Le Caroubier au Maroc : un arbre davenir
autres cultures. Ces régions pourraient devenir des centres de production des caroubes au. Maroc. Aucune raison ne s'oppose à la réussite du caroubier dans
Production de plants sélectionnés et greffés de caroubier
Le caroubier (Ceratonia siliqua) est une espèce Les fleurs du caroubier marocain seraient plutôt ... La culture in vitro une technique pro- metteuse.
Effet du 24-D sur linduction de lembryogenèse somatique à partir
Des programmes importants d'intensification et d'exten- sion de la culture de caroubier sont prévus dans le cadre du Plan Maroc Vert.
plantation de lolivier et du caroubier a beni chiker province de nador
Royaume du Maroc le caroubier du Maroc est parmi le meilleur du monde. ... culture de cet arbre est propagée à travers le monde;.
du Maroc
La diversité culturelle transmise à travers les générations et la grande Les fruits du caroubier sont exploités dans la fabrication de la farine ...
Fiche présentation arbre : Ceratonia siliqua (°) Noms vernaculaires
en graine de plus de 20%. Celui des autres pays est de 10%. Le Maroc de par les caractéristiques de sa faune
Du nouveau sur lhistoire du caroubier - HAL AMU
21 mar. 2020 Les caroubiers au nord du Maroc qu'ils soient sauvages ou cultivés
La filière caroubier au service du développement socio-économique
6 sept. 2015 La présence du caroubier au Maroc est limitée aux piémonts (lisière nord) de la ... en zones pluviales par la culture du caroubier et (iii) ...
THESE DE DOCTORAT Diversité Phénotypique et Moléculaire du
Contribution à l'amélioration de la culture du caroubier (Ceratonia siliqua Amélioration des Plantes et Sécurité Alimentaire Marrakech (Maroc) 7 au 9 ...
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AU MAROC e caroubier (Ceratonia siliqua L.) est un arbre dont l'aire de répartition s'étend dans produits différents : la poudre et la gomme de caroube.
[PDF] Le Caroubier au Maroc : un arbre davenir
Les caroubiers commencent à fructifier à la 5ème ou à la 6ème année lorsque la plantation est réalisée avec des plants greffés et à la 7ème ou 8ème année
[PDF] Production de plants sélectionnés et greffés de caroubier
Les fleurs du caroubier marocain seraient plutôt unisexuées; la forme hermaphrodite reste rare dans la partie côtière méditerranéenne de l'Espagne
(PDF) le caroubier au Maroc un arbre davenir - ResearchGate
14 fév 2017 · PDF The carob tree has advantages both ecologically biologically agronomically genetically and socio-economically
[PDF] Le caroubier : - doc-developpement-durableorg
Au Maroc cette espèce peuple les étages de végétation du type thermo et mésoméditerranéen Les peuplements de caroubier se rencontrent dans le Rif occidental
[PDF] Fiche présentation arbre : Ceratonia siliqua (°) Noms vernaculaires
Le caroubier est cultivé dans les pays méditerranéens notamment en Espagne et en Italie du sud (Sicile) Le Maroc est le deuxième pays
[PDF] filiere caroubier - INRA
AU MAROC 42 ET N°84 Janvier 2010 L e caroubier (Ceratonia siliqua L ) est un arbre dont l'aire de répartition s'étend dans
[PDF] Le caroubier une espèce méditerranéenne à usages multiples
Cette espèce ligneuse a été domestiquée depuis le néolithique (4000 ans avant J C ) et sa culture extensive date au moins de 2000 ans avant J C (BATLLE et
(PDF) Le caroubier un arbre davenir Hassan Sbay - Academiaedu
Download Free PDF View PDF Rev Associ Forum Nord Maroc Essais de culture in vivo du caroubier (Ceratonia siliqua L ) originaire du Nord-ouest du Maroc
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7 juil 2020 · La caroube est l'une des cultures fruitières les plus importées des pays méditerranéens Leurs productions et consommations a
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Au Maroc il y'a deux types de cultivars du caroubier 'lanta' qui est le type greffé et 'dkar' le type sauvage En effet les populations spontanées permettent
Où planter le caroubier au Maroc ?
Le caroubier est particulièrement abondant dans certaines zones (Marrakech, El ksiba, Khenifra, Beni Mellal, Meknès, Essaouira, Elhaouz, Kasba Tadla,..), il offre le moyen, aux agriculteurs de cette région, de mettre en valeur des terrains inutilisables pour toutes autres cultures.Comment cultiver la caroube ?
