[PDF] SYLLABUS MASTER Mention Biologie-Santé M2 immunologie et

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ERIODE D'ACCREDITATION : 2022 / 2026

UNIVERSIT

E PAUL SABATIERSYLLABUS MASTER

Mention Biologie-Sante

M2 immunologie et maladies infectieuseshttp://www.fsi.univ-tlse3.fr/

2022 / 2023

26 MAI 2023

SOMMAIRE

PR ESENTATION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 PR ESENTATION DE LA MENTION ET DU PARCOURS. . . . . . . . . . . . 3

Mention Biologie-Sante

3

Parcours

3 PR ESENTATION DE L'ANNEE DE M2 immunologie et maladies infectieuses. . 3

RUBRIQUE CONTACTS

4

CONTACTS PARCOURS

4

CONTACTS MENTION

4

CONTACTS D

EPARTEMENT : FSI.BioGeo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4

Tableau Synthetique des UE de la formation

5

LISTE DES UE

7

GLOSSAIRE

16

TERMES G

ENERAUX. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

TERMES ASSOCI

ES AUX DIPLOMES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

TERMES ASSOCI

ES AUX ENSEIGNEMENTS. . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 2 PR

ESENTATIONPR

ESENTATION DE LA MENTION ET DU PARCOURS

MENTION BIOLOGIE-SANT

E

La mention de master Biologie-Sante est une formation par et pour la recherche, qui a pour but de donner aux

futur.e.s dipl^ome.e.s les basesconceptuelles,technologiquesetreglementairesles plus recentes pour l'etude

desmaladies chroniques multifactorielleset l'elaboration de nouvellesinnovations therapeutiques.

Les processus physiologiques et pathologiques etant par denition complexes, leur comprehension sera abordee par

une approche a dierents niveaux d'etude (molecules, cellules, environnement physique, organismes, populations)

et resolument pluridisciplinaire, associant les disciplines de la Biologie (biochimie, biologie moleculaire et cellulaire,

physiologie, epidemiologie...) a des disciplines permettant l'etude de la complexite (bioingenierie, bioinformatique,

modelisation mathematique...).

Les enseignements visent aussi a sensibiliser les etudiant.e.s au necessaire continuum entre recherche fondamen-

tale, recherche clinique et developpement therapeutique; ce lien etant indispensable a la mise en place d'une

medecine 4P (preventive, predictive, personnalisee et participative).

PARCOURS

Ce parcours donne une formation en immunologie au sens large : immunologie fondamentale (developpement

du systeme immunitaire, adaptation de la reponse immunitaire a l'agression subie, transduction de signal, an-

tigenes non conventionnels, immunite innee), les maladies auto-immunes (polyarthrite rhumatode, sclerose en

plaques, diabete auto-immun), la transplantation (alloreactivite, rejet de gree, maladie du greon contre l'h^ote),

l'immuno-virologie (les interactions multiples et bidirectionnelles entre les virus et le systeme immunitaire), les

infections bacteriennes (interactions h^ote/bacteries, mecanismes d'echappement, initiation de la reponse immu-

nitaire, contr^ole de l'expansion des bacteries), d'autres types d'infections (maladie au prion, infections fungiques

et parasitaires).

L'accent est mis sur l'etude des mecanismes impliques, les pathologies humaines associees, les modeles animaux

experimentaux, ainsi que sur les mecanismes d'action des therapies actuelles et en developpement (ex. therapies

genique et cellulaire). PR ESENTATION DE L'ANNEE DE M2 IMMUNOLOGIE ET MALADIES INFECTIEUSES

Laformation theorique(30 ECTS, premier semestre) est constituee d'UE dont 2 mutualisees avec d'autres

parcours. La formation pratique(30 ECTS, deuxieme semestre), consiste en un stage de 5 mois en environnement

professionnel, valide par un rapport ecrit et une soutenance orale en n d'annee. 3

RUBRIQUE CONTACTS

CONTACTS PARCOURS

RESPONSABLE M2 IMMUNOLOGIE ET MALADIES INFECTIEUSES

VAN MEERWIJK Joost

Email :

jo ost.van-meerwijk@inserm.fr

T elephone: 05 62 74 83 81

SECR

ETAIRE PEDAGOGIQUE

ALAYRANGUES Helene

Email :

helene.ala yrangues@univ-tlse3.fr

T elephone: +33 561558966

CONTACTS MENTION

RESPONSABLE DE MENTION BIOLOGIE-SANT

E

DROMARD-BERTHEZENE Cecile

Email :

cecile.droma rd-berthezene@univ-tlse3.fr

T elephone: 05 34 60 95 19

LORSIGNOL-DESMET Anne

Email :

