employant un biosenseur à cristaux

liquides pour lequel il a pris un brevet en 2001. Le Dr Woolverton a beaucoup publié et donné des conférences sur

les mécanismes grâce auxquels les cristaux liquides sont utilisés comme biosenseurs. Il a enseigné la microbiologie

aux étudiants en sciences et en sciences paramédicales et a donné des cours de second cycle en immunologie et en

physiologie microbienne. Il enseigne également la sécurité au laboratoire, l"estimation du risque et la préparation au

bioterrorisme aux personnels des laboratoires. C"est un membre actif de l"ASM et il a été récemment éditeur en chef

du Journal of Microbiology and Biology Education. Le Dr Woolverton vit à Kent, dans l"Ohio, avec son épouse Nancy

et ses filles Samantha et Abbey. Sa fille Lyssa a épousé Ken et vit en Arizona. Le Dr Woolverton aime la randonnée

et le camping. C"est un fervent cycliste et un instructeur de Spinning. Son adresse e-mail est: cwoolver@kent.edu.

PRISE DE CONTACT DES ÉTUDIANTS AVEC LA MICROBIOLOGIE À TRAVERS... vi

UNE TABLE

DES MATIÈRES

NOVATRICE

introduction

à l"en

semble du monde des micro- organismes est maintenant proposée dans les chapitres 3,

4 et 5. La structure

et la fonction des bactéries, des archées et des eucaryotes précèdent une introduction sur les virus qui est très accessible aux

étudiants.

SOMMAIRE

xiii Première partie Introduction à la microbiologie

1 La microbiologie etl"évolution des micro-organismes 1

2 L"étude de la structure microbienne: la microscopie etla préparation des échantillons 25

3 Les Bacteria et lesArchaea 46

4 La cellule eucaryote: lastructure et la fonction 88

5 Les virus et les autres agents infectieux acellulaires 114

Deuxième partie

La nutrition, la croissance

et le contrôle des micro- organismes

6 La nutrition microbienne 137

7 La croissance des micro-organismes 155

8 Le contrôle des micro-organismes dans l"environnement 190

Troisième partie

La métabolisme microbien

9 Introduction aumétabolisme 208

10 Le catabolisme: la libération et la conservation de l"énergie 228

11 L"anabolisme: l"utilisation de l"énergie dans la biosynthèse 264

Quatrième partie

La biologie moléculaire et

la génétique microbiennes

12 Les gènes: structure, réplication et expression 288

13 La génétique microbienne: la régulation de l"expression génétique 331

14 La génétique microbienne: les mécanismes de la variation génétique 363

15 La technologie de l"ADN recombinant 397

16 La génomique microbienne 419

Cinquième partie

La diversité du monde

microbien

17 La taxinomie microbienne et l"évolution de la diversité 446

18 Les Archaea 473

19 Les bactéries: les deinocoques et les bactéries Gram-négatives autres que les protéobactéries 495

20 Les bactéries: les protéobactéries 514

21 Les bactéries: les Gram-positives à faible teneur en G+C dans l"ADN 551

22 Les Bactéries: les Gram-positives à ADN à haute teneur en G + C 568

23 Les protistes 582

24 Les champignons ou Fungi 602

25 Les virus 616

Sixième partie

Écologie et symbiose

26 Le recyclage biogéochimique 644

27 Les méthodes de l"écologie microbienne 658

28 Les micro-organismes dans les milieux marins etdulçaquicoles 673

29 Les micro-organismes dans les écosystèmes terrestres 692

30 Les interactions microbiennes 713

Septième partie

Pathogénicité et résistance

de l"hôte

31 L"infection et lapathogénicité 739

32 La résistance non spécifique ou innée del"hôte 760

33 L"immunité spécifique ouadaptative 789

Huitième partie

Les maladies microbiennes

et leur contrôle

34 La chimiothérapie antimicrobienne 826

35 La microbiologie et l"immunologie cliniques 850

36 L"épidémiologie etlamicrobiologie ensantépublique 873

37 Les maladies humainesdues aux virusetaux prions 897

38 Les maladies humaines dues aux bactéries 932

39 Les maladies humaines dues aux champignons etaux protistes 982

Neuvième partie

Microbiologie appliquée

40 La microbiologie alimentaire 1009

41 La microbiologie industrielle 1032

42 La microbiologie appliquée environnementale 1051

Annexe I

Revue de la chimie des molécules

biologiques A1

Annexe II

Les voies métaboliques principales A9

Annexe III

Le diagramme de concepts A16

diversité des micro-organismes apparait à présent dans tout le texte. L es chapitres 17 à 25 ont été complètement mis à jour en y ajoutant de nombreuses figures et informations physiologiquesquotesdbs_dbs27.pdfusesText_33
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