Multiplication du caroubier
1Semez dans un pot profond rempli de vermiculite humide ou dans un mélange de sable et de tourbe.2Placez près d'une fenêtre éclairée, à 20 °C minimum.3Arrosez sans excès.4Attention, lors du repiquage à ne pas casser la racine pivotante.Quel climat pour le caroubier ?
D'une exposition ensoleillée ou un peu ombragée ; D'un sol bien drainé, même si ce dernier est sec et pauvre. De chaleur : l'arbre n'est pas très rustique et supporte plutôt mal le gel et les températures négatives. S'il est bien protégé, le caroubier pourra se contenter d'un climat doux.- Le caroubier (Ceratonia siliqua), appelé parfois pain de saint Jean Baptiste ou figuier d'Egypte est un arbre au port étalé et arrondi, originaire des régions les plus chaudes du bassin méditerranéen et s'il est aujourd'hui naturalisé en Provence, ce n'est que de Menton à Nice.
UNIVERSITE MOHAMMED V-AGDAL
FACULTE DES SCIENCES
RABATTHESE DE DOCTORAT
Présentée par
Ibrahim KONATE
Discipline : Biologie
Spécialité : Biotechnologie et Biologie Moléculaire Diversité Phénotypique et Moléculaire du Caroubier (Ceratonia siliqua L.) et des Bactéries Endophytes qui lui sont AssociéesSoutenue le 14 Juillet 2007
Devant le jury :
Pr. Abdelkaim FILALI-MALTOUF
Professeur à la Faculté des Sciences de RabatPr. El Bekkay BERRAHO
Professeur à la Faculté des Sciences de RabatPr. Ahmed LAMARTI
Professeur à la Faculté des Sciences de TétouanDr Mohamed ABOUROUH
Chef du Centre de Recherches Forestières (CRF)
Pr. Mustapha ARAHOU
Professeur à la Faculté des Sciences de RabatExaminateurs
Président
N° d'ordre: 2353
2 A l'Etat marocain et particulièrement à Sa Majesté le Roi Mohammed VI, que Dieu le protège, pour sa noble politique du développement humain et de coopération Sud- Sud dont bénéficie la jeunesse africaine sub-saharienne pour y acquérir de bonnes formations universitaires et professionnelles. A l'Etat ivoirien et principalement au Ministère de l'Enseignement Supérieur pour l'octroi d'une bourse d'étude durant mes cinq années de Thèse. 3DEDICACES
Cette thèse est un Hommage à mon regretté pèreEl Haj KONATE Lassina
Il était un pilier solide et incontournable pour ma personne et mon parcours estudiantin, qu'il se repose en paix du Dieu, amen !!! Ma profonde reconnaissance à ma chère épouse pour son soutien sans faille, sa grande indulgence, sa compréhension et surtout sa contribution dans le partage de stress de la recherche et de la vie quotidienne de l'étranger. Enfin, mes vifs remerciements à ma chère mère, à mon oncle KONATE Mamadou et son ami COULIBALY Abdourahaman, à mes frères et soeurs, KONATE Broulaye, K.Salia, K. Arna, K.
Djamal dine, K. Aboubakar, K. Abasse, K. Mamadou, K. Brahim, K. Sarata, K. Zakaria, pour leur soutien moral et financier. 4AVANT PROPOS
Les travaux présentés dans cette thèse ont été effectués au Laboratoire de Microbiologie et
Biologie Moléculaire (L.M.B.M.) de la Faculté des Sciences, Université Mohammed V- Agdal,Rabat.
L'encadrement scientifique de ce travail a été assuré par Mr. El Bekkay BERRAHO, Professeur de Microbiologie à la Faculté des sciences de Rabat. Je tiens vivement à lui exprimer ma profonde reconnaissance et gratitude pour sa disponibilité, sa patience, sacompréhension, ses qualités humaines et ses intérêts portés pour mon sujet de recherche.