anne.lo rsignol@inserm.fr

CONTACTS D

EPARTEMENT: FSI.BIOGEO

DIRECTEUR DU D

EPARTEMENT

LUTZ Christel

Email :

fsi-dptBG-dir @univ-tlse3.fr

T elephone: 05 61 55 66 31

SECRETARIAT DU D

EPARTEMENT

BLANCHET-ROSSEL Anne-Sophie

Email :

anne-sophie.bla nchet-rossel@univ-tlse3.fr 4

TABLEAU SYNTH

ETIQUE DES UE DE LA FORMATIONpageCode Intitule UEsemestre

ECTSObligatoire

FacultatifTDProjetStageStage ne

Premier semestre

8EIBSI3AM IMMUNOPHYSIOPATHOLOGIEI5O56

9EIBSI3BM MALADIES INFECTIEUSESI9O88

10EIBSI3CM INFLAMMATION ET MALADIES CHRONIQUESI2O16

11EIBSI3DM INSERTION PROFESSIONNELLE,

ETHIQUE, IMMERSION

EN LABORATOIREI3O20

12EIBSI3EM R

EDACTION PROJET RECHERCHE - ANGLAIS SCIENTI-

FIQUEI9O34100

13EIBSI3FM IMMUNO-ONCOLOGIEI2O16

Second semestre

Choisir 1 UE parmi les 2 UE suivantes :

14EIBSI4AMSTAGE EN ENTREPRISEII30O4

15EIBSI4BMSTAGE EN LABORATOIREII30O4

AN:enseignenents annuels,I: premier semestre,II: second semestre 5 6

LISTE DES UE

7

UEIMMUNOPHYSIOPATHOLOGIE5ECTS1

ersemestreEIBSI3AMTD : 56hEnseignement en francaisTravail personnel

69 h[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE

VAN MEERWIJK Joost

Email :

jo ost.van-meerwijk@inserm.fr

OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE

Cette UE vise a bien etablir les connaissances en immunologie fondamentale, puis a mieux apprehender l'im-

munopathologie. Les etudiants travailleront en petits groupes pour preparer des cours sur dierents aspects de

l'immunologie, pour leurs collegues de la promotion. Dans les cours d'autres intervenants, ils presenteront et

discuteront des articles scientiques du domaine. Ainsi, ils atteindront les objectifs de cette UE : bien ma^triser les

bases de l'immunologie et de l'immunopathologie, comprendre et exploiter les modeles experimentauxin vitroetin

vivocommunement utilises dans cette discipline, apprendre les possibilites et les limites de la recherche clinique, et

apprehender les mecanismes d'action des therapies en immunologie, actuellement utilisees et en developpement.

DESCRIPTION SYNTH

ETIQUE DES ENSEIGNEMENTS

L'immunite innee, le developpement du systeme immunitaire (hematopoese, lymphocytes T, B, NK), l'activa-

tion des reponses immunitaires et son contr^ole par les cellules lymphodes innees et les lymphocytes T et B

regulateurs, la dierenciation fonctionnelle des lymphocytes T et B, ainsi que l'aide apportee aux lymphocytes B

par les lymphocytes T seront traites dans un premier temps. Ensuite, des chercheurs et des cliniciens discuteront

l'immunopathologie et ses modeles animaux (ex. asthme allergique, in ammation chronique de l'intestin, sclerose

en plaques, diabete de type I, transplantation). Le developpement d'approches therapeutiques innovantes (ex.

l'immunotherapie cellulaire, la therapie genique) sera presente par ses auteurs.

Une attention importante sera donnee a la demarche scientique. On discutera ainsi des approches experimentales

in vitroetin vivo, de la generation et de l'utilisation de cellules et d'animaux genetiquement modies, des "genome-

wide association studies", des technologies innovantes telles que l'etude de la transcriptomique par "next gene-

ration sequencing", du contr^ole (epi-)genetique de l'expression de genes d'importance en immunologie, etc.

PR

E-REQUIS

Validation d'un M1 dans le domaine de la Biologie/Sante Une tres bonne base en immunologie est requise pour le suivi fructueux de ce module. R

EFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES

"Fundamental Immunology" de W. Paul

MOTS-CL

ES Immunologie, Immunopathologie, Recherche fondamentale, Recherche clinique 8

UEMALADIES INFECTIEUSES9ECTS1

ersemestreEIBSI3BMTD : 88hEnseignement en francaisTravail personnel

137 h[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE

IZOPET Jacques

Email :

izop et.j@chu-toulouse.fr

MALNOU Cecile

Email :

cecile.malnou@univ-tlse3.fr

OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE

Formation destinee a la recherche en maladies infectieuses comprenant des conferences, des presentations d'ar-

ticles et tables rondes/debats autour de themes divers. Plut^ot que de couvrir de facon exhaustive toutes les ma-

ladies infectieuses, ce module vise a approfondir certaines situations d'infections en insistant sur les mecanismes

physiopathologiques et les approches de recherche fondamentale et clinique

DESCRIPTION SYNTH

ETIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Le programme couvre l'analyse de la physiopathologie de l'infection par de nombreux virus (HIV, virus des

hepatites, Cytomegalovirus, virus l'Epstein Barr, Grippe, Virus Bluetongue, Poxvirus, virus neurotropes, Arbovirus

emergents etc...), mais aussi de bacteries (E.coli, Mycobacteries), de parasites (Paludisme, toxoplasmose), voire

m^eme d'agents non conventionnels (Prions). Les etudiants recevront egalement une formation aux approches de

vaccinologie et de therapeutique anti-infectieuses. Un accent particulier sera mis egalement sur le developpement

et la regulation des reponses immunitaires anti-infectieuses. PR

E-REQUIS

Des connaissances de base en infectiologie, acquises par exemple en suivant les UE de M1 de Virologie ou de

Physiopathologie des infections.

R

EFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES

Fields Virology (Lippincott Willaims and Wilkins); Virologie Humaine et Zoonoses (Dunod); Panorama de la

Virologie (Belin);http://viralzone.expasy.org/

MOTS-CL

ES

Maladies infectieuses, Virologie, Bacteriologie, Parasitologie, Reponse immune aux infections, Vaccinologie, Re-

cherche fondamentale, Recherche clinique 9

UEINFLAMMATION ET MALADIES CHRO-

NIQUES2ECTS1

ersemestreEIBSI3CMTD : 16hEnseignement en francaisTravail personnel

34 h[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE

CASTEILLA Louis

Email :

Louis.Casteilla@ inserm.fr

ESPINOSA Eric

Email :

eric.espinosa@inserm.fr

OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE

L'objectif est de demontrer que le systeme immunitaire est un constituant fondamental et incontournable quelle

que soit la physiopathologie envisagee. Une attention particuliere sera apportee aux processus de l'in

ammation et

leur contr^ole, les origines et les mecanismes de leurs dysfonctionnements et les consequenses sur la pathogenese.

Il s'agit ainsi de montrer, en accord avec les donnees recentes et abondantes de la litterature, comment l'in

am- mation s'avere ^etre une composante cle de nombreuses maladies chroniques.

DESCRIPTION SYNTH

ETIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Apres une remise a niveau rapide, dierents themes seront traites sous forme de conferences/echanges. Ces

themes peuvent evoluer d'une annee sur l'autre en fonction de la disponibilite des conferenciers et sont fortement

pluridisciplinaires. A titre d'exemple, voici quelques axes au sein desquels plusieurs themes peuvent ^etre traites :

- In ammation et cancer - In ammation et tube digestif - Immuno-metabolisme - Immunite et atherosclerose - Fibrose et in ammation PR

E-REQUIS

Bases de l'immunite innee et acquise

R

EFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES

Kaminski & Randall (2010)Trends Immunol.31(10) :384-90.

Brezaret al(2011)Endocr Rev.32(5) :623-69.

Lahouteet al(2011)Nat Rev Cardiol.8(6) :348-58.

MOTS-CL

ES In

ammation, immunite innee et acquise, physiopathologie, maladies metaboliques, maladies osteo-articulaires,

maladies cardio-vasculaires, vieillissement 10

UEINSERTION PROFESSIONNELLE,

ETHIQUE,

IMMERSION EN LABORATOIRE3ECTS1

ersemestreEIBSI3DMTD : 20hEnseignement en francaisTravail personnel

55 h[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE

VAN MEERWIJK Joost

Email :

jo ost.van-meerwijk@inserm.fr

OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE

Les etudiants decouvriront la vie de et dans un laboratoire de recherche biomedicale. Ce module contribuera de

facon importante a l'apprentissage des techniques bibliographiques, de la lecture critique des articles scientiques

et de la presentation orale dans un milieu professionnel. Une sensibilisation aux dierents aspects ethiques de la

recherche biomedicale est egalement un des objectifs de ce module. Finalement, les etudiants seront informes des

possibilites d'integration future dans la vie professionnelle dans le public et le prive.

DESCRIPTION SYNTH

ETIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Pendant le premier semestre de la formation, les etudiants seront accueillis par les laboratoires dans lesquels

ils eectueront leur stage de recherche au second semestre. Ils y apprendront les techniques bibliographiques, la

lecture critique des articles scientiques sur le sujet de leur futur stage, la presentation orale d'articles scientiques

et de donnees experimentales, la conduite dans des reunions de laboratoire, la participation a des seminaires scien-

tiques. L'acces aux bases de donnees des laboratoires de recherche est un precieux outil dans cet apprentissage.

