Rapport sur le mémoire de thèse de doctorat de
24 mai 2019 en vue de l'obtention du grade de Docteur de l'ENSTA Bretagne. Rapporteur : Vincent Hugel. Professeur des Universités section CNU 60.
Rapport en vue de la présentation à la soutenance de la thèse de
La thèse que Monsieur Eric Toussaint présente en vue Doctorat en Sciences Politiques
Rapport du jury de soutenance
2 juil. 2015 Maurice Goze rapporteur de la thèse
RAPPORT!SUR!LES!TRAVAUX!DE
DE! Madame&Marion&BONHOMME&. EN!VUE!DE!LA!SOUTENANCE!! D'UNE!THESE!DE!DOCTORAT!DEVANT!
PIERRE rapport de soutenance thèse définitif
En ce qui concerne le sujet de cette thèse le rapporteur doit constater un certain flou. annonçant l'émergence d'un modèle unique de cadre transnational (ce ...
Modèle rapport davancement de thèse
27 mai 2014 Rapporteur. M. Lionel ESTEL. Professeur
Rapport de soutenance de la thèse présentée par Mademoiselle
l'est par exemple par les résultats d'une élection ? Il rappelle que cette En position de premier rapporteur Jodelle Zetlaoui-Léger tient d'abord à faire ...
Rapport de soutenance sur la thèse présentée par Monsieur Gilles
Il manque par exemple des cartes avec la désignation des lieu de trouvailles Le troisième rapporteur M. L. Bernard donne à son tour son avis. Le travail ...
Rapport de thèse
Président : D. WOLF. Professeur Institut National Polytechnique de Lorraine. Rapporteurs : I. QUEINNEC. Directeur de Recherche
SOUTENANCE DE THESE PROCEDURE INP DE TOULOUSE
Dès que le titre est validé par le doctorant la DRED convoque les rapporteurs pour leur indiquer la date limite de retour des rapports et leur indiquer le lien
Rapport sur le mémoire de thèse de doctorat de
May 24 2019 Rapporteur : Vincent Hugel. Professeur des Universités
rapport de la soutenance de these - de dao nguyen da huong
Jan 29 2014 Pierre-Marie Decoudras
Rapport en vue de la présentation à la soutenance de la thèse de
La thèse que Monsieur Eric Toussaint présente en vue Doctorat en Sciences Politiques
RAPPORT!SUR!LES!TRAVAUX!DE
SOUTENANCE!! D'UNE!THESE!DE!DOCTORAT!DEVANT! L'Université!de!Toulouse! Ecole!
Rapport de thèse
en acceptant de juger ce travail en tant que rapporteurs. Exemple illustrant la non-identifiabilité a posteriori . . . . . . . 102.
PIERRE rapport de soutenance thèse définitif
L'exemple d'un groupe pétrolier français ”. Membres du Jury : Mr. SAINSAULIEU Professeur des Universités
Untitled
Dec 15 2014 Rapport de soutenance de la thèse de ... Maurice Goze
Rapport de soutenance de la thèse présentée par Mademoiselle
distingués dans la thèse et restitue
Procédure de Soutenance de la thèse de Doctorat Conformément
Les rapporteurs ont 1 à 2 mois pour faire le rapport et le faire parvenir daté et signé au secrétariat du CED. Page 3. Centre d'Etudes Doctorales : Sciences et
Mémoire de Thèse
Je voudrais remercier les rapporteurs de cette thèse M. Jacky Akoka Professeur des Universités de Exemple d'enrichissement de l'ontologie touristique .
AVERTISSEMENT
Ce document est le fruit d'un long travail approuvŽ par le jury de soutenance et mis ˆ disposition de l'ensemble de la communautŽ universitaire Žlargie. Il est soumis ˆ la propriŽtŽ intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de rŽfŽrencement lors de lÕutilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pŽnale.Contact : ddoc-theses-contact@univ-lorraine.fr
LIENS Code de la PropriŽtŽ Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la PropriŽtŽ Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10École Doctorale IAEM Lorraine
THÈSE
présentée pour l"obtention du Doctorat de l"Université Henri Poincaré, Nancy 1 (Spécialité Automatique, Traitement du Signal et Génie Informatique) parSimona DOBRE
Analyses de sensibilité et d"identifiabilité globales.Application à l"estimation de paramètres
photophysiques en thérapie photodynamiqueSoutenue publiquement le 22 Juin 2010
Composition du jury
Président :D. WOLFProfesseur, Institut National Polytechnique de Lorraine. Rapporteurs :I. QUEINNECDirecteur de Recherche, CNRS, LAAS.C. MOOGDirecteur de Recherche, CNRS, IRCCyN.
