[PDF] RAPPORT DE STAGE DE BACTERIOLOGIE ET DE PARASITOLOGIE

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RAPPORT DE STAGE DE BACTERIOLOGIE ET

DE PARASITOLOGIE

Effectué au Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie

E.S.S.Agro.

Du 03 Août 2014 au 31 Octobre 2014

Présenté par : RAZAFINDRABE Tsiriniaina Jean Luco

Doctorant à l'A2E E.S.S.Agro.

i

REMERCIEMENTS

Nous tenons à remercier :

- Le Programme des Nations Unies pour le Developpement (PNUD), l'Organisme des Nations Unies pour l'Education, la Science et la Culture (UNESCO) et du Comité

Scientifique (CS) ;

- L'Université d'Antananarivo à travers toute l'équipe G/DHD dirigée par Monsieur le Vice Président de la Formation et de la Recherche ; - Tout le personnel du Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSAgro. Nous adressons, particulièrement, nos vifs remerciements et toutes nos chaleureuses gratitudes à Monsieur le Professeur RAKOTOZANDRINDRAINY Raphaël, Chef de Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSAgro. et aussi notre encadreur. C'est avec un grand plaisir que nous réservons ces lignes en signe de gratitude et de

reconnaissance à tous ceux qui ont contribué de près ou de loin pour la réalisation de ce stage.

SOMMAIRE

REMERCIEMENTS ................................................................................................................... i

INTRODUCTION

...................................................................................................................... 1

CONTEXTE ................................................................................................................................ 1

HISTORIQUE ET ACTIVITES DU SITE D"ACCUEIL ....................................................... 2

METHODOLOGIE .................................................................................................................... 3

I. COLLECTE DE FECES DE BOVIN .............................................................................................. 3

I.1. Nature et condition de prélèvement ..................................................................................... 3

I.2. Lieu et modalité de prélèvement .......................................................................................... 3

I.3. Etiquetage............................................................................................................................... 3

I.4. Acheminement et transport .................................................................................................. 3

I.5. Réception au laboratoire ....................................................................................................... 3

II. EXAMEN BACTERIOLOGIQUE DES SELLES (COPROCULTURE)............................ 3

II.1. Examen macroscopique des prelevements ...................................................................... 3

II.2. Culture : ensemencement et isolement ............................................................................ 4

II.2.1. Milieu de culture ............................................................................................................ 4

II.2.2. Technique de culture et isolement ................................................................................ 5

II.3. Identification ...................................................................................................................... 5

II.3.1. Aspect des colonies ........................................................................................................ 5

II.3.2. Examen microscopique direct ...................................................................................... 5

II.3.3. Tests metaboliques (glucidiques, protéiques, lipidiques) ........................................... 7

II.3.4. Autres tests d"identification .......................................................................................... 7

II.4. Antibiogramme .................................................................................................................. 8

II.4.1. Technique et réalisation sur gélose Mueller Hinton ................................................... 8

II.4.2. Lecture et interprétation ............................................................................................... 8

III. EXAMEN PARASITOLOGIQUE DES SELLES .................................................................. 9

III.1. Technique de sédimentation ............................................................................................. 9

III.2. Différents types d"œuf d"helminthes des bovins observés .............................................. 9

Pages

RESULTATS ............................................................................................................................ 10

CONCLUSION ET PERSPECTIVES .................................................................................... 11

ANNEXES ................................................................................................................................. 12

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES ............................................................................... 15

1

INTRODUCTION

Dans le cadre de la préparation du doctorat en santé animale au sein de l'Ecole doctorale A2E ESSAgro de l'Université d'Antananarivo, le Programme des Nations Unies pour le Developpement (PNUD), l'Organisme des Ntions Unies pour l'Education, la Science et la Culture (UNESCO) en coopération avec l' Université d'Antananarivo à travers la Gouvernance et Développement Humain Durable (G/DHD) nous a offert un stage académique 3 mois au sein du Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSA-Université d'Antananarivo Notre thème concerne " la diarrhéé bovine : causes microbienne et parasitaire dans les régions d'Amoron'i Mania et Vakinankaratra ». C'est pourquoi l'objectif de notre

stage focalisé sur le savoir-faire des analyses bactériologiques et parasitologiques relatifs à la

connaissance des causes de la diarrhée bovine.