Mes remerciements les plus chaleureux et fraternels au président du jury, le Professeur Adbelkarim FILALI-MALTOUF, directeur de recherche et responsable du Laboratoire de Microbiologie et Biologie Moléculaire (L.M.B.M.). Ses apports scientifiques et logistiques ainsi que ses rapports humains dans le suivi et la réalisation de mes travaux de recherche ont été d'une qualité supérieure et fructueuse. Mes remerciements vont aussi à Mr Mustapha ARAHOU, Professeur à la faculté des Sciences de Rabat, d'avoir eu l'amabilité d'accepter volontairement et aimablement de critiquer et de juger ce travail. Je suis particulièrement reconnaissant et honoré par sa participation au jury de cette thèse. Je tiens à remercier également Mr Ahmed LAMARTI, Professeur à la Faculté des Sciences de Tétouan, d'avoir accepté, malgré ses préoccupations et ses tâches d'enseignement et d'encadrement, de lire et de juger ce travail. Qu'il trouve ici me s sincères sentiments de gratitude et de respect. Que Mr Mohamed ABOUROUH, Docteur d'Etat et Chef du Centre de Recherches Forestières (CRF), trouve ici l'expression de ma profonde reconnaissance et mes sincères remerciements, d'avoir ménagé son temps pour juger et critiquer ce travail. Au Personnel de l'Ambassade de la Côte d'Ivoire à Rabat (Maroc), notamment S. Ex. Daouda DIABATE, S. Ex. Sia Bi SEI, S. Ex. Atchimon AKE C.D., Mr. Kouadio Bi Gole MICHEL, Mr. Check Ibrahim BAKAYOKO, Mahi ROLALD, ...., pour leur politique de proximité et leur compétence. Au Pr. Jamal AURAG que j'apprécie et admire beaucoup et à tous les enseignants chercheurs du L. M. B. M., Fatiha BRHADA, Jamila MAÂTALLAH, Bouchra BELKADI et Ilham BOUHMOUCH, pour leur soutien et les conseils scientifiques prodigués. 5 Mes sentiments les plus profonds et remerciements infinis à mes collègues et amis du L. M. B. M., pour les relations amicales, conviviales, fraternelles et professionnelles qu'ils ont su tisser en dehors et au sein du laboratoire. Je tiens à exprimer ma profonde gratitude à Ibtissam EL-HILALI qui est exceptionnelle, Jamal Eddine EL JAMALI, Amal BERKIA, LeilaMEDRAOUI, Laila SBABOU, Amina SO
ROURI, Bouchra MOUHCINE, Loubna
TEMSAMANI, Nargisse BENNANI, Najla ELAAFI, Farah AITOUNMANE, Siham BRHADA etSalwa MOUSSAD.
Enfin à tous mes compatriotes et amis qui ont rendu mon séjour au Maroc si agréable, plein d'encouragement, d'espoir et de compréhensions. 6Préambule
Ce travail s'inscrit dans le cadre de la valorisation du caroubier, essence forestière vigoureusement recommandée dans les programmes de reboisement aussi bien pour ses performances écologiques que pour son im portance économique pour les populations rurales. Il a bénéficié du soutien financier de la part de : Projet PROTAS I, P2T2/24 (2001-2004) : Valorisation de la culture du caroubier dans les régions nord du Maroc par le biais de la multiplication in vitro et l'exploitation de la fixation biologique de l'azote. Aire développement (2002- 2006) : IRD n° 01-2-MAR-28-1 : " Diversité phénotypique et moléculaire des accessions de caroubier provenant de différentes régions duMaroc».
Les travaux effectués au cours de cette Thèse ont contribué aux publications et communications orales et affichées suivantes:Publications:
- Ibrahim Konaté, Abdelkarim Filali-Maltouf and El Bekkay Berraho , (2007). Diversity analysis of Moroccan carob (Ceratonia siliqua L.) accessions using phenotypic traits andRAPD markers. Acta Botanica
Malacitana, vol. x, 2007 (Sous press).
- Ibrahim KONATE, El Bekkay BERRAHO, and Adbelkarim FILALI-MALTOUF. 2007. Phenotypic and molecular diversity among Ceratonia siliqua L. accessions originating from different areas ofMorocco. (à soumettre)
Communication orale:
- Ibrahim KONATE, El. BERRAHO, M. ABOUROUH, H. SBAI et A. FILALI-MALTOUF: Valorisation, conservation et amélioration de la culture du caroubier (Ceratonia siliqua L.): Culture in vitro et étude de la diversité morphologique et moléculaire du caroubier et debactéries hébergées par la plante. Première Rencontre du Pôle de Compétence MisoBio,
Fès (Maroc) 10- 11 décembre 2004.
Communications affichées
- Ibrahim KONATE, Amina SOROURI, El Bekkay BERRAHO and Abdelkarim FILALI- MALTOUF: Isolation and characterization of endophytic bacteria associated with root and epicotyls of carob tree (Ceratonia siliqua L.). 7 thEuropean Nitrogen Fixation Conference.
