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3ème année ICBE 2011-2012
Travaux pratiques de Statistique
Philippe Besse
Jean-Louis Tichadou
Organisation du cours et des travaux pratiques de Statistique La partie " Statistique Microbiologie & Statistique » va conduire à 2 notes évaluantUn examen
Un rapport final rendant compte des 8 séances de travaux pratiques.En complément des 2x5 séances de cours, il y a donc 8 séances de travaux pratiques divisées en 2 parties.
: étude statistique des données de croissance bactérienne obtenues lors des travaux pratiques de Microbiologie INSA de Toulouse 3icbe Probabilités & Statistique 2011-2012 2TP1 Prise en main du logiciel Minitab
Objectif : (MINITAB version 14 en anglais)
Son Session» et un tableau appelé "Worksheet».Fonctionnement typique :
les données sont mises dans le tableau un traitement est choisi dans le menu on indique sur quelles données il doit agir les résultatsAttention :
- as la cellule mais la colonne entière (le " champ ; on agit sur toutes les Le nom de la colonne est mis dans sa première case, réservée à cet effet, sur la ligne grise non numérotée. Un menu contient une liste de sous-menus correspondant à différentes fonctionnalités.Exemple : menu " Stat »
sous menu " Basic Statistics » INSA de Toulouse 3icbe Probabilités & Statistique 2011-2012 3Sélection des variables pour une commande
Si une commande (" Display Descriptive Statistics » par exemple) estLa liste des
Pour sélectionner la ou les variables voulues : double-cliquer sur le nom de la variable ou bien marquer la ou les variables et agir sur la touche " Select ». fichent dans la fenêtre de droite.Remarque
Pour découvrir le logiciel, quatre exemples avec les fonctions du menu principal : Stat, Calc, Data et Graph1) Obtenir des statistiques descriptives
Le menu Stat regroupe les méthodes statistiques du logiciel. Nous en étudierons certaines. Etude de la population de tous les résultats Les concentrations obtenues sont : 183 191 191 208 201 195 205 199 et 202 en mg/l Saisir les données dans une colonne et la nommer concentration.Obtenir des statistiques descriptives :
o Menu Stat / Basic Statistics / Display Descriptive Statistics o avec Statistics-type (standard deviation-type de la moyenne (SE of mean) et la médiane. o avec Graphics Comparer écart-type des mesures et erreur-type de la moyenne. Le rapport de leurs valeursétait-il prévisible ?
2) Générer des nombres aléatoires
vraies valeurs » des paramètres moyenne et écart- infiniment grand de mesures. On est sûr aussi de la loi de distribution. Etude 1 : Quelle allure peut avoir un histogramme de données selon le nombre de valeurs ? Générer une série de 100 valeurs aléatoires, réparties selon une loi normale, o Menu Calc / Random Data / Normal o Generate 100 raws of data Obtenir les statistiques descriptives correspondantes. courbe normale associée aux données. Comparer avec des séries de respectivement 10, 1000 et 10000 valeurs.Etude 2 : Quelles différences peut-on obtenir entre plusieurs échantillons de même population ?
Générer 10 séries d-type 5 stockées dans 10 colonnesnommées de Y1 à Y10 (Les générer en une seule fois, les noms des variables séparés par des espaces.).
INSA de Toulouse 3icbe Probabilités & Statistique 2011-2012 4 Obtenir les statistiques descriptives correspondantes. Comparer les moyennes, les écarts-types et les erreur-types des moyennes des 10 séries. Recommencer avec des séries de respectivement 10 et 100 valeurs. Quelles tendances remarquez-vous lorsque le nombre de valeurs augmente ?3) Manipuler des données
Bien organiser ses données est nécessaire pour les traiter et les analyser efficacement.Les tableaux ci-
des concentrations résultant de dosages effectués à différentes températures :T18 T22 T26 T30 Conc Temp
17.5 19.1 20.1 20.9 17.5 18
18.2 20.5 20.6 21.4 18.2 18
19.4 19.8 19.1 22
20.5 22
19.4 22
20.1 26
20.6 26
19.8 26
20.9 30
21.4 30
La seconde organisation est souvent préférable. Chaque ligne du tableau représente alors un dosage (avec sa concentration, sa température, onLes données utilisées pour les prochaines séances de TD et le projet (voir page suivante) seront
présentées de cette façon. Etude 1 : Saisir les données dans 4 colonnes et les empiler pour en faire une seule colonne.Remarque : Selon la configuration de votre ordinateur, il faut taper un point ou une virgule pour que les valeurs
o Menu Data / Stack / Columns o Stack the following columns : T18 T22 T26 T30 o Column in current worksheet : Conc o Store subscripts in : Tempo cocher la case pour avoir les noms des colonnes en indice, sinon il y aura des numéros 1, 2, 3 et 4.
On peut aussi désempiler des données (commande Unstack columns).Etude 2
Si on vo
comme titre des 4 colonnes -le et constatez que la variable Temp reste considérée comme du texte. Pour changer de type : o Menu Data / Change Data Type / Text to Numeric4) Afficher un graphique
Etude : avec les données précédentes, afficher un diagramme de points Conc = f(Temp) o Menu Graph / ScatterPlot / Simple Que ? INSA de Toulouse 3icbe Probabilités & Statistique 2011-2012 5TP2 Exploration statistique
Une analyse statistique déroule scrupuleusement les étapes suivantes :1. Explicitation précise de la question biologique comme par exemple :
dans la boîte de Pétri a-t-il un effet sur la croissance bactérienne ?2. Se poser les questions : quelle est la population étudiée ? Comment planifier
3. Description unidimensionnelle (indicateurs, graphiques) et bidimensionnelles (liaisons)
des variables concernées5. Choix du test ou du modèle adapté à la question biologique et aux données recueillies ;
6. Explicitation des hypothèses, calcul de la statistique de thèse, décision.
En pratique :
er les commentaires. Objectif de la séance : -dessus. Description statistique avec Minitab.1. Les Données
1.1 Gestion des fichiers
" cometud ». Le transfert des données dans Minitab se fait en ouvrant le fichier par une feuille de
travail (File>New>Worksheet) ou par copier/coller.Remarque : Pour transférer les données dans Minitab par copier/coller, sélectionnez entièrement la feuille Excel
ņ avec les noms des colonnes ņdans la première case de titrede colonne et coller. En une seule fois, les noms des colonnes sont mis dans la ligne de titre et les données dans le
tableau.1.2. Données épidémiologiques
Il comprend 115 lignes (individus ou unités statistiques) décrites par les 19 variables ci-dessous.
1 a été réalisée dan
informations médicales et socio-économiques concernant le bébé et ses parents ont été collectées.
Dix ans plus tard, de nouvelles informations étaient recueillies. chercher si certaines caractéristiques des parents avaient une influenceEnfant à la naissance
ESx sexe M ou F
ERh facteur rhésus
ETaille0 taille en cm (converti à partir de pouces) EPoids0 poids en kg (converti à partir de livres)Enfant à 10 ans
ETaille10 taille
EPoids10 poids
MRh groupe sanguin
1 Source des données : J.L. Hodges, D. Krech et R. Crutchfield Statlab : an Empirical Introduction to Statistics, 1975.
INSA de Toulouse 3icbe Probabilités & Statistique 2011-2012 6 MAge âge au dernier anniversaire avant la naissanceMPoids0 poids
MCig0 consommation de cigarettes 0 cigarettes par jour 1 à 10 plus de 10Mère 10 ans après
MTaille10 taille
MPoids10 poids
MCig10 consommation de cigarettes
PAge âge au dernier anniversaire avant la naissancePCig0 consommation de cigarettes
Père 10 ans après
PTaille taille
PPoids10 poids
Revenus familiaux
RevFam0 en centaines de dollars
RevFam10 10 ans après
Lancer Minitab, ouvrir la feuille de travail contenant les données puis exécuter les différentes
commandes.2.1 Description unidimensionnelle
Variable quantitative
: Menu Stat > Basic Statistics > Display Descriptive Statisticscalculer les différents indicateurs quantitatifs relatifs à cette variable, représenter son histogramme
et le diagramme boîte. Commentaire. Etudier également rapidement, le poids à dix ans, celui du
père, de la mère. Variable qualitative : la consommation de cigarette de la mère au moment de la naissance. Calculer les effectifs et proportions de chaque classe, tracer un diagramme en secteur. Menu Stat > Tables > Tally Individual Variables (tally = compte)Menu Graph > Pie Chart (diagramme en secteur)
Remarque : le travail a été simplifié par un regroupement préalable des modalités présentant un trop
faible effectif (de 1 à 3 cigarettes, de 10 à 20 cigarettes) Commentaires. Etudier également la variable sexe.2.2. Description bidimensionnelle
Représenter la liaison entre une variable quantitative et une variable qualitative par des diagrammes boîtes parallèles consommation de cigarette de la mère. Menu Graph > Boxplot choisir : One Y - With Groups Comparer ces boîtes, les médianes. Commentaire. Etude de la liaison entre deux variables quantitatives naissanceCalculer le coefficient de corrélation entre les deux variables et représenter le nuage de point
INSA de Toulouse 3icbe Probabilités & Statistique 2011-2012 7Menu Stat > Basic Statistics > Correlation
Menu Graph > Scatterplot
Etude de la liaison entre deux variables qualitatives Construire la table de contingence, calculer les profils. Menu Stat > Tables > Cross Tabulation and Chi-Square Trouver les effectifs de chaque cellule de la table, les effectifs marginaux, les profils lignes et -à-dire, par exemple, les pourcentages des rhésus par sexe.Commentaire sur la liaison entre les variables.
Etudier également la relation entre le sexe et la consommation de cigarette de la mère.quotesdbs_dbs23.pdfusesText_29[PDF] LE GOUVERNEMENT D 'ENTREPRISE - Oeconomianet
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