Des cours seront aussi donnes sur dierents aspects ethiques de la recherche biomedicale : la deontologie scien-

tique, l'ethique de l'experimentation animale et de la recherche clinique. On abordera egalement la legislation

dans ces domaines. Des presentations sur l'insertion professionnelle des dipl^omes de cette formation seront donnees. PR

E-REQUIS

Validation d'une premiere annee de Master dans le domaine de la Biologie/Sante

MOTS-CL

ES Laboratoire de recherche - ethique - legislation - deontologie 11 UER

EDACTION PROJET RECHERCHE - ANGLAIS

SCIENTIFIQUE9ECTS1

ersemestreEIBSI3EMTD : 34h , Projet : 100hEnseignement en francaisTravail personnel

191 h[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE

VAN MEERWIJK Joost

Email :

jo ost.van-meerwijk@inserm.fr

OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE

Dans cette UE, les etudiants apprendront a rediger, en anglais ou en francais, un projet de recherche (demande

de nancement) dans le domaine de l'immunologie et des maladies infectieuses, mais eloigne de leur sujet de

stage. L'analyse et la synthese critique de la litterature, l'identication d'un sujet d'importance, la redaction d'un

texte introduisant le contexte scientique et la denition de l'objectif et du projet proprement dit, l'ecriture d'un

resume bien structure et qui capte l'attention du lecteur, et la presentation orale du projet a un jury d'experts,

feront partie de cet exercice tres formateur.

Une formation a l'anglais scientique (24h de TD) est integree pour apprendre a presenter des articles scientiques

et a mener une discussion scientique argumentee.

DESCRIPTION SYNTH

ETIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Des specialistes dans le domaine, entre autres des membres de comites scientiques d'associations caritatives,

donneront des cours sur comment convaincre les reviewers de l'inter^et du projet : le choix du sujet, l'importance

de sa positionnement dans le contexte des connaissance actuelles, l'inter^et de bien rediger le resume scientique,

la denition de la strategie experimentale, des erreurs a eviter... Une partie de cet enseignement se deroulera en

Anglais.

Pendant les TD de la formation de l'anglais, un ensemble d'articles relatant les travaux fondateurs de l'immuno-

logie moderne et de la recherche sur les maladies infectieuses, ainsi que les theories qui ont conduit a l'emergence

des grands concepts dans ces domaines scientiques, seront presentes et discutes par les etudiants, en anglais.

PR

E-REQUIS

Validation d'une premiere annee de Master dans le domaine de la Biologie/Sante De bonnes bases en anglais lu, ecrit et parle faciliteront le suivi de ce module.

MOTS-CL

ES Projet de recherche - Presentation orale - Angais scientique - Litterature scientique 12

UEIMMUNO-ONCOLOGIE2ECTS1

ersemestreEIBSI3FMTD : 16hEnseignement en francaisTravail personnel

34 h[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE

JOFFRE Olivier

Email :

olivier.jore@inserm.fr

SEGUI Bruno

Email :

b runo.segui@inserm.fr

OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE

Le systeme immunitaire limite la survenue et la progression des cancers par un des mecanismes dits d'immuno-

surveillance. Pour y echapper, les cellules tumorales et leur microenvironnement developpent des strategies pour

se rendre invisibles aux cellules de l'immunite, desarmer les cellules cytotoxique ou devier la reponse immunitaire

pour induire l'emergence de cellules a activite immunosuppressive ou ayant des fonctions eectrices inadaptees a

leur eradication.

Cette UE pluridisciplinaire (biologie cellulaire, cancerologie, immunologie) donnera les bases moleculaires et cel-

lulaires de l'interrelation entre cellules de l'immunite et tumorales. Les immunotherapies anti-tumorales utilisees

en clinique humaine et les strategies innovantes en developpement seront presentees et discutees.

DESCRIPTION SYNTH

ETIQUE DES ENSEIGNEMENTS

L'UE debutera par une mise a niveau des connaissances et concepts necessaires en Immunologie et en oncolo-

gie, suivie d'une presentation de l'interrelation entre cellules tumorales et systeme immunitaire. Les acteurs de

l'immunite innee et adaptative, impliquees de facon positive ou negative dans le maintien de l'integrite de l'orga-

nisme contre les tumeurs, seront presentes, notamment les mecanismes d'immunosurveillance, d'immuno-editing

et d'echappement tumoral.quotesdbs_dbs10.pdfusesText_16

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