CONTEXTE

A Madagascar,

l'elevage bovin occupe une place très importante dans le cadre du développement en intervenant dans plusieurs domaines économiques, sociologiques et culturels (1). Comme toute spéculation, il rencontre des problèmes de maladies telles que la diarrhée banale, le météorisme, les helminthoses (2). La diarrhée entraine des pertes économiques pour les éleveurs alors que sa cause exacte reste encore méconnue. 2

HISTORIQUE ET ACTIVITES DU SITE

D'ACCUEIL

Le Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSA-Université

d'Antananarivo a été fondé en 1990 grâce au sutien financier de la Suisse sous la direction du

Docteur TYBERAENC (vétérinaire). En 1996, la coopération française a contribué pour l'appui technique et financier. En 2007, l'Union Européenne a assuré la réhabilitation du laboratoire. Le Professeur RAKOTOZA NDRINDRAINY Raphaël a dirigé le laboratoire depuis mai 1993 Les activités de ce laboratoire se focalisent sur les examens parasitologiques et

bactériologiques pour les stages et les travaux pratiques des étudiants ainsi que les travaux de

recherches pour les mémoires de fin d'étude et les thèses de doctorat. Le personnel est composé du Chef de Laboratoire, de 2 Docteurs vétérinaires Doctorants et de 2 Techniciens de laboratoire et d'un Assistant Administratif. 3

METHODOLOGIE

I. COLLECTE DE FECES DE BOVIN

I.1.

Nature et condition de prélèvement

Les prélèvements sont des matières fécales fraichement émises provenant des bovins présentant de signes de diarrhée. I.2.

Lieu et modalité de prélèvement

Les prélèvements ont été pris dans les tueries d'Ampasika et chez quelques éleveurs situés dans les Fokontany Andraisoro et Ambatomaro. Pour le receuil du prélèvement, la fouille rectale a été pratiquée. I.3.

Etiquetage

Bien emballé dans un sachet, ces matières fécales sont étiquetées pour éviter toute

confusion. I.4.

Acheminement et transport

Les prélèvements ont été transportés jusqu'au laboratoire d'analyse de l'ESSAgro. dans une glacière munie d'accumulateurs de froid pour bloquer la multiplication bactérienne et l'évolution des oeufs de parasites (Annexe 1). I.5.

Réception au laboratoire

Arrivés au laboratoire, ces prélèvements sont mis dans un réfrigérateur (conservation maximale 8 heures à 4°C) jusqu'au moment du début de l'analyse. II. EXAMEN BACTERIOLOGIQUE DES SELLES (COPROCULTURE) L'examen bactériologique des selles se fait par coproculture, en ensemençant ces

dernières sur des milieux de culture appropriés. Le but est de rechercher des bactéries réputées

pathogènes. II.1.

Examen macroscopique des prelevements

Chaque prélèvement est observé pour noter son aspect et sa consistance : la présence de mucus, sa couleur noirâtres, son odeur (nauséabonde). 4 II.2.

Culture : ensemencement et isolement

II.2.1.

Milieu de culture

II.2.1.1.

Types Plusieurs types de milieu de culture sont utilisés : o Gélose au sang et gélose au chocolat : gélose ordinaire favorable à la croissance et multiplication bactérienne et même ceux qui ont besoin d'un facteur de croissance. o

Bouillon selenite

o

Gélose Salmonella-Shigella

o Gélose Mac Conkey : c'est un milieu sélectif pour les bacilles Gram négatifs oquotesdbs_dbs2.pdfusesText_2

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