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Morphométrie et analyses des formes

Du 20 au 24 avril 2015

Responsable : Michel BAYLAC

UMR 7205 : ISYEB ; Plate-forme Morphométrie UMS 2700 ; MNHN Département " Systématique et

Evolution »

Tél : 01 40 79 34 06 ; fax : 01 40 79 36 99 ; e-mail: baylac@mnhn.fr

Intervenants

: Raphaël CORNETTE (MNHN, UMR 7205 et UMS 2700) ; BAYLAC (MNHN), Adrien PERRARD (post-doct. AMNH, New-York), Leo BOTTON-DIVET (doct. MNHN) Lieu : Salle informatique de Phanérogamie

Inscription

obligatoire sur : http://rug.mnhn.fr/seminr/inscription.html

____________________________________________________________________________________________________________

Objectifs : L'objectif de cette formation est de présenter un large éventail des concepts et des

méthodes de la morphométrie classique et géométrique (2D et 3D) appliquées à la systématique et

à l'évolution. Les différentes séances comprennent des cours, des séminaires et des travaux

dirigés. L'ensemble vise à permettre aux doctorants d'utiliser au mieux les approches morphométriques actuelles tout en leur fournissant les éléments d'une lecture critique des publications. Le module comprend également une visite de la plate-forme de Morphométrie de

l'UMS 2700. La dernière journée sera consacrée à une introduction à l'acquisition et aux

traitements des données surfaciques (points homologues + contours + surfaces) et la journée de jeudi comprendra une introduction aux interactions entre morphométrie et phylogénie. ______________________________________________________________________________

Lundi 20 avril 2015

09h30 à 12h00 : Michel BAYLAC (MNHN)

Introduction au module. Morphométrie et Biométrie : définitions ; types de données ; acquisition des données ; logiciels et systèmes d'acquisition ; présentation des articles à lire et commenter..

12h00 à 12h30 : Michel BAYLAC (MNHN)

Séminaire : Analyses statistiques des données morphométriques : exemple des

Lestodiplosis

13h30 à 16h15 : Michel BAYLAC (MNHN)

Numérisation et acquisition de données 2D. Etude de cas, définition et acquisition de points-repères 2D. Biais de numérisation - mesure, effet opérateur. Acquisition de points de contours 2D.

16h30 à 17h30 : Michel BAYLAC (MNHN) et Raphaël CORNETTE (MNHN)

Visite de la plate-forme Morphométrie (UMS 2700, Systématique Intégrative). Systèmes de numérisation 2D et 3D, démonstrations ; fonctionnement de la plate- forme.

Mardi 21 avril 2015

09h30 à 12h30 : Michel BAYLAC (MNHN)

Morphométrie classique (Morphométrie multivariée) I : distances, allométrie bivariée. Généralisation multivariée de la relation allométrique. Taille allométrique. Comparaison des directions allométriques, angles et tests.

Allométrie multigroupe.

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13h30 à 16h45 : Michel BAYLAC (MNHN)

Morphométrie multivariée II : ratios, log-shape ratios et conformations : approches de Mosimann. Equivalences et relations avec les approches de la morphométrie géométrique. Tailles, formes et conformations. Comparaison ratios et résidus hors taille allométrique. Log-shape ratios et composantes de conformations, allométrie

17h00 à 17h30 : Michel BAYLAC(MNHN)

Séminaire : Evolution phénotypique au sein des Lekanosphaera

Article commenté

Mercredi 22 avril 2015

09h30 à 12h00 : Adrien PERRARD (AMNH)

Morphométrie Géométrique I : Superpositions et espaces des conformation. Analyses de coordonnées de points-repères homologues 2D et 3D: superpositions Procustes. Résultats. Paramètres de nuisance. Visualisations ; symétrisation.

13h00 à 15h45 : Adrien PERRARD (AMNH)

Modélisations par les plaques minces (Thin-Plate Splines, TPS) : introduction. Mise en oeuvre des plaques minces 2D : logiciels de la série tps (F.J. Rohlf). Application au traitement des données numérisées le lundi. Shape spaces, différences entre shape space et tangent space (tpsSmall).

16h00 à 17h30 : Adrien PERRARD (AMNH)

Allométries et morphométrie géométrique : calculs et visualisations Morphométrie et phylogénie : une brève introduction

Jeudi 23 avril 2015

09h30 à 12h30 : Michel BAYLAC (MNHN)

Morphométrie Géométrique II : contours et sliding landmarks. Contours et représentations des contours. Différentes méthodes d'analyses : analyses de Fourier, EFA, plaques minces (sliding landmarks). Exemples.

13h30 à 16h15 : Michel BAYLAC (MNHN)

Sliding landmarks 2D : introduction.

Mise en oeuvre des sliding landmarks. Application. Comparaison des approches

EFA - sliding landmarks. Conclusions.

13h30 à 16h15 : Michel BAYLAC (MNHN)

Articles commentés

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Vendredi 24 avril 2015

09h30 à 12h30 : Raphaël CORNETTE, Leo BOTTON-DIVET et Michel BAYLAC

Morphométrie Géométrique III : Surfacique 3D. Données : types, caractéristiques, acquisition et traitements préparatoires. Des surfaces aux points-repères 3D : sliding landmarks 3D.

14h00 à 16h30 : Raphaël CORNETTE, Leo BOTTON-DIVET, Adrien PERRARD, et

Michel BAYLAC

Mise en oeuvre des données surfaciques 3D, traitements statistiques.

16h45 à 17h00 : Adrien PERRARD et Michel BAYLAC

Articles commentés : Mitteroecker et Gunz ; Adams et al.

17h00 à 17h30 : Michel BAYLAC, Raphaël CORNETTE, Leo BOTTON-DIVET et

Adrien PERRARD

Synthèse et conclusions au module

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