Examinateurs :E. BULLINGERFrancqui Assistant Professor, Université de Liège. A. RICHARDProfesseur à l"Université Henri Poincaré, Nancy 1, CRAN.T. BASTOGNEMaître de Conférences à l"Université Henri Poincaré, Nancy 1, CRAN.Centre de Recherche en Automatique de Nancy
CRAN - UMR 7039 CNRS-UHP-INPL
à Dragos, Ioana et Andrei
à mes parents
iiRemerciements
Je tiens à remercier avant tout, les membres du jury qui me font l"honneur de participer à l"examen
de ce travail.M. Thierry Bastogne, Maître de Conférences à l"Université Henri Poincaré Nancy 1, je vous re-
mercie de m"avoir encadré, soutenu et fait partager votre passion pour la recherche tout au long de
cette thèse. Un grand merci pour votre patience et votre grande disponibilité, ainsi que vos qualités
humaines et scientifiques.M. Alain Richard, Professeur à l"Université Henri Poincaré Nancy 1, je vous remercie de m"avoir
guidé dans cette voie de la recherche et m"avoir su communiquer votre rigueur scientifique. Je vais
manquer les discussions scientifiques lors dès nos réunions d"avancement de thèse. Mme. Isabelle Queinnec, Directeur de Recherche au CNRS, et M. Claude Moog, Directeur de Re- cherche au CNRS, je vous adresse mes sincères remerciements pour l"honneur que vous me faites en acceptant de juger ce travail en tant que rapporteurs. J"apprécie vivement les remarques faite sur mon travail et je vous prie de croire en ma haute considération. Mme Muriel Barberi-Heyob, Chargée de Recherche au CRAN, je vous remercie pour les clarifica-tions données sur les questions portant sur la thérapie photodynamique et pour votre disponibilité.
M. Eric Bullinger, Francqui Assistant Professor à l"Université de Liège, et M. Didier Wolf, Pro-
fesseur à l"Institut National Polytechnique de Lorraine, je vous suis profondément reconnaissante
pour l"enthousiasme avec lequel vous avez accepté de participer à ce jury de thèse.Un grand merci à M. Pierre Vallois, Professeur à l"Université Henri Poincaré Nancy 1, pour sa
disponibilité et sa patience lors de nos réunions " mathématiques » sur les correspondances entres
les analyses globales de sensibilité et d"identifiabilité. Merci également à Nicolae Cindea pour les
réponses apportées concernant les différentes démonstrations que j"essayais de formaliser.
Merci à tous mes amis doctorants et docteurs (du quatrième, cinquième et sixième étage) du
CRAN, et d"ailleurs, pour tous les moments inoubliables de travail et de pause. iv Merci à Junbo, Xijing, Abdelhamid, Vincent, Souleyman, Samir, Ali, Kamel, Idriss, Leila, Nico- las, Pierre, Gabriela, Esma, Carlos ... Merci aux filles Sabine, Marion, Christelle, Corinne pour leurs gentils mots. Jean-Marie, Hugues et autres permanents pour leurs encouragements.Special thanks to
Alina et Coriolan, Sebastian et Georgeta, Loredana et Marius, Nicolae, Bogdan, et tous les autres amis roumains, pour leur amitié et les bons moments passés ensembles.Mes amis (doctorants et docteurs) de Supélec, parmi lesquels on compte particulièrement Spilios,
Dorin, Veronica, pour leur amitié.
Je ne remercie jamais assez Dragos et mes parents pour leur soutien et leur amour (prouvé surtout dans les moments difficiles). Je remercie au reste de ma famille pour leur soutien.Table des matières
Table des matières
viiiNotationsix
Introduction1
1 La thérapie photodynamique
71.1 Introduction à la thérapie photodynamique
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71.1.1 Historique
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81.1.2 Facteurs régissant l"efficacité du traitement. . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1.1.2.1 Le photosensibilisateur idéal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1.1.2.2 Interaction tissus - lumière. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
1.1.2.3 Oxygène. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
1.1.3 Mécanismes d"éradication tumorale après PDT. . . . . . . . . . . . . . . 18
1.1.4 Condition expérimentale : étudein vivo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
1.1.4.1 Détails sur le modèle animal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
1.1.4.2 Protocole PDT. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
1.2 Phase phototoxique du traitementin vivo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
1.2.1 Réactions photochimiques. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
1.2.2 Construction d"un modèle. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
1.2.3 Comparaison de l"efficacité des photosensibilisants. . . . . . . . . . . . . 33
1.3 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
2 Identifiabilité des paramètres37
2.1 Problème inverse - notions générales. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
2.2 Identification des systèmes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
viTable des matières2.2.1 Discernabilité des structures. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
2.2.2 Identifiabilité des paramètres
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 402.3 Identifiabilitéa priori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
2.3.1 Cadre d"étude de l"identifiabilitéa priori. . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
2.3.2 Définitions de l"identifiabilitéa priori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
2.3.3 Méthodes d"identifiabilitéa priori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
2.4 Identifiabilitéa posteriori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
2.4.1 Cadre d"étude de l"identifiabilitéa posteriori. . . . . . . . . . . . . . . . 45
2.4.2 Définitions de l"identifiabilitéa posteriori. . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
2.4.3 Méthode d"identifiabilitéa posteriorilocale. . . . . . . . . . . . . . . . . 46
2.5 Identifiabilité pratique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
2.5.1 Cadre d"étude de l"identifiabilité pratique. . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
2.5.2 Approche fondée sur l"estimateur des moindres carrés. . . . . . . . . . . 51
2.5.3 Lien avec les plans d"expériences optimaux. . . . . . . . . . . . . . . . . 52
2.5.4 Classification hiérarchique des paramètres identifiables en pratique. . . . 53
2.5.4.1 Classification selon des mesures de sensibilité. . . . . . . . . . 54
2.5.4.2 Classification selon des indices de multicolinéarité. . . . . . . . 54
2.5.4.3 Classifications hybrides. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
2.6 Identifiabilité orientée convergence en probabilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
2.7 Analyse d"identifiabilité du modèle des réactions de type II en photodynamique. . 59
2.7.1 Fonctions de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
2.7.1.1 Approche analytique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
2.7.1.2 Approche numérique (Diffedge©). . . . . . . . . . . . . . . . 61
2.7.2 Identifiabilitéa posteriorilocale. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
2.7.3 Idéntifiabilité pratique locale. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
2.7.3.1 Classifications selon des mesures de sensibilité. . . . . . . . . . 63
2.7.3.2 Classification selon des indices de multicolinéarité. . . . . . . . 63
2.7.3.3 Classification hybride. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
2.7.4 Analyse critique des résultats. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
2.8 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
3 Analyse de sensibilité globale69
Table des matièresvii3.1 Introduction à l"analyse de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
3.1.1 Analyse de sensibilitévsanalyse d"incertitude. . . . . . . . . . . . . . . . 70
3.2 Méthodes d"analyse de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
3.2.1 Méthodes de criblage. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
3.2.2 Analyse de sensibilité locale. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
3.2.3 Analyse de la sensibilité globale. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
3.3 Méthodes fondées sur l"analyse de la variance. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
3.3.1 Notions générales. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
3.3.2 Fonctions de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
3.3.2.1 Mesures de sensibilité pour les modèles linéaires en les paramètres74
3.3.2.2 Mesures de sensibilité pour les modèles non-linéaires. . . . . . 75
3.3.3 Calcul des fonctions de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
3.3.3.1 Algorithme d"estimation des fonctions de sensibilité. . . . . . . 81
3.4 Application au modèle des réactions de type II en PDT. . . . . . . . . . . . . . . 84
3.4.1 Analyse de sensibilité globale. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
3.4.2 Estimation des fonctions de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
3.4.2.1 Échantillonnage de l"espace paramétrique. . . . . . . . . . . . 86
3.4.3 Parallélisation du calcul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
3.4.4 Résultats d"analyse de sensibilité. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
3.4.5 Analyse critique des résultats. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
4 Contributions aux équivalences d"analyses globales91
4.1 Etude bibliographique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
4.2 Correspondances des résultats d"analyse de sensibilité et d"identifiabilité. . . . . . 93
4.2.1 Définitions des fonctionsi,
iet i;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 934.2.2 Fonctions de sensibilité totale nulles. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
4.2.3 Conséquences de la colinéarité des fonctionsietj. . . . . . . . . . . 96
4.2.3.1 Etude de la colinéarité des fonctionsietj. . . . . . . . . . 96
4.2.3.2 Conséquences de la colinéarité des fonctions
i, i;jet jsur la corrélation des fonctions de sensibilité totale,STietSTj. . . . 994.2.3.3 Conséquence de la colinéarité des fonctions
i, i;jet jsur la non-identifiabilité mutuelle des paramètrespietpj. . . . . . . . 99viiiTable des matières4.2.4 Exemples académiques. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
4.2.4.1 Exemple illustrant la non-identifiabilitéa priori. . . . . . . . . 100
4.2.4.2 Exemple illustrant la non-identifiabilitéa posteriori. . . . . . . 102
4.2.5 Etude sur l"injectivité de la réponse. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
4.3 Discussion et Conclusion. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Conclusions107
A Fonctions de sensibilité : approche analytique113 A.1 Calcul des fonctions de sensibilitéSx1;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114 A.2 Calcul des fonctions de sensibilitéSx2;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114 A.3 Calcul des fonctions de sensibilitéSx3;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114 A.4 Calcul des fonctions de sensibilitéSx4;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 A.5 Calcul des fonctions de sensibilitéSx5;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 A.6 Calcul des fonctions de sensibilitéSx6;j. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 A.7 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116 B Estimation des fonctions de sensibilité - Astuces117 B.1 Échantillonnage de l"espace paramétrique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 B.2 Parallélisation du calcul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 C Méthode d"identifiabilité par série Taylor121Liste des figures128
Liste des tableaux129
Bibliographie142
Notations
Typographie
Minuscule ordinaire scalaire
Minuscule grasse vecteur colonne - les vecteurs ligne s"écriront comme des vecteurs colonne transposésMajuscule grasse matrice
Majuscule relief ensemble (par exempleP,R,T,U)
a ii-ème composante du vecteura m i;jélément situé à l"intersection de la i-ème ligne et de la j-ème colonne de la matriceM M1inverse de la matriceM
MTetmttransposée de la matriceMet du vecteurm
j·jnorme k·knorme euclidienne [·]concentration d"un espèce (exprimée enMoumM)Abréviations et acronymes
EROespèce réactive de l"oxygène
Hphématoporphyrine
HpDhématoporphyrin dérivée
HDMRHigh Dimensional Model Representation
i.i.d.indépendantes et identiquement distribuéesIDLintervalle drogue - lumière
PDTPhotoDynamic Therapy
PSphotosensibilisateur, agent photosensibilisant
u.aunité arbitraire. v.a.variable aléatoireVTPVasculat Targeted Photodynamic Therapy
U87lignée tumorale (glioblastome multiforme humain). xNotationsSymboles et fonctions ^aestimation de l'aire d'une gaussienne; aetS0coefcient d'absorption dcoefcient de diffusion tcoefcient total d'attenuation (t=a+d) argmaxJ()valeur (ou ensemble des valeurs) dequi maximiseJ(·) argminJ()valeur (ou ensemble des valeurs) dequi minimiseJ(·) cond(·)conditionnement d'une matrice det(·)determinant d'une matrice décart entreet0,d=0
"coefcient d'extinction e yerreur de sortieFmatrice d'information de Fisher
F spectre de uorescence hconstante de Planck (6:623·1034J·s) IFintensité de uorescence (u:a:)
longueur d'onde (nm) min(M)la plus petite valeur propre de la matriceM max(M)la plus grande valeur propre de la matriceMM(·)structure de modèles
M()modèle de structureM(·)et de paramètres fréquence d'onde (=c=) n pnombre de paramètres n unombre d'entrées (dimension deu) n xnombre de variables d'état n ynombre de sorties N(m;v)distribution d'une variable aléatoire normale (ou gaussienne) de moyennemet de variancevNnombre de temps de mesure
N vecteur des paramètres à estimer (de dimensionnp) pvecteur des paramètres normalisés (de dimensionnp) et appartenantà[0;1]np
Pensemble paramétrique admissiblea priori
vraie valeur des paramètres bestimée des paramètres associée à un optimum globale deJ(·)0valeur nominale des paramètres
vecteur d'hyperparamètres (par exemple termes de pondération àchoisir par l'utilisateurSuite page suivante
NotationsxiQmatrice de pondération (diagonale)
R2kcoefficient de détermination entre les spectres mesurés et estimés (à
l"instanttk)Ssystème
s y;itk;0;ula fonction de sensibilité de la sortiey(tk;;u)par rapport au para- mètreiet dans le voisinage de0, pourudonnée et à l"instanttk. Correspondant à un élément de la matrice de sensibilité,Sy(k;i) s y;icolonne de la matrice de sensibilitéSy,sy;i=sy;1tk;0;u;:::;sy;itN;0;uT sy;itk;0;ufonction de sensibilité normalisé,sy;i=@y(tk;;u)@ i=0·0i ~sy;itk;0;ufonction de sensibilité logarithmique,~sy;i=@lny(tk;;u)@lni=0 sy;itk;0;ufonction de sensibilité logarithmique normalisée,sy;i=~sy;ik ~sy;ik S y0;umatrice de sensibilité de la sortieypar rapport aux paramètres, éva- luée en0, aux instants de mesureft1;:::;tNget pour(u;x0)don- nées S i(t)Fonction de sensibilité (globale) de la sortie par rapport à l"effet di- rect du paramètrepi S Ti(t)Fonction de sensibilité (globale) totale de la sortie par rapport au pa-ramètrepi ^estimation de la largeur d"une gaussienneS,Tdurées de vie moyennes du PS à l"état singulet excité, respectivementtriplet excité
t; tkvariable indépendante (généralement le temps), prenant éventuelle-ment des valeurs discrètes.
toltolerance (MATLAB©) pour le calcul du rang d"une matriceTpériode du signal d"entrée
T spériode d"échantillonnage d"un système à temps continuTensemble des instants de mesure,ft1;:::;tNg
tr(M)somme des éléments diagonaux de la matrice carréeM tLtemps d"exposition à la lumière
t offdemi-périodes ou le laser est éteint (protocole PDT) uLéclairement énergétique ("fluence rate", souvent traduite par irra-diance et correspondant à une densité de puissance lumineuse parunité de surface) (W/cm2)
U(a;b)loi uniforme entreaetb
u Ovitesse d"incorporation de l"oxygène (mM·s1) uPvitesse d"incorporation du PS (mM·s1)
V0un voisinage deSuite page suivante
xiiNotationsvAvitesse d"absorption des photons
V(t)variance totale de la sortieypar rapport au paramètres V i(t)variance "de premier ordre" de la sortieypar rapport au paramètrepi V Ti(t)variance "totale" de la sortieypar rapport au paramètrepi v.a.i.variables (ou vecteurs) aléatoires indépendant(e)s xvecteur d"état (de dimensionnx) y m(tk)vecteur de mesure des variables de sortie du système y(t;)vecteur des sorties modèle correspondant ày(t) \b CISrendement quantique de la conversion intersystème \b rendement quantique de production de l"oxygène singulet \bFrendements quantique de fluorescence
\bPrendement quantique de phosphorescence
effefficacité du transfert d"énergie ifonction représentant l"effet total sur la sortieyvis-à-vis du para- mètrepi v(tk)regroupe les effets conjugués des bruits de mesure, des perturbationsenvironnantes et des erreurs numériques de simulationPrincipales variables de la phase photocytotoxique
Symb.DescriptionUnitÈ
vAVitesse d"absorption des photonsmM·s1u
PVitesse d"incorporation du PSmM·s1u
OVitesse d"incorporation d"oxygènemM·s1u
LIrradiancemW·cm2yIntensité de fluorescenceu:a S0]PS. intracellulaire à l"état reposmM
S1]PS. intracellulaire à l"état singulet excitémM
T1]PS. intracellulaire à l"état triplet excitémM
3O2]Oxygène à l"état triplet reposmM
1O2]Oxygène à l"état singulet excitémM
M]Substrat organique intracellulairemM
NotationsxiiiPhotoréactions de la PDT :
No.Type de rÈactionRÈaction photochimiqueVitesse1Absorption (A)S
0+hA!S1k
A·uL·[S0]2Conversion Interne (CI)S
1CI!S0k
CI[S1]3Fuorescence (F)S
1!S0+hFk
F[S1]4Conversion Intersystème (CIS)S
1CIS!T1k
CIS[S1]5Phosphorescence (P)T
1!S0+hPk
P[T1]6Conversion Intersystème2(TS)T
1TS!S0k
TS[T1]7Luminescence (L)1
O2!3O2+hLk
L[1O2]8Transfert d"énergie (T)T
1+3O2!S0+1O2k
T[T1] [3O2]9Photoblanchiment (Pb)1
O2+S0!3O2+P(O)k
Pb[1O2] [S0]10Oxydation (ox)1
O2+M!3O2+M(O)k
ox[1O2] [M]11Réaction entreS1etM(SM)S1+M!Photoproduitsk
SM[S1] [M]12Réaction entreT1etM(TM)T
1+M!Photoproduitsk
TM[T1] [M]
xivNotationsIntroduction
Les travaux présentés dans ce mémoire ont été développés au Centre de Recherche en Automatique
de Nancy (Nancy-Université, CNRS UMR 7039) au sein du groupe thématique "Identification,Restauration, Images et Signaux" et en collaboration avec le groupe thématique "Ingénierie pour
la Santé". Ils s"inscrivent dans le cadre de la Biologie Intégrative, domaine de recherche interdisci-
plinaire né au début des années2000. Cette discipline a pour but d"étudier le fonctionnement d"un
organisme vivant en recueillant des données biologiques quantitatives utilisées ensuite pour éla-
borer des modèles mathématiques, explicatifs et prédictifs pouvant servir à des fins thérapeutiques.
Le cancer est un terme général appliqué à un grand groupe de maladies qui peuvent toucher n"im-
porte quelle partie de l"organisme. L"une de ses caractéristiques est la prolifération rapide de cel-
lules anormales qui peuvent essaimer dans d"autres organes, formant ce qu"on appelle des mé- tastases. Le cancer est une des principales causes de décès dans le monde et le nombre de cas augmente. Ainsi, l"organisation mondiale de la santé (OMS) prévoit une augmentation de 45% dunombre de décès par cancer dans le monde entre2007et2030(de7:9à11:5millions), en partie à
cause de l"accroissement et du vieillissement de la population. De plus, il est estimé que le nombre
de nouveaux cas passera de11:3millions en2007à15:5millions en2030. Malgré les avancéesscientifiques dues notamment au génie chimique, au génie génétique et au génie biomédical, cette
maladie reste encore un verrou scientifique majeur.Le sujet de thèse traite de la modélisation de la phase photocytotoxique de la thérapie photody-
namique (PhotoDynamic Therapy, PDT), utilisée et développée au Centre Alexis Vautrin (Centre
de Lutte Contre le Cancer de Nancy) pour traiter certains cancers. La thérapie photodynamiqueutilise un agent photosensibilisant (photosensibilisateur, PS), injecté aux patients, qui se concentre
dans les tissus pathologiques. Cet agent est ensuite activé par une lumière d"une longueur d"onde
précise produisant, après une cascade de réactions, des espèces réactives de l"oxygène dont l"oxy-
gène singulet (l"espèce cytotoxique) qui endommagent les cellules cancéreuses. L"efficacité et la
reproductibilité des réponses de cette thérapie reposent principalement sur les propriétés chimiques
et photobiologiques du photosensibilisateur, les conditions d"illumination, la disponibilité en oxy-
gène et la sensibilité intrinsèque de la cible. La contribution relative de chacun de ces facteurs a
des conséquences sur l"efficacité du traitement.2INTRODUCTIONLa complexité de cette thérapie est liée au fait que les espèces cytotoxiques sont généréesin situ.
Plusieurs autres facteurs viennent s"ajouter, comme l"hétérogénéité spatiale dans la tumeur du pho-
tosensibilisateur et de l"oxygène (due à la vascularisation inhomogène des différentes zones de la
tumeur) et de la lumière (hétérogénéité des propriétés optiques des tissus, absorption lumineuse
par les fluorophores endogènes et par le PS qui limite la pénétration de la lumière). En outre, dif-
férents facteurs qui influencent le traitement, comme la disponibilité en oxygène, la concentration
et localisation du photosensibilisant et les propriétés optiques des tissus, varient au cours du temps.
Un des axes de développement de la PDT est la mise au point de nouveaux agents photosensibili-sants. Il existe plusieurs façons d"évaluer leur efficacité, dont une concerne leur capacité à produire
des espèces cytotoxiques. La comparaison de l"activité cytotoxique des agents photosensibilisants
repose usuellement sur celle d"indicateurs photophysiques comme les rendements quantiques del"oxygène singulet, les temps de vie moyens des différentes espèces et le coefficient d"absorption
du photosensibilisateur dans la région spectrale de la lumière d"excitation. Ces indicateurs sont
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