University of Ararhus - Denmark. 22- 26: July 2006. 7 - Ibrahim KONATE, B. BERRAHO, M. ABOUROUH, H. SBAI et A. FILALI-MALTOUF: Etude de la diversité morphologique et moléculaire du caroubier (Ceratonia siliqua L.). Première Rencontre du Pôle de Compétence MisoBio, Fès (Maroc) 10- 11 décembre 2004 - Ibrahim KONATE, B. BERRAHO, M. ABOUROUH, H. SBAI et A. FILALI-MALTOUF: Molecular characterization of the carob tree (Ceratoni siliqua L.) using RAPD marker. 7° National Biotechnology Congress, University of Cataria (Italia) 8- 10 September 2004. - Ibrahim KONATE, B. BERRAHO, M. ABOUROUH, H. SBAI et A. FILALI-MALTOUF: Diversity among carob (Ceratonia siliqua L) accessions from different areas of Morocco. 6ème
Congrès Européen sur la Fixation de l'Azote, Toulouse (France) 24- 27 juillet 2004 - Ibrahim KONATE, B. BERRAHO, M. ABOUROUH, H. SBAI et A. FILALI-MALTOUF: Identification du polymorphisme moléculaire chez le caroubier (Ceratonia siliqua L.): utilisation des marqueurs RAPD. 3ème
Congrès National de Génétique et Biologie Moléculaire, Tanger (Maroc) 18- 20 décembre 2003 - Ibrahim KONATE, B. BERRAHO, M. ABOUROUH, H. SBAI et A. FILALI-MALTOUF: Contribution à l'amélioration de la culture du caroubier (Ceratonia siliqua L.) via la multiplication végétative in vitro. VIIIèmes
Journées Scientifiques du Réseau Biotechnologies, Amélioration des Plantes et Sécurité Alimentaire, Marrakech (Maroc) 7 au 9 octobre 2002. 8Résumé
L'étude de la diversité du caroubier, collecté de différentes régions du Maroc, a révélé un polymorphisme élevé. L'analyse des caractères morpho-agronomiques ainsi que l'analyse de la variabilité tégumentaire des graines, ont permis d'identifier 3 groupes distincts au sein des accessions étudiées. Par ailleurs, nous avons mis au point un protocole d'extraction de l'ADN génomique du caroubier, déterminé les conditions optimales pour l'amplification par PCR et évalué la diversité génétique par deux techniques: RAPD et ISSR. La RAPD, plus discriminante, a permis de montrer un polymorphisme génétique inter accessions très élevé. En outre, l'analyse cumulant les données ISSR, RAPD et duretétégumentaire, a généré une phylogénie analogue à celle révélée par la RAPD.
Concernant la caractérisation des bactéries endophytes du caroubier, une grandevariabilité génétique a été révélée par Rep-PCR. L'analyse du gène ADNr 16S des
souches représentants les groupes Rep, a permis d'identifier 6 groupes dont deux sont rapprochés aux souches de référence du genre Rhizobium. Phénotypiquement, ces bactéries présentent des caractères morphologiques et physiologiques semblables à ceux des rhizobia. Mot clés: Caroubier, bactéries endophytes, polymorphisme génétique, diversité phénotypique. 9ABRÉVIATION
ADN Acide désoxyribonucléique
ADNr ADN dont la transcription donne lieu à l'ARN ribosomalARN Acide ribonucléique
ARNr ARN ribosomale
dNTP Désoxyribonucleide triphosphateARNase Enzyme qui digère l'ARN
Taq De Thermus aquaticus (bactérie qui vit dans les sources chaudes)°C Degré Celsius
% Pourcentage g Gramme mg Milligrammeµg Microgramme
ng Nano gramme ml Millilitreµl Microlitre
M Molaire
mM Millimolaireµmol Micromole
pmol Pico mole cm Centimètre mm Millimètreµm Micromètre
h Heure min Minute s SecondeU Unité
DO Densité optique
pb Paire de base kb Kilo baseUV Ultra violet
V Volt
rpm Rotation par minuteTH Température d'hybridation
bv biovar 10 TyTriptone Yest Extract
YEM Yest Extract Mannito
Mg Cl 2Chlorure de Magnesium
BSA Bovine Serum Albumin
EDTA Ethyl Diamine Tétra acétyle
CTAB Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide
PEG Polyéthylène glycol
MES Acide sulfonique 2N-Morpholino-éthane
MOPS Acide sulfonique 3N-Morpholino-propane
SDS Sodium Dodecyl Sulfate
TBE Tampon Tris - Borate- EDTA
TE Tris - EDTA
BET Bromure d'Ethidium
AlCl 3Chlorure d'aluminium
CdCl 2Chlorure de cadmium
CoCl 2Chlorure de cobalt
HgCl 2Chlorure de mercure
MnCl 2Chlorure de manganèse
ZnCl 2Chlorure de zinc
NaCl 2Chlorure de sodium
AFLP Polymorphisme de Longueur de Fragments Amplifiés ARDRA De 'Amplified Ribosomal DNA - Restriction Analysis'PCR Reaction de Polymerisation en Chaine
RAPD Polymorphisme de l'ADN Amplifié au Hasard
PFLP Polymorphisme de Longueur de Fragments de Restriction PEP/PCR De 'Repetitve Extragenetic Palindromic - PCR' SSR Séqueces Simples Répétées ou MicrosallitesISSR De 'Inter - Simple Sequence Repeat'
D Diversité
P Polymorphe
M Monomorphe
11SOMMAIRE
Introduction Générale
17Chapitre I: Revue bibliographique
1. PRESENTATION DU CAROUBIER:
Ceratonia siliqua L. 20
1. 1. Taxonomie 20
1. 2. Données botaniques 20
1. 3. Reproduction biologique 23
2. ORIGINE ET REPARTITION GEOGRAPHIQUE 23
2. 1. Origine du caroubier 23
2. 2. Distribution géographique du caroubier 24
3. PROPRIETES ET UTILISATIONS 25
3. 1. Propriétés 25
3. 2. Utilisations du caroubier 27
3. 2. 1. Arbre 27
3. 2. 2. Fruit 28
3. 2. 2. 1. Pulpe 28
3. 2. 2. 2. Graines 29
3. 2. 3. Feuilles 30
3. 2. 4. Ecorce 30
4. AIRE DE PRODUCTION 30
5. PROPAGATION DU CAROUBIER ET CONCEPTION DU VERGER 31
5. 1. Propagation du caroubier 32
5. 1. 1. Germination des graines 32
5. 1. 2. Propagation végétative: bouturage 32
5. 2. Conception du verger 35
6. RESSOURCES ET DIVERSITE GENETIQUE 35
6. 1. Ressource et variabilité génétique
6. 2. Amélioration génétique
356. 3. Quelques outils pour l'amélioration des ressources génétiques 37
6. 3. 1. Polymorphisme de plante 38
6. 3. 1. 1. Polymorphisme phénotypique 38
126. 3. 1. 1. 1. Polymorphisme agronomique 39
6. 3. 1. 1. 2. Variabilité de la taille du génome ou polyploïdie 39
6. 3. 1. 2. Polymorphisme biochimique 41
6. 3. 1. 3. Polymorphisme moléculaire 41
6. 3. 1. 3. 1. RFLP: Restriction Fragment Length Polymorphism 42
6. 3. 1. 3. 2. RAPD: Random Amplified Polymorphic ADN 42
6. 3. 1. 3. 3. Microsatellites ou SSR (Simples Sequence Repeats) 44
6. 3. 1. 3. 4. ISSR: Inter-Simple Sequence Repeat 45
6. 3. 1. 2. 5. AFLP: Amplified Fragment Length Polymorphism 45
7. CONSERVATION DU CAROUBIER 46
Chapitre II: Etude du polymorphisme phénotypique du caroubier1. INTRODUCTION 49
2. MATERIEL ET METHODES 49
2. 1. Matériel végétal 49
2. 2. Marqueurs morpho-agronomiques 50
2. 3. Variabilité dans la dureté tégumentaire des graines 51
2. 3. 1. Scarification à l'aide de l'acide sulfurique 51
2. 3. 2. Scarification par l'eau bouillante 51
2. 3. 3. Analyse des données 51
4. RESULTATS ET DISCUSSION 52
4. 1. Diversité agro-morphologique inter-accession 52
4. 1. 1. Observation de l'aspect des gousses 52
4. 1. 2. Mesure des variables agro-morphologiques 55
4. 1. 3. Relation génétique inter-accession 60
4. 2. Variabilité de la dureté tégumentaire des graines 62
4. 2. 1. Aspect des graines 62
4. 2. 2. Différence dans la dureté du manteau des graines 62
Chapitre III: Etude du polymorphisme moléculaire1. INTRODUCTION
682. MISE AU POINT DE DIFFERENTS PROTOCOLES 68
2. 1. Matériel végétal 68
2. 2. Protocoles d'extraction de l'ADN génomique, testés et/ou modifiés 68
2. 2. 1. Protocole de Ouenzar et al. (1998) modifié et adapté au caroubier 69
132. 2. 2. Evaluation de la qualité et de la quantité de l'ADN extraite 69
2. 3. Procédures d'amplification de l'ADN du caroubier par PCR 70
2. 3. 1. Mise au point de la réaction PCR/ISSR 70
2. 3. 1. 1. Mélange réactionnel 70
2. 3. 1. 2. Amplification d'ADN de caroubier par PCR/ISSR 70
2. 3. 2. Mise au point de la réaction PCR/RAPD 71
2. 3. 2. 1. Mélange réactionnel 71
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