[PDF] de lAgence nationale de sécurité sanitaire de lalimentation de l

Qu'est-ce que le partage de la séquence génétique complète du nouveau virus ?

• Le partage de la séquence génétique complète du nouveau virus au début du mois de janvier 2020 a constitué une avancée fondamentale dans la caractérisation du SARS-CoV-2, permettant la mise au point rapide de produits de diagnostic et facilitant le développement de traitements et de vaccins (73-80).

Qu'est-ce que la surveillance zoonotique ?

• Suivi des réintroductions zoonotiques des deux côtés de la barrière des espèces. Surveillance des eaux usées et de l’environnement. Soutien à la surveillance traditionnelle grâce à la quantification de la période de transmission, l’évaluation des facteurs de transmission et l’estimation des niveaux de transmission dans la population.

Quels sont les avantages de l’étude des mutations virales ?

• L’étude des mutations virales dans le temps et dans l’espace peut également aider à suivre la propagation de l’agent pathogène et à mieux comprendre les voies de transmission potentielles et la dynamique de la transmission. Les analyses phylogénétiques permettent de reconstituer la chronologie de l’évolution des agents pathogènes.

Comment augmenter la quantité de matériel génétique viral disponible dans un échantillon avant le séquençage ?

• Les approches fondées sur la PCR, telles que celle conçue par le réseau ARTIC, sont un moyen peu coûteux, rapide et pratique d’accroître la quantité de matériel génétique viral disponible dans un échantillon avant le séquençage